Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  250  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72666935--72667023
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9
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0
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2.2
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0
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2.5
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2
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2.1
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1.9
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0
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11
20
34
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72717693--72717962
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2
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24
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72720112--72720157
16
2.8
17
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13
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1.09
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20.0
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1.00
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2.1
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0
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72725192--72725240
18
2.7
18
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0
53
36
22
22
18
1.95
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17
2.1
17
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22
20
1.97
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11
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72726850--72726900
22
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20
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33
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2.9
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0
33
0
0.92
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4.5
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13
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13.5
151
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2886
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7
28
1.52
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13
4.5
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13
52
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3
26
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13
2.8
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2
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22
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2
3345
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28
1.52
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29
2.0
29
86
6
80
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3
7
22
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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13
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0
36
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14
86
13
52
0
35
0
64
0.94
72755989--72756039
21
2.7
19
85
11
61
0
39
0
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0
0
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2.0
32
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0
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1.78
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2.0
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0
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1.63
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16
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50
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17
1.71
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18
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0
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1.10
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22
13
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1.89
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2.0
135
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22
13
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1.89
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2.2
135
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398
21
22
13
41
1.88
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16
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0
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17
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25
2.0
25
84
4
64
63
8
0
28
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72787809--72787873
25
2.9
23
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15
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66
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1.19
72787835--72787873
19
2.0
20
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62
71
7
0
20
1.10
72787951--72787989
10
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64
5
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1.28
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0
0
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68
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16
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1
230
28
17
28
25
1.97
72825391--72825556
47
3.7
46
80
10
155
29
15
25
28
1.96
72825442--72825601
42
3.7
44
79
12
147
31
14
26
28
1.95
72825485--72825599
42
2.7
42
86
6
153
30
14
26
27
1.95
72835069--72835288
118
1.9
116
91
3
361
42
10
5
41
1.61
72835238--72835281
19
2.3
19
84
0
52
50
9
0
40
1.34
72848781--72848833
18
2.9
18
91
0
79
28
20
15
35
1.93
72848801--72848855
18
3.1
18
91
0
83
30
18
14
36
1.91
72853816--72853859
19
2.4
19
92
3
72
77
9
9
4
1.12
72854025--72854071
19
2.5
20
82
10
62
65
2
31
0
1.04
72858929--72858972
17
2.6
18
78
10
56
34
6
11
47
1.66
72859506--72859645
72
1.9
72
92
0
235
33
21
24
20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72861336--72861377
18
2.5
17
80
7
50
38
0
7
54
1.28
72861507--72862853
144
9.2
145
86
8
1715
28
8
6
56
1.53
72861507--72862853
294
4.6
296
90
4
2052
28
8
6
56
1.53
72862563--72862840
133
2.1
136
85
4
375
28
8
6
56
1.53
72863329--72863380
17
2.9
18
78
15
54
0
36
0
63
0.95
72863410--72863477
3
24.0
3
76
11
72
0
30
0
69
0.89
72863410--72863462
8
6.4
8
84
6
70
0
30
0
69
0.88
72863410--72863474
33
1.9
34
87
3
96
0
30
0
69
0.89
72863419--72863474
17
3.4
17
95
2
96
0
32
0
67
0.91
72868538--72868629
48
1.9
48
95
0
166
42
20
8
28
1.82
72875920--72875970
20
2.7
19
79
11
52
66
1
1
29
1.13
72876338--72876400
23
2.7
23
80
4
65
69
3
1
25
1.12
72877890--72877932
22
2.0
22
90
0
68
37
0
2
60
1.10
72877919--72877973
17
3.1
17
77
12
56
38
1
3
56
1.28
72879922--72879955
17
1.9
18
88
5
52
44
0
0
55
0.99
72880038--72880066
15
1.9
15
100
0
58
13
17
6
62
1.52
72882147--72882203
30
1.9
30
89
7
89
19
7
5
68
1.33
72884058--72884111
17
2.9
19
86
10
85
40
9
14
35
1.78
72884061--72884118
17
3.3
17
77
15
64
41
8
13
36
1.76
72884382--72884438
7
8.0
7
88
3
78
19
0
36
43
1.51
72893126--72893260
25
5.4
25
92
2
218
21
25
20
32
1.97
72893239--72893305
22
3.1
21
79
14
82
14
25
20
38
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72899215--72899804
220
2.7
220
94
0
1036
32
19
21
26
1.97
72899746--72900440
78
8.8
78
86
3
865
32
18
24
24
1.97
72900276--72900502
88
2.5
87
92
4
355
31
16
25
26
1.97
72900454--72900653
45
4.5
46
85
6
259
32
15
28
24
1.95
72901008--72901063
18
3.5
15
81
18
60
37
10
16
35
1.83
72901006--72901084
35
2.2
37
86
13
121
37
10
16
35
1.82
72901006--72901077
19
3.9
19
89
10
123
37
11
15
36
1.83
72901006--72901100
17
4.8
22
84
12
79
36
9
15
37
1.80
72901367--72901400
18
1.9
17
88
5
50
29
0
0
70
0.87
72905903--72905940
18
2.0
20
90
10
62
34
10
18
36
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292