Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  255  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73883718--73883833
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4
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0
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0
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5
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1.25
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3
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3
78
0
53
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4
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1.30
73884131--73884179
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4.1
12
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0
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22
6
4
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1.30
73884229--73884287
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2.4
25
100
0
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0
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167
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1.91
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1.90
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2.0
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2.4
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2.1
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1.9
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0
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1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
0
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2.0
23
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1.48
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2.0
23
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3.0
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16
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1.97
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203
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159
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0
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10
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1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.20
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1
0
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1.11
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4
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0
22
0.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73966086--73966110
13
1.9
13
100
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0
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48
1.32
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2.2
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51
0
17
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1.46
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30
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49
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0
0
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0
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0
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0.99
73995310--73995343
18
1.9
18
88
5
52
44
2
2
50
1.32
73995547--73995601
27
2.1
26
83
10
67
47
30
0
21
1.51
73995547--73995597
20
2.5
20
74
0
57
47
33
0
19
1.50
73995765--73995803
14
2.8
14
88
0
51
56
28
0
15
1.40
73996505--73996609
41
2.6
41
92
0
165
29
30
17
22
1.96
73996595--73996673
41
1.9
41
89
0
122
21
22
22
32
1.98
73996781--73996828
15
3.1
15
75
18
53
64
0
10
25
1.25
73996940--73996987
20
2.5
20
86
3
62
66
2
4
27
1.21
73997036--73997067
5
6.2
5
96
3
55
78
0
0
21
0.76
74002333--74002418
43
2.0
43
100
0
172
37
20
13
27
1.91
74010590--74010627
12
3.0
13
84
7
60
68
0
10
21
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74011777--74011815
3
12.7
3
83
5
51
25
2
5
66
1.25
74018814--74018919
26
4.0
25
72
9
68
50
2
14
32
1.57
74019045--74019113
25
2.7
26
80
10
72
59
4
8
27
1.46
74019421--74019474
21
2.5
20
80
11
54
59
0
3
37
1.15
74020995--74021053
5
12.0
5
79
16
70
77
1
0
20
0.85
74021322--74021346
13
1.9
13
100
0
50
44
32
0
24
1.54
74025096--74025136
11
3.7
11
90
6
57
29
2
2
65
1.18
74026451--74026483
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
74027102--74027191
19
4.9
19
90
9
152
36
10
15
37
1.81
74027102--74027198
35
2.7
38
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13
152
37
9
16
37
1.81
74027090--74027191
54
1.9
52
94
4
177
37
10
13
38
1.80
74027102--74027214
19
5.8
22
79
18
87
36
8
15
38
1.79
74027483--74027516
18
1.9
18
88
5
52
29
0
0
70
0.87
74036021--74036311
78
3.7
78
90
2
442
31
18
24
25
1.97
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1.9
89
90
0
268
30
15
28
26
1.96
74036328--74036521
45
4.3
45
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1
264
32
15
27
24
1.95
74036877--74036952
18
4.2
18
79
6
82
42
10
11
35
1.76
74037238--74037272
18
2.0
18
88
5
54
31
0
0
68
0.90
74038870--74038902
12
2.8
12
86
4
50
75
9
0
15
1.03
74039594--74039693
11
9.0
11
77
1
65
57
29
6
8
1.52
74039594--74039688
22
4.3
22
87
1
109
58
27
5
8
1.49
74039613--74039710
44
2.2
44
83
3
126
56
32
5
6
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74039600--74039664
33
2.0
33
81
0
76
60
29
4
6
1.41
74039659--74039754
33
2.8
33
76
3
93
55
33
6
5
1.47
74039629--74039754
22
5.6
22
80
7
112
55
32
6
5
1.48
74039613--74039729
11
10.7
11
76
0
101
55
33
5
5
1.46
74039897--74039932
9
4.0
9
88
0
54
13
41
8
36
1.75
74042739--74042763
13
1.9
13
100
0
50
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0
24
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6
12.7
6
77
13
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18
2
1
77
0.95
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18.0
5
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1
75
1.00
74047723--74047795
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114
17
2
1
78
0.95
74047728--74047815
43
2.0
44
85
12
121
19
3
1
76
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292