Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  285  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82216159--82216217
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1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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20
2.0
20
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10
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2.0
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2.0
19
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6.2
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0
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52
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0
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0
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1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.23
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31
2
2
64
1.16
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4
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1.13
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0
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1.17
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0
3
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1.16
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1.91
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19
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1.94
82355853--82356361
79
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75
74
13
388
29
16
19
34
1.93
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13
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1.65
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30
2.1
30
90
6
99
19
9
29
41
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82355993--82356572
255
2.3
249
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6
757
27
16
18
36
1.93
82357241--82357281
14
2.5
17
81
18
52
70
21
2
4
1.18
82357246--82357280
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2.3
16
90
9
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68
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0
5
1.11
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0
0
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58
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2.0
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51
21
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0
0
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2.0
70
98
0
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45
1
16
37
1.56
82404201--82404245
20
2.2
20
84
8
54
42
0
0
57
0.98
82404550--82404610
28
2.2
28
94
5
106
54
1
0
44
1.10
82408072--82408096
4
6.2
4
100
0
50
76
24
0
0
0.80
82413578--82413615
20
1.9
20
84
10
51
44
13
2
39
1.57
82421603--82421671
31
2.3
30
82
9
79
36
11
8
43
1.72
82428570--82428606
19
1.9
20
88
5
58
21
0
10
67
1.21
82428895--82428925
6
5.2
6
100
0
62
83
0
0
16
0.64
82435639--82435663
9
2.8
9
100
0
50
12
0
56
32
1.36
82436344--82436374
11
2.9
11
95
4
55
61
0
0
38
0.96
82436367--82436429
31
2.0
31
84
0
81
39
1
6
52
1.37
82441101--82441138
19
2.1
18
85
14
51
28
5
0
65
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82446327--82446379
24
2.2
25
80
10
65
54
0
1
43
1.11
82456053--82456092
20
2.0
21
85
5
55
10
27
2
60
1.42
82458294--82458332
20
2.0
20
85
10
53
48
2
10
38
1.51
82462848--82462898
21
2.3
22
86
10
68
25
1
3
68
1.17
82462848--82462900
22
2.3
24
81
12
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24
1
5
67
1.22
82464147--82464177
16
1.9
16
93
0
53
45
3
3
48
1.34
82465955--82466093
3
47.3
3
69
17
69
30
3
2
63
1.23
82470227--82470279
23
2.3
23
77
6
54
37
3
9
49
1.53
82486137--82486244
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
82488416--82488476
29
2.3
27
78
16
65
65
1
26
6
1.26
82488805--82488862
22
2.5
23
80
5
64
58
1
0
39
1.08
82488792--82488858
24
2.7
25
78
17
68
58
1
0
40
1.07
82490052--82490090
2
19.0
2
84
5
51
43
2
5
48
1.38
82494622--82494672
24
2.1
24
88
0
75
25
11
33
29
1.91
82496802--82496854
27
1.9
28
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11
65
35
3
3
56
1.35
82499288--82499330
20
2.2
20
83
8
52
51
2
0
46
1.13
82500578--82500617
21
1.9
21
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10
55
15
5
20
60
1.53
82504829--82505225
216
1.9
208
80
8
460
27
13
25
33
1.93
82512451--82512502
22
2.4
21
83
3
59
50
3
0
46
1.20
82523253--82523329
32
2.5
30
81
12
77
23
10
10
55
1.64
82523524--82523593
33
2.2
33
82
7
81
40
1
1
57
1.17
82523663--82523736
13
5.2
13
75
20
60
60
0
0
39
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82523667--82523720
11
5.0
11
78
13
58
62
0
0
37
0.95
82523656--82523734
32
2.4
32
83
10
106
62
0
0
37
0.96
82523660--82523730
34
2.1
34
87
10
101
64
0
0
35
0.94
82523676--82523715
21
2.0
20
85
5
53
67
0
0
32
0.91
82523763--82523794
15
2.1
15
94
0
55
59
0
0
40
0.97
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2.3
17
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4
60
60
0
2
36
1.11
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19
2.2
20
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7
56
66
0
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28
1.11
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2.0
18
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0
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1.59
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16
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53
33
6
0
60
1.23
82529639--82529700
29
2.1
29
82
5
72
29
1
4
64
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          289   290   291   292