Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  25  of  292  ( 35004 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6443970--6444009
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10
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2
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1.28
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2.2
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36
19
2
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1.65
6445680--6445757
40
2.0
39
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104
37
19
1
42
1.59
6445680--6445867
65
2.9
65
88
4
254
34
20
2
43
1.64
6445656--6445821
13
12.7
13
74
12
135
36
19
2
41
1.64
6446417--6446460
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5.9
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10
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2.0
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2.0
26
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1.92
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2.0
32
100
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30
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1.80
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2.0
26
85
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72
37
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23
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3.2
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23
27
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2.00
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28
22
26
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1.99
6476982--6477111
40
3.2
40
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22
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2.00
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2.0
26
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0
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0
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0
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1.00
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16
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6
53
26
0
0
73
0.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6514537--6514581
18
2.5
19
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7
67
57
4
0
37
1.19
6517341--6517512
95
1.8
95
81
12
219
48
1
3
46
1.26
6517509--6517533
13
1.9
13
100
0
50
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4
0
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1.12
6518252--6518289
19
2.0
19
89
0
58
52
0
0
47
1.00
6518257--6518297
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2.2
19
86
4
57
58
0
2
39
1.11
6518816--6519033
108
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110
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1
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24
1.97
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15
3.7
15
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55
75
0
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1
0.90
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1
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0
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2.5
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10
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0
18
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6520809--6520866
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50
77
0
18
3
0.91
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2.9
18
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20
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32
0
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0
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2.0
22
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4
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1.45
6543797--6543865
7
9.9
7
100
0
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14
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43
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2.7
37
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7
98
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4
5
37
1.41
6546973--6547555
87
6.6
88
74
14
373
36
19
16
28
1.93
6547374--6547412
15
2.6
15
88
8
53
53
5
12
28
1.60
6547219--6547557
187
1.8
181
81
6
421
34
19
17
28
1.95
6547073--6547823
87
8.7
86
73
15
371
36
18
16
28
1.93
6547483--6548189
72
9.3
73
76
13
495
33
19
17
29
1.95
6547390--6548886
162
9.5
155
73
15
632
33
19
17
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6547573--6547802
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86
80
10
258
33
19
15
31
1.93
6547768--6548886
167
7.2
145
71
16
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32
20
18
29
1.96
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2.8
78
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10
268
34
18
17
29
1.94
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93
1.8
93
86
2
247
31
19
20
27
1.97
6548595--6548886
72
3.9
74
86
3
381
31
20
18
29
1.96
6548602--6548886
147
1.9
149
86
2
412
30
21
17
30
1.96
6557733--6557768
12
3.0
12
87
0
54
41
5
27
25
1.77
6557729--6557760
16
1.9
17
93
6
57
40
6
28
25
1.79
6559714--6559814
38
2.8
35
75
8
96
56
3
4
34
1.39
6561007--6561059
26
2.0
28
81
7
65
62
0
5
32
1.19
6561353--6561464
