Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  251  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72907614--72907651
3
12.7
3
100
0
76
34
31
0
34
1.58
72907780--72907816
12
3.0
13
88
7
51
21
2
0
75
0.92
72914873--72914909
9
4.1
9
92
0
65
45
13
10
29
1.77
72916391--72916816
57
7.5
55
69
17
257
28
16
19
34
1.94
72916333--72916816
112
4.2
113
85
5
625
29
17
19
34
1.95
72916927--72916994
28
2.6
27
82
15
88
23
0
30
45
1.53
72920575--72920635
23
2.7
23
77
7
70
27
11
0
60
1.31
72920627--72920675
21
2.3
20
80
10
53
38
4
2
55
1.31
72920638--72920683
21
2.2
21
84
0
56
32
4
4
58
1.37
72920869--72920920
22
2.3
23
77
6
54
26
19
0
53
1.45
72920922--72920970
21
2.3
22
76
20
59
22
14
0
63
1.30
72920973--72921043
16
4.7
15
74
20
58
23
1
4
70
1.13
72934712--72934741
15
2.0
15
93
0
51
50
0
0
50
1.00
72934853--72934887
16
2.1
17
89
10
54
37
0
0
62
0.95
72940829--72940943
60
1.9
60
90
0
185
51
2
9
36
1.49
72941359--72941452
48
2.0
47
91
2
152
9
20
14
55
1.67
72944131--72944189
14
4.2
14
95
0
100
37
18
8
35
1.81
72945923--72946001
27
2.8
27
75
17
72
31
13
0
54
1.40
72948044--72948109
33
2.0
32
82
8
80
53
3
0
43
1.16
72950061--72950086
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
72950105--72950150
20
2.4
20
82
13
53
45
4
0
50
1.21
72963119--72963147
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72963783--72963807
6
4.2
6
100
0
50
84
0
16
0
0.63
72969339--72969383
22
2.0
22
86
0
63
35
2
0
62
1.08
72970265--72970323
25
2.4
24
81
10
66
27
0
5
67
1.11
72971014--72971084
28
2.5
28
100
0
142
33
52
2
11
1.52
72971087--72971122
18
2.0
18
94
0
63
25
58
0
16
1.38
72971734--72971784
21
2.4
21
83
0
57
25
9
7
56
1.58
72971997--72972240
126
1.9
126
92
0
407
28
15
15
39
1.89
72978274--72978321
13
3.7
14
81
13
59
72
0
27
0
0.84
72979544--72979984
177
2.5
178
89
2
706
30
23
22
23
1.99
72979828--72980288
132
3.5
132
81
6
572
30
23
22
23
1.99
72979810--72980288
265
1.8
265
90
0
771
30
23
22
24
1.99
72979840--72980346
132
3.8
131
80
8
535
31
24
20
23
1.98
72979810--72980378
265
2.1
265
84
5
731
31
23
21
23
1.98
72980341--72980469
44
3.0
44
68
14
122
37
17
19
26
1.93
72980301--72980861
174
3.3
169
80
6
567
32
22
23
21
1.98
72980453--72980861
85
4.8
85
87
3
536
31
23
25
19
1.98
72980301--72980863
87
6.5
86
83
4
507
32
22
23
21
1.98
72981099--72981168
29
2.4
29
90
7
106
32
47
1
18
1.58
72981117--72981183
17
4.2
17
71
21
72
29
47
0
22
1.51
72981566--72981605
10
3.8
11
81
18
50
35
0
0
65
0.93
72981568--72981605
15
2.4
16
79
20
53
34
0
0
65
0.93
72981454--72981594
63
2.2
64
80
11
155
26
4
5
62
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72981565--72981605
14
2.9
15
89
10
61
36
0
0
63
0.95
72982064--72982307
126
1.9
126
93
0
416
28
16
15
39
1.89
72983941--72983981
17
2.5
17
84
4
57
65
4
0
29
1.13
72989095--72989136
21
2.0
21
100
0
84
38
14
9
38
1.78
72989096--72989146
21
2.4
21
90
0
75
33
13
11
41
1.81
72990244--72990284
18
2.3
18
87
8
57
31
19
0
48
1.49
72990387--72990521
39
3.4
39
72
11
107
27
26
20
25
1.99
72990983--72991013
12
2.6
12
94
0
53
0
25
0
74
0.82
72991384--72991431
18
2.6
18
81
12
53
54
2
0
43
1.12
72998422--72998513
18
5.1
18
71
16
73
31
4
3
60
1.32
72998471--72998517
20
2.3
20
89
7
69
36
2
0
61
1.08
72998669--72998708
17
2.2
20
86
13
59
40
0
2
57
1.12
72998889--72998914
7
3.7
7
100
0
52
42
0
0
57
0.98
72999111--72999174
29
2.2
29
82
0
83
28
7
6
57
1.51
73010689--73011406
119
6.0
119
91
2
1098
33
17
18
30
1.94
73010689--73011408
241
3.0
241
93
1
1216
33
17
18
30
1.94
