Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  262  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75407831--75407970
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1.00
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3
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1118
28
23
27
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2.9
254
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126
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16
27
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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10
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2.1
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20
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13
33
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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19.8
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91
0
130
6
47
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31
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75578665--75578739
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2.6
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2
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1.9
20
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75628939--75628985
23
2.0
23
100
0
94
42
17
8
31
1.79
75640451--75640483
18
1.9
18
88
11
52
36
0
9
54
1.32
75644994--75645034
14
3.2
14
80
19
54
63
0
0
36
0.95
75645013--75645049
15
2.4
16
86
13
51
64
0
2
32
1.07
75645001--75645037
18
2.1
18
89
0
56
64
0
0
35
0.94
75648881--75648910
15
2.0
15
93
0
51
76
0
6
16
0.99
75650530--75650558
4
7.2
4
100
0
58
24
0
75
0
0.80
75655616--75655668
21
2.7
19
76
21
63
58
1
3
35
1.27
75655684--75655771
19
4.9
17
72
15
54
60
2
2
35
1.22
75655675--75655808
37
3.7
36
76
15
116
61
1
2
34
1.20
75655704--75655808
53
2.0
53
86
3
149
60
0
2
35
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75655675--75655810
27
5.0
27
73
9
109
61
1
2
34
1.20
75655675--75655868
9
21.2
9
68
16
91
62
2
2
32
1.22
75655824--75655868
16
2.6
18
86
10
58
68
4
0
26
1.08
75656147--75656289
9
15.4
9
65
25
59
33
4
0
60
1.23
75656141--75656180
19
2.1
19
86
9
55
20
12
0
67
1.22
75656147--75656225
28
2.7
30
84
9
92
32
6
0
60
1.22
75656184--75656221
19
2.0
19
90
10
60
36
5
0
57
1.21
75656202--75656255
25
2.2
25
82
0
63
35
3
1
59
1.26
75656278--75656323
17
2.9
16
84
15
53
28
2
2
67
1.14
75656324--75656349
12
2.2
12
100
0
52
34
0
0
65
0.93
75656314--75656352
10
3.6
10
83
16
51
30
0
0
69
0.89
75657166--75657198
15
2.1
16
88
5
50
39
3
0
57
1.14
75659683--75659716
18
1.9
18
88
5
52
58
2
0
38
1.13
75677482--75677510
14
2.1
14
93
6
51
13
3
0
82
0.79
75682861--75682904
19
2.4
18
85
7
54
36
0
4
59
1.18
75683266--75683350
31
2.8
31
76
3
75
35
12
11
40
1.80
75683509--75683573
31
2.2
30
83
5
87
46
12
7
33
1.70
75683509--75683574
29
2.3
28
82
10
71
45
12
7
34
1.70
75684106--75684145
20
2.0
20
100
0
80
40
5
35
20
1.74
75687970--75688041
28
2.4
30
77
13
78
36
0
4
59
1.17
75687970--75688044
29
2.5
30
79
14
84
36
0
4
60
1.16
75691162--75691224
31
2.1
30
90
3
99
25
3
12
58
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75699757--75699796
19
2.1
19
85
0
53
40
20
7
32
1.80
75700574--75700656
39
2.1
39
90
0
130
22
18
37
21
1.94
75701792--75701820
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
75701945--75701983
18
2.1
19
90
4
62
38
17
10
33
1.84
75705957--75705993
19
1.9
19
88
0
56
62
0
13
24
1.31
75708192--75708230
21
1.9
20
85
15
53
41
7
7
43
1.62
75709778--75709802
12
2.1
12
100
0
50
8
24
0
68
1.16
75713290--75713326
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2.7
14
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2
13
10
1.21
75723383--75723419
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16
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13
51
64
0
0
35
0.94
75724433--75724457
13
1.9
13
100
0
50
0
8
0
92
0.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292