26
4.1
26
77
10
82
57
1
8
33
1.39
6565866--6565903
20
1.9
20
84
10
51
42
13
23
21
1.88
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4.0
46
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4
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39
15
24
20
1.92
6569925--6570100
46
3.8
46
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10
232
20
21
29
28
1.98
6569921--6570092
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1.8
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96
0
317
20
22
30
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1.98
6573045--6573113
15
4.6
15
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0
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11
17
13
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1.64
6573036--6573123
30
3.0
30
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10
17
15
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1.66
6575510--6575685
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10
232
20
21
29
28
1.98
6575506--6575677
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1.8
93
96
0
317
20
22
30
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1.98
6577108--6577151
20
2.2
20
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0
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25
38
27
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1.86
6577114--6577159
20
2.3
20
84
0
56
23
34
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1.92
6581591--6581624
10
3.5
10
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4
52
35
0
0
64
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6591374--6591425
26
2.0
26
100
0
104
19
19
11
50
1.77
6591474--6591523
22
2.3
22
96
0
91
30
12
4
54
1.55
6591718--6591762
10
4.5
11
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15
53
60
0
6
33
1.23
6592845--6592925
34
2.4
34
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92
38
6
3
51
1.45
6592847--6592924
40
2.0
40
82
7
97
38
6
3
51
1.46
6592845--6592931
17
5.1
17
69
9
61
37
5
4
51
1.46
6594069--6594130
25
2.5
24
82
10
81
29
4
0
66
1.12
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100
0
76
50
0
0
50
1.00
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40
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171
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14
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1.93
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20
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20
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15
30
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1.94
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2.2
80
84
2
229
35
13
29
22
1.92
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40
5.1
39
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8
146
36
17
29
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1.92
6605447--6605505
20
3.0
20
69
16
50
37
20
32
10
1.86
6605404--6605598
80
2.4
81
82
8
229
35
17
29
16
1.92
6605949--6605978
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
6607626--6607669
18
2.4
18
81
11
54
47
0
0
52
1.00
6611714--6611784
34
2.1
35
84
5
92
29
21
26
22
1.99
6622186--6622218
16
2.1
16
100
0
66
18
15
18
48
1.81
6628110--6628202
37
2.4
37
81
13
100
38
3
4
53
1.37
6633471--6633512
13
3.2
13
93
3
66
16
23
16
42
1.88
6636382--6636426
20
2.2
20
96
0
81
15
20
35
28
1.93
6640934--6640980
17
2.8
17
80
6
60
21
19
21
38
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6651960--6651984
13
1.9
13
100
0
50
64
4
32
0
1.12
6656717--6656749
16
2.1
16
94
0
57
30
36
6
27
1.81
6666341--6666376
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
6671215--6671239
5
5.0
5
100
0
50
0
0
20
80
0.72
6676201--6676240
19
2.1
19
95
0
71
42
25
2
30
1.68
6676534--6676577
23
1.9
24
86
9
65
36
4
4
54
1.41
6677500--6677528
3
9.7
3
100
0
58
68
0
31
0
0.89
6678337--6678393
27
2.0
30
83
13
75
50
5
10
33
1.59
6678854--6678939
41
2.0
43
95
4
158
33
6
2
56
1.39
6683884--6683935
25
2.0
26
92
3
88
55
0
0
44
0.99
6685284--6685708
104
4.1
104
88
2
586
36
17
19
27
1.94
6685278--6685708
206
2.1
208
87
0
623
35
17
19
27
1.94
6687532--6687604
31
2.4
30
78
15
85
19
5
15
60
1.54
6694510--6694566
7
8.4
7
79
9
57
15
3
0
80
0.84
6694510--6694575
21
2.8
23
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15
73
16
3
0
80
0.84
6695534--6695763
118
1.9
118
90
0
361
24
17
29
28
1.97
6699168--6699375
45
4.6
44
75
3
166
43
12
21
22
1.86
6700322--6700365
17
2.6
17
96
0
79
29
25
22
22
1.99
6708137--6708461
130
2.6
129
82
5
351
33
18
19
28
1.95
6708242--6708490
130
1.9
129
88
2
374
35
18
16
29
1.93
6710951--6711025
35
2.1
34
81
11
89
56
14
2
26
1.52
6710960--6711029
35
2.0
34
91
2
113
60
14
4
21
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6714152--6714198
24
2.0
23
84
12
60
74
0
8
17
1.05
6714866--6715020
85
1.8
84
97
1
292
20
27
23
29
1.98
6717077--6717121
21
2.1
21
91
0
72
15
24
22
37
1.93
6721943--6722012
35
2.0
35
91
5
115
57
12
4
25
1.54
6722794--6722852
27
2.2
26
81
6
64
59
1
5
33
1.29
6722979--6723124
3
48.7
3
71
15
106
62
1
6
29
1.29
6723020--6723118
23
4.6
23
71
15
68
61
2
6
30
1.31
6723019--6723072
20
2.7
20
82
5
65
57
3
5
33
1.40
6725728--6725782
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18.0
3
96
3
101
65
0
34
0
0.93
6728620--6728689
29
2.6
27
82
10
88
35
14
7
42
1.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292