Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   

This is table  288  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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102
4.4
102
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595
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27
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0
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2
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1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
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G
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Entropy
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1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.1
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2
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40
7
13
38
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83257989--83258059
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2
2
38
1.29
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56
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1.30
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0
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4
2
46
1.36
83280576--83280632
28
2.0
29
83
10
73
50
5
0
43
1.24
83281348--83281384
2
18.5
2
100
0
74
51
0
0
48
1.00
83282645--83282721
19
3.8
20
72
19
61
49
3
0
46
1.20
83283868--83283898
3
10.3
3
100
0
62
35
0
0
64
0.94
83289116--83289180
32
2.0
32
100
0
130
36
3
3
56
1.30
83289167--83289229
33
1.9
33
87
6
92
28
1
4
65
1.22
83291241--83291330
44
2.0
44
97
0
171
36
7
22
33
1.83
83296080--83296122
22
2.0
23
81
9
54
53
0
4
41
1.21
83304296--83304329
5
6.8
5
100
0
68
58
0
0
41
0.98
83304799--83304832
2
17.5
2
93
6
61
50
0
0
50
1.00
83306581--83306636
21
2.7
21
82
0
76
32
7
30
30
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83307852--83307884
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2.0
17
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5
59
33
0
0
66
0.92
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24
2.0
24
91
0
76
34
23
14
27
1.94
83312968--83313164
101
2.0
101
83
2
254
42
13
6
37
1.71
83320968--83321011
2
22.0
2
100
0
88
50
0
0
50
1.00
83322678--83322711
2
17.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
83325246--83325272
7
3.9
7
100
0
54
29
14
40
14
1.86
83329311--83329337
2
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2
100
0
54
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0
0
48
1.00
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1.9
16
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0
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9
0
6
83
0.79
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19
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16
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13
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43
2
2
52
1.26
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13
2.2
13
100
0
58
51
17
0
31
1.45
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11
5.0
11
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60
3
0
36
1.15
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45
2.0
45
100
0
184
34
17
15
32
1.91
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105
4.2
104
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5
488
27
23
16
33
1.96
83350770--83351207
210
2.1
210
85
2
585
27
23
15
33
1.95
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2.5
48
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2
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30
1.92
83392962--83392989
6
4.7
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0
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17
0
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1.30
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2.2
17
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0
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45
0
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45
1.32
83398181--83398208
14
2.0
14
100
0
56
21
7
21
50
1.72
83409907--83409938
16
2.0
16
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0
55
65
0
0
34
0.93
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14
2.8
14
80
0
51
51
0
5
43
1.24
83409987--83410041
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2.1
27
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10
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52
1
1
43
1.22
83418055--83418092
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83419274--83419306
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
83425952--83426103
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1.9
80
86
1
214
39
11
9
38
1.75
83431478--83431605
46
2.8
46
89
0
184
20
18
28
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1.96
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35
2.1
35
100
0
144
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52
32
0
0
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0.91
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327
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18
24
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1.90
83454551--83454635
42
2.0
42
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0
152
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2.0
26
100
0
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26
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25
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1.81
83456472--83456527
27
2.1
27
100
0
112
23
12
25
39
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292