Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  284  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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16
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12
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0
50
0
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0.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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2.0
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29
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82045112--82045363
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3.5
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247
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2.2
22
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22
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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(0-2)
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1.84
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1.9
18
94
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31
17
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1
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72
1.14
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58
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10
64
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82098571--82098650
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58
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0
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1.9
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0
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0
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52
0
2
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1.13
82135291--82135349
31
1.9
31
82
6
75
40
5
25
28
1.77
82137650--82137714
34
1.9
33
90
3
103
46
12
13
27
1.79
82138576--82138628
17
3.2
16
75
19
56
24
5
0
69
1.09
82138575--82138628
15
3.3
15
72
18
54
24
5
0
70
1.08
82146985--82147022
17
2.1
19
90
9
62
0
23
0
76
0.79
82150736--82150842
53
2.0
53
96
0
196
42
14
13
29
1.84
82153232--82153283
23
2.3
23
82
0
59
67
3
1
26
1.18
82160468--82160506
21
1.9
21
84
5
53
35
2
12
48
1.55
82160552--82160621
31
2.2
32
85
7
90
57
1
1
40
1.17
82162943--82162993
25
2.1
25
85
3
68
47
1
3
47
1.32
82164873--82164937
30
2.2
29
83
2
76
41
0
12
46
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82172825--82172863
17
2.3
17
86
8
53
17
10
0
71
1.12
82173059--82173115
29
2.0
29
82
6
71
22
10
7
59
1.54
82173357--82173386
11
2.7
11
89
0
51
40
0
0
60
0.97
82177608--82177643
12
3.0
12
95
0
63
27
25
5
41
1.77
82186091--82186466
72
5.2
72
81
6
397
28
17
20
33
1.96
82186180--82186453
143
1.9
139
88
2
404
28
18
22
29
1.97
82187238--82187267
15
1.9
16
93
6
53
80
13
3
3
0.97
82187533--82187571
17
2.3
17
86
8
53
17
10
0
71
1.12
82187801--82187857
29
2.0
29
82
6
71
22
10
7
59
1.54
82188093--82188125
14
2.4
14
90
10
50
39
0
3
57
1.14
82189847--82189886
21
1.9
21
90
10
64
57
7
10
25
1.57
82192836--82192893
23
2.5
23
100
0
116
46
43
3
6
1.47
82193738--82193771
9
3.9
9
92
3
52
14
8
0
76
1.01
82193739--82193788
17
2.8
18
84
6
66
16
6
0
78
0.95
82193757--82193788
13
2.5
13
94
0
55
15
3
0
81
0.82
82193910--82193948
15
2.6
16
88
8
55
41
2
0
56
1.13
82193913--82193953
15
2.5
17
76
19
50
43
2
0
53
1.13
82199279--82199327
20
2.5
19
84
12
64
57
0
2
40
1.10
82199984--82200046
31
2.0
31
84
0
81
33
6
11
49
1.64
82202705--82202766
32
1.9
33
93
3
108
53
0
1
45
1.10
82204800--82204831
15
2.1
16
94
5
57
56
6
6
31
1.49
82207008--82207223
9
23.0
9
63
18
59
58
3
2
36
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82207009--82207076
20
3.5
19
78
9
66
60
4
1
33
1.26
82207052--82207194
67
2.2
66
78
17
154
58
2
2
36
1.27
82207178--82207229
18
3.0
17
77
8
52
57
1
0
40
1.10
82207597--82207642
17
2.7
17
82
0
56
30
0
0
69
0.89
82207600--82207811
10
22.8
9
67
18
73
35
3
2
58
1.29
82207752--82207784
11
3.1
11
86
4
50
42
0
0
57
0.98
82207746--82207817
19
3.8
19
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22
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33
1
1
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1.11
82207748--82207852
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3.8
27
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32
1
1
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1.16
82207948--82208032
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2.0
42
97
0
161
44
9
12
32
1.75
82214145--82214173
15
1.9
15
100
0
58
65
0
0
34
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292