Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  264  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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29
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Period
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Number
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Indels
Score
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30
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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1.98
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3
30
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
76086262--76086347
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30
1.18
76101898--76101969
35
2.1
34
82
12
87
23
15
5
55
1.61
76102348--76102410
30
2.1
30
87
0
90
57
12
4
25
1.55
76115860--76115901
21
2.0
21
95
0
75
28
7
38
26
1.82
76129632--76129870
91
2.7
89
79
3
219
30
14
22
33
1.93
76129633--76129882
90
2.8
90
76
7
213
30
14
21
34
1.93
76131419--76131452
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
76134613--76134637
2
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2
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0
50
52
0
0
48
1.00
76135099--76135171
36
2.0
37
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2
121
15
17
15
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1.76
76136741--76136765
12
2.1
12
100
0
50
8
16
0
76
1.02
76141235--76141268
11
3.0
12
87
12
54
32
0
0
67
0.91
76148509--76148543
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
16
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0
53
41
0
3
54
1.16
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12
2.6
12
94
0
53
74
0
25
0
0.82
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17
2.8
17
93
0
76
40
0
17
42
1.49
76156036--76156066
16
1.9
16
100
0
62
29
12
19
38
1.89
76157189--76157261
32
2.3
30
80
13
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58
4
1
35
1.25
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39
2.0
39
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0
140
43
5
8
43
1.57
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16
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17
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5
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38
0
0
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0.96
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2.2
25
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3
1
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1.27
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14
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0
0
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15
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15
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13
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30
0
0
69
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10
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9
89
10
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40
2
0
56
1.13
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14
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14
100
0
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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2.1
27
100
0
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79
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0
16
0.88
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9
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0
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27
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1.77
76215116--76215156
21
2.0
21
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39
2
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46
1.54
76215595--76215682
33
2.7
33
96
0
158
28
18
20
32
1.96
76219549--76219766
39
5.6
39
93
0
355
12
24
23
39
1.89
76225453--76225492
19
2.1
19
95
0
71
72
0
12
15
1.12
76226370--76226422
13
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16
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21
51
69
1
0
28
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76231537--76231589
13
3.4
16
73
21
51
69
1
0
28
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76243866--76243908
18
2.4
18
88
0
59
58
4
6
30
1.45
76244928--76244985
30
1.9
30
82
6
73
48
0
0
51
1.00
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15
3.3
15
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5
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32
6
0
61
1.21
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24
2.0
24
100
0
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10
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29
2.0
29
100
0
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27
1.80
76245980--76246051
37
1.9
37
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0
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37
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1.9
23
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0
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23
92
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22
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70
52
1
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39
1.37
76254999--76255033
14
2.5
14
86
13
54
31
0
0
68
0.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292