Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  279  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80410838--80411185
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14
277
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17
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1.91
80411080--80411820
253
3.0
246
83
6
804
28
17
19
34
1.94
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2.0
30
90
6
97
19
9
27
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1.83
80417549--80417598
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21
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2.0
20
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17
0
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71
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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11
28
1.83
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2.0
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2.0
23
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2.8
65
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265
33
15
28
22
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80509480--80509670
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276
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1.95
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0
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13
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17
22
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1.96
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14
2.1
14
100
0
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13
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1.95
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3.1
240
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2
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240
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14
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1.48
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14
3.6
14
81
7
57
20
12
4
64
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80515769--80515796
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2.0
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100
0
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14
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57
1.61
80515804--80515963
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2.2
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1
221
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168
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1.69
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2.0
15
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26
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1.42
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2.5
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61
30
1
1
65
1.14
80518946--80519015
36
1.9
37
91
2
115
34
5
11
48
1.63
80522765--80522790
10
2.6
10
100
0
52
69
0
0
30
0.89
80522778--80522802
13
1.9
13
100
0
50
64
0
0
36
0.94
80524142--80524180
5
7.8
5
85
0
51
20
23
20
35
1.96
80524791--80524837
23
2.0
23
91
0
76
19
38
8
34
1.82
80531164--80531193
6
4.8
6
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4
51
63
0
0
36
0.95
80531164--80531209
13
3.6
13
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11
60
60
0
0
39
0.97
80536738--80536788
13
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13
75
10
50
37
5
19
37
1.76
80537034--80537076
8
5.8
8
83
10
56
48
0
0
51
1.00
80543068--80543124
27
2.1
28
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15
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35
5
3
56
1.39
80552096--80552369
46
6.0
46
89
0
388
22
23
14
39
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80557836--80557922
44
2.0
44
81
4
104
31
17
24
27
1.97
80562987--80563035
26
2.0
24
88
8
71
40
2
4
53
1.32
80565394--80565452
25
2.3
26
77
8
68
47
8
3
40
1.51
80566822--80566863
10
4.2
10
78
9
50
54
2
4
38
1.34
80566823--80566861
19
2.0
20
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5
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56
2
5
35
1.35
80568688--80568721
5
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5
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3
59
20
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17
0
1.34
80570966--80571034
22
3.3
22
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15
65
34
5
13
46
1.67
80570961--80571043
40
2.1
40
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0
139
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7
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1.63
80584501--80584535
14
2.6
14
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4
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0
0
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2.2
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100
0
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3
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0
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28
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3
34
1.73
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24
2.2
24
100
0
106
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9
15
37
1.79
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10
4.7
10
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20
55
77
0
14
8
0.99
80597734--80597781
20
2.3
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10
64
77
0
14
8
0.99
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30
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1.77
80616836--80616938
27
3.6
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44
0
1
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1.18
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25
2.0
25
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0
22
8
1.13
80619491--80619515
7
3.6
7
100
0
50
36
0
0
64
0.94
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20
2.2
20
84
8
54
52
2
0
45
1.13
80627375--80627425
24
2.2
24
82
10
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52
3
3
39
1.38
80635733--80635770
3
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0
58
34
28
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2
1.71
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32
2.0
31
90
6
101
19
12
25
42
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80639724--80639758
3
11.7
3
100
0
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34
0
0
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0.93
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100
0
58
65
0
0
34
0.93
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18
2.1
18
89
0
56
67
0
0
32
0.91
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12
2.1
12
100
0
50
52
0
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1.44
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21
2.5
20
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17
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5
1
23
1.20
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25
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1.34
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0
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1.48
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29
27
16
25
1.97
80690650--80690702
19
2.9
18
85
2
70
73
3
1
20
1.08

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292