Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  31  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8195036--8195074
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8202511--8202580
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2
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0
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0
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0
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16
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0
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0
26
47
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.7
79
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298
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28
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22
1.99
8243971--8244022
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2.4
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28
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3.5
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26
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20
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19
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55
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0
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Entropy
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2.5
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0
79
30
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9
24
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8411844--8411878
13
2.6
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9
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42
11
14
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18
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0
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0.92
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3.0
27
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10
112
19
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0
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0
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8425386--8425476
25
3.6
25
77
5
94
23
24
20
31
1.98
8425744--8425768
12
2.1
12
100
0
50
40
0
8
52
1.31
8427806--8427851
20
2.3
20
81
3
58
28
19
26
26
1.99
8427844--8427980
60
2.3
59
82
8
152
29
20
25
24
1.99
8430335--8430484
67
2.2
66
82
8
169
34
17
28
20
1.95
8432524--8432561
18
2.1
19
85
5
51
28
10
15
44
1.80
8432942--8432984
20
2.2
20
83
8
52
58
4
20
16
1.56
8433522--8433566
11
3.9
11
80
11
54
35
0
2
62
1.08
8433903--8434130
46
5.0
46
90
1
323
39
14
23
21
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8434391--8434437
25
2.0
25
83
8
62
53
4
14
27
1.60
8438797--8438825
14
2.0
15
93
6
51
55
6
13
24
1.63
8440754--8441039
136
2.1
137
94
0
493
32
25
17
24
1.97
8442826--8442961
26
5.2
26
92
0
218
36
23
5
34
1.77
8446226--8446280
27
2.0
28
96
3
103
40
14
20
25
1.90
8458070--8458109
6
6.5
6
85
5
53
15
2
0
82
0.77
8461023--8461051
13
2.2
13
100
0
58
31
0
13
55
1.39
8461789--8461866
38
2.1
38
97
0
147
26
17
19
35
1.94
8467994--8468058
32
2.0
32
93
0
112
33
15
3
47
1.61
8469900--8469929
15
1.9
16
93
6
53
30
0
0
70
0.88
8469912--8469959
19
2.6
18
77
9
51
25
2
2
70
1.09
8470721--8470760
17
2.4
17
83
8
55
17
0
32
50
1.47
8470685--8470748
22
3.0
22
83
2
85
14
0
34
51
1.42
8470760--8470827
26
2.6
26
95
0
118
45
1
13
39
1.52
8470956--8471344
125
3.1
123
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4
451
35
17
17
29
1.93
8473432--8473509
36
2.2
36
88
0
111
29
5
21
43
1.74
8473444--8473516
36
2.0
36
97
0
137
24
5
23
46
1.73
8475024--8475089
30
2.2
30
86
0
87
12
15
40
31
1.83
8475588--8475639
7
7.4
7
86
0
59
57
9
1
30
1.42
8476835--8476882
10
4.6
10
80
10
60
41
0
25
33
1.55
8484330--8484368
20
2.0
20
85
10
53
64
5
2
28
1.28
8484330--8484535
9
21.7
9
68
16
78
62
3
4
29
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8484445--8484501
29
2.0
29
82
6
71
57
0
3
38
1.16
8484459--8484560
36
2.8
36
76
10
100
60
1
2
34
1.23
8484342--8484556
97
2.3
95
80
9
226
60
3
4
31
1.35
8486316--8486385
31
2.3
31
87
0
95
35
11
10
42
1.74
8487410--8487465
25
2.2
26
81
12
71
30
21
10
37
1.87
8493822--8493876
28
2.0
28
82
7
67
38
1
1
58
1.20
8493873--8493908
18
2.1
16
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10
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2
0
25
0.98
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2.5
12
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10
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0
0
32
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17
1.9
18
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52
52
5
20
20
1.67
8496422--8496447
10
2.6
10
100
0
52
26
11
0
61
1.30

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          289   290   291   292