Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  213  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62772534--62772571
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0
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1.57
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2.0
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5
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2.0
20
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51
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1.39
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20
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39
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1.31
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0
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0
0
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0.91
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0
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2.2
24
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60
2
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2.2
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83
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33
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2.0
237
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1.8
93
94
0
308
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29
22
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62804876--62805051
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3.8
46
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28
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21
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62810464--62810498
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2.0
18
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5
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0
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18
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69
0
2
28
1.02
62811096--62811149
24
2.2
24
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61
1
9
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1.37
62811215--62811315
47
2.2
44
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17
102
62
1
4
30
1.27
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19
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0
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0
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12.5
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0
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0
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1.31
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0
0
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70
0
0
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63
1
3
31
1.22
62835134--62835412
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2.1
133
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2
391
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21
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1.99
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131
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19
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1.8
176
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3
17.7
3
84
0
52
9
33
1
54
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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2.1
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15
27
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1.95
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66
2.0
66
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6
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1.54
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143
22
23
27
25
2.00
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0
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0
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5
2
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5.4
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15
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17
23
22
36
1.95
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15
100
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0
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0
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1
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1.09
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1.30
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1.12
62917289--62917350
9
7.2
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74
3
3
19
1.10
62917282--62917346
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18
1.13
62917284--62917366
42
2.0
43
83
11
109
74
3
4
16
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62926124--62926158
13
2.7
13
90
0
52
60
2
2
34
1.26
62928150--62928179
12
2.5
12
94
0
51
53
0
3
43
1.17
62932490--62932520
5
6.0
5
92
7
53
19
0
0
80
0.71
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11
3.6
11
82
0
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22
15
5
57
1.57
62937300--62937332
11
2.9
12
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0
0
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18
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0
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60
0
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8
1.27
62944801--62944901
43
2.3
43
91
0
157
28
21
31
17
1.96
62944953--62945033
31
2.5
31
82
4
90
62
18
2
16
1.43
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21
2.1
21
84
8
56
0
46
20
33
1.51
62950960--62951141
9
19.6
9
73
10
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1
13
47
1.50
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2.2
70
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3
220
38
0
12
47
1.47
62950996--62951172
88
2.0
87
91
1
282
38
1
12
46
1.52
62951463--62951530
24
2.8
24
86
8
102
44
7
19
29
1.77
62953729--62953767
19
2.1
19
100
0
78
58
10
0
30
1.31
62953719--62953764
19
2.4
18
86
10
65
52
15
2
30
1.55
62954864--62954898
6
5.8
6
100
0
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48
0
0
51
1.00
62954866--62954905
18
2.2
18
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0
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0
2
45
1.14
62956666--62956701
17
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17
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0
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0
0.92
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6
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6
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15
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0
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0
0.91
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17
2.3
18
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40
4
2
52
1.35
62965891--62965932
22
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21
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4
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50
0
0
50
1.00
62970011--62970066
29
2.0
28
82
10
69
66
0
1
32
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62970018--62970087
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2.4
27
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15
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1
1
34
1.13
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16
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15
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51
63
0
0
36
0.95
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29
3.3
29
73
18
78
61
2
1
35
1.15
62969978--62970188
9
21.9
9
67
19
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1
1
31
1.15
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33
3.3
32
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19
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2
0
32
1.09
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20
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67
2
0
30
1.03
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2.0
15
100
0
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60
6
0
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23
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0
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1.26
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10
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2
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1.11
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2.3
20
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45
0
2
52
1.13
62975662--62975716
28
2.0
28
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7
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27
3
0
69
1.05
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15
2.1
15
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25
0
0
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11
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0
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0
4
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1.17
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3
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3
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50
34
3
3
57
1.35
62977834--62977873
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15
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32
5
5
57
1.42
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3
34.3
3
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17
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32
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2
58
1.36
62977988--62978081
11
8.7
11
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16
65
32
7
1
58
1.33
62978011--62978070
23
2.5
26
82
17
76
35
10
0
55
1.34
62980023--62980052
12
2.5
12
94
0
51
26
23
6
43
1.78
62988329--62989047
147
5.0
144
79
9
703
29
15
21
32
1.95
62988316--62989018
75
9.7
73
79
9
699
30
15
21
33
1.94
62988316--62989018
222
3.2
217
85
6
876
30
15
21
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62989132--62989311
57
3.2
56
85
7
233
30
12
16
41
1.84
62989148--62989312
53
3.0
53
85
7
215
31
12
17
38
1.86
62989228--62989383
84
1.9
83
94
4
278
26
12
24
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1.91
62989349--62989559
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2.4
88
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7
232
30
14
20
34
1.93
62990128--62990152
8
3.1
8
100
0
50
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12
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14
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0
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0
0
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11
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1.35
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32
5
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1.42
62991507--62991566
23
2.5
26
82
17
76
35
10
0
55
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292