73013062--73013227
35
4.6
35
82
8
190
31
10
24
33
1.90
73013062--73013232
75
2.4
75
85
7
221
31
11
23
33
1.90
73015861--73015912
19
2.8
20
82
8
65
38
3
0
57
1.17
73016064--73016106
20
2.2
19
88
12
61
39
0
2
58
1.11
73016433--73016460
3
9.3
3
100
0
56
32
0
0
67
0.91
73016510--73016574
30
2.2
30
82
0
76
30
9
4
55
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73018074--73018173
31
3.2
30
79
9
94
39
1
2
58
1.16
73018080--73018178
15
6.3
16
68
16
64
37
1
2
59
1.16
73032846--73032882
18
2.1
18
90
10
58
54
0
10
35
1.36
73033429--73033471
19
2.3
19
84
8
52
69
9
0
20
1.15
73033922--73033973
11
4.6
11
76
11
52
28
3
1
65
1.21
73033922--73034002
22
3.9
21
77
15
62
28
2
3
65
1.22
73040901--73040940
21
1.9
21
84
0
53
67
5
0
27
1.11
73041065--73041094
14
2.1
15
93
6
53
0
53
0
46
1.00
73041052--73041104
22
2.4
22
78
12
63
0
54
0
45
0.99
73041656--73041686
13
2.3
14
94
5
55
38
0
9
51
1.35
73044517--73044784
46
5.8
46
91
0
358
41
14
23
20
1.89
73049670--73049705
18
2.0
18
88
0
54
16
11
5
66
1.40
73049729--73049929
3
64.3
3
81
12
228
30
4
0
63
1.22
73050065--73050102
3
13.0
3
94
5
69
31
0
0
68
0.90
73052455--73052485
7
4.4
7
91
0
53
0
9
0
90
0.46
73058383--73058418
19
1.9
19
88
5
56
38
0
5
55
1.23
73058383--73058437
20
2.8
20
84
10
62
40
0
7
52
1.29
73058786--73058811
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
73064067--73064116
18
2.8
18
72
24
52
68
2
0
30
1.01
73069749--73069790
21
2.0
21
100
0
84
47
19
4
28
1.69
73080372--73080440
19
3.8
18
77
11
70
33
4
0
62
1.15
73080372--73080440
28
2.5
28
79
11
79
33
4
0
62
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73080611--73080642
7
4.2
8
92
8
50
87
0
12
0
0.54
73080612--73080638
7
3.9
7
100
0
54
88
0
11
0
0.50
73082316--73082374
20
3.0
20
75
7
59
55
33
1
8
1.40
73082328--73082373
20
2.2
21
92
3
76
67
26
0
6
1.15
73082323--73082375
20
2.8
18
81
10
70
58
35
0
5
1.22
73082673--73082763
17
5.3
16
77
17
85
16
10
0
72
1.11
73082699--73082770
6
11.3
6
73
14
56
15
8
0
76
1.01
73082673--73082773
52
1.9
52
100
0
202
15
9
0
74
1.07
73083904--73083959
20
2.8
20
81
7
53
30
3
8
57
1.47
73084361--73084390
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
73085924--73085979
28
2.0
28
96
0
103
44
0
12
42
1.42
73086293--73086348
25
2.2
26
80
9
69
23
19
19
37
1.94
73086304--73086400
25
4.2
25
79
13
91
20
21
17
40
1.92
73086337--73086402
22
3.1
21
87
8
98
18
24
16
40
1.90
73089442--73089479
19
2.1
19
95
5
69
52
10
0
36
1.36
73095205--73095237
17
1.9
17
88
11
50
69
6
0
24
1.10
73096876--73096922
5
9.4
5
82
17
62
19
0
0
80
0.70
73097650--73097678
4
7.2
4
100
0
58
75
0
24
0
0.80
73109877--73110231
175
2.0
174
94
2
624
40
20
17
22
1.91
73119424--73119457
16
2.1
16
89
10
52
64
0
0
35
0.94
73120829--73120864
18
2.0
18
88
0
54
33
0
2
63
1.08
73127291--73127342
27
1.9
27
84
0
68
55
1
0
42
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73134349--73134387
20
2.0
20
85
5
53
43
0
2
53
1.14
73134955--73135018
31
2.0
31
82
8
76
54
7
3
34
1.45
73146052--73146082
2
15.5
2
93
0
53
48
0
0
51
1.00
73147010--73147059
22
2.3
21
83
10
57
10
56
18
16
1.67
73149041--73149295
131
1.9
131
85
6
356
29
18
17
35
1.93
73155968--73156045
39
2.0
39
100
0
156
28
15
20
35
1.93
73157184--73157211
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
73159429--73159465
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
73170881--73170950
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
73170881--73170962
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292