Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  236  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68526156--68526189
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18
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55
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0
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136
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70
4
0
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1
0
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1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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0
0
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18
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64
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0
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0
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27
1.02
68608092--68608127
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2.6
14
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12
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69
0
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27
1.02
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4.2
13
83
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1
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2.1
20
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100
0
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24
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14
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1.92
68615094--68615212
52
2.3
52
91
0
202
26
21
14
36
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
0
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1.12
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18
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76
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5
11
1.14
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2.3
32
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17
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2.9
11
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64
0
5
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1.17
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13
2.3
13
100
0
60
60
0
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0
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15
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155
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15
29
1.95
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58
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179
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16
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0
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23
1.77
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20
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0
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55
0
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1.77
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18
3.3
18
70
17
61
34
16
9
39
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68650266--68650315
24
2.1
24
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2
6
12
0.98
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46
6.0
46
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3
385
22
22
14
39
1.91
68653685--68653958
92
3.0
92
91
0
424
22
22
14
39
1.91
68656092--68656143
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
68657317--68657428
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16
13
34
1.87
68657317--68657428
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3.1
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0
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35
16
13
34
1.87
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11
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11
0
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100
0
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4
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51
51
6
0
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2.1
55
93
1
190
33
18
12
35
1.89
68669077--68669152
2
38.0
2
100
0
152
50
0
50
0
1.00
68671696--68671774
38
2.1
38
100
0
158
46
15
2
35
1.59
68680127--68680166
2
20.0
2
100
0
80
50
0
0
50
1.00
68686948--68687347
133
3.0
134
87
2
522
36
18
17
27
1.93
68688371--68688439
34
2.0
34
100
0
138
50
5
14
28
1.66
68693580--68693697
58
2.0
58
100
0
236
27
6
10
55
1.58
68696410--68696449
19
2.2
18
90
4
62
42
12
5
40
1.64
68700967--68701056
42
2.1
42
93
0
153
52
13
5
28
1.63
68701081--68701120
19
2.2
18
90
4
62
42
12
2
42
1.56
68716787--68717018
121
1.9
121
94
3
414
40
5
11
43
1.63
68717506--68717556
3
17.0
3
95
0
93
0
33
31
35
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68719059--68719093
16
2.2
16
94
0
61
48
20
11
20
1.79
68726506--68726545
17
2.3
19
79
16
50
45
12
17
25
1.83
68727482--68727519
20
1.9
20
88
0
58
55
2
28
13
1.51
68736156--68736347
40
4.8
40
86
1
242
23
28
22
25
1.99
68736136--68736347
80
2.7
80
90
0
318
25
27
22
25
2.00
68737578--68737606
4
7.2
4
100
0
58
75
0
24
0
0.80
68738370--68738480
47
2.4
47
84
6
154
25
16
23
35
1.95
68742295--68742324
10
2.8
11
90
10
53
26
0
0
73
0.84
68742299--68742325
10
2.7
10
100
0
54
25
0
0
74
0.83
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17
2.3
17
86
4
51
47
2
2
47
1.30
68775094--68775131
17
2.2
18
85
4
51
31
26
5
36
1.79
68775469--68775547
40
2.0
40
92
0
131
29
6
5
59
1.43
68776798--68776982
92
2.0
93
96
1
345
15
11
16
56
1.67
68777845--68777889
21
2.1
21
95
0
81
24
24
15
35
1.94
68783135--68783175
20
2.0
21
85
4
57
41
2
2
53
1.27
68783695--68783744
20
2.4
22
80
16
61
64
0
4
32
1.12
68783904--68783965
30
2.1
30
85
8
83
41
12
8
37
1.73
68784090--68784167
29
2.6
29
79
6
84
50
15
6
28
1.68
68792810--68792839
2
15.0
2
92
0
51
50
3
0
46
1.18
68798263--68798288
3
8.7
3
100
0
52
30
0
0
69
0.89
68808146--68808178
14
2.4
14
95
5
59
36
27
0
36
1.57
68814381--68814414
13
2.6
13
100
0
68
5
17
23
52
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68836594--68836743
42
3.6
42
78
3
113
18
21
14
45
1.85
68839267--68839327
31
2.0
31
100
0
122
29
22
3
44
1.69
68842680--68842725
16
2.8
17
80
12
60
52
0
47
0
1.00
68855268--68855312
23
2.0
23
95
0
81
44
6
13
35
1.70
68857157--68857245
39
2.3
38
77
11
90
35
1
5
57
1.30
68858558--68858589
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
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19
2.1
19
100
0
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15
38
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28
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0
0
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55
60
0
0
40
0.97
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14
2.8
13
88
11
51
23
0
0
76
0.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292