Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  269  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77399923--77399960
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2.6
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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1.94
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217
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23
11
31
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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4.5
136
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11
643
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7
6
28
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77548932--77548989
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1
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1.27
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5
12
10
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1.28
77553690--77554262
238
2.4
237
82
3
729
28
15
23
32
1.95
77554095--77554471
209
1.8
208
84
5
519
27
15
24
32
1.95
77563130--77563185
23
2.4
23
81
0
58
37
26
25
10
1.88
77565677--77565724
17
2.8
17
70
0
51
35
0
0
64
0.94
77565912--77565951
20
2.0
20
90
0
62
20
0
7
72
1.08
77565932--77565977
25
1.9
23
86
8
65
28
0
8
63
1.24
77567448--77567507
26
2.2
28
77
19
74
60
8
5
26
1.47
77569252--77569310
3
20.3
3
72
6
50
28
3
5
62
1.32
77569255--77569310
18
3.2
17
80
7
60
28
3
5
62
1.34
77569372--77569431
26
2.3
26
80
5
68
26
6
5
61
1.42
77569483--77569650
3
56.3
3
75
17
111
28
6
1
63
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77569476--77569545
34
2.1
34
91
0
113
30
4
0
65
1.11
77572284--77572322
20
1.9
21
85
15
55
43
7
10
38
1.67
77584669--77584693
6
4.2
6
100
0
50
16
16
52
16
1.76
77588378--77588406
6
4.8
6
100
0
58
86
0
0
13
0.58
77590793--77590822
15
2.0
15
100
0
60
26
26
0
46
1.53
77592474--77592563
44
2.1
44
95
2
164
33
3
14
48
1.60
77593814--77593857
22
2.0
22
90
0
70
63
0
4
31
1.14
77593903--77593967
31
2.2
31
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5
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30
30
4
33
1.78
77604697--77604721
13
1.9
13
100
0
50
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0
0
52
1.00
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13
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3
0
50
1.19
77604753--77604794
13
2.9
14
80
13
50
54
0
0
45
0.99
77604757--77604793
16
2.3
16
86
13
58
59
0
0
40
0.97
77604827--77604883
15
3.5
15
71
17
51
50
0
1
47
1.11
77605619--77605690
33
2.2
32
82
7
83
51
9
4
34
1.54
77608262--77608315
19
2.8
20
86
13
69
33
0
9
57
1.31
77611273--77611312
20
2.0
20
100
0
80
20
35
20
25
1.96
77611560--77611729
3
57.0
3
78
10
154
65
1
2
30
1.15
77612084--77612165
30
2.7
30
92
3
130
20
2
47
29
1.63
77612088--77612165
17
5.1
17
69
23
64
19
2
48
29
1.62
77612129--77612153
13
1.9
13
100
0
50
16
4
48
32
1.64
77614642--77614711
34
2.0
35
88
2
106
34
10
0
55
1.33
77614649--77614723
34
2.2
34
83
4
89
40
8
1
50
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77621327--77621366
20
2.1
19
86
13
55
35
40
2
22
1.68
77621761--77621935
3
59.0
3
78
12
157
29
3
1
65
1.16
77622053--77622092
14
2.7
16
77
18
50
25
10
10
55
1.64
77622185--77622224
20
2.0
20
95
0
71
25
20
32
22
1.98
77624072--77624290
79
2.8
79
87
0
314
31
22
15
30
1.95
77624266--77624403
40
3.5
40
80
0
132
35
18
13
31
1.90
77627096--77627120
10
2.5
10
100
0
50
24
0
0
76
0.80
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2.0
20
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35
5
5
55
1.44
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1.9
20
88
5
58
48
0
0
51
1.00
77646168--77646196
10
3.0
10
95
5
51
62
0
0
37
0.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292