Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  275  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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70
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32
2.4
31
80
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78
56
9
9
25
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79214972--79215034
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3
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57
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0
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1.00
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20
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0
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1.20
79263330--79263374
15
2.9
17
78
21
55
42
0
0
57
0.98
79279554--79279590
19
1.9
19
89
10
58
37
0
2
59
1.12
79299904--79299937
14
2.3
15
90
5
52
52
2
2
41
1.31
79303557--79303589
15
2.2
16
89
10
52
51
3
0
45
1.16
79312710--79313113
46
8.8
46
91
2
562
41
13
23
21
1.89
79314326--79314355
15
2.0
15
93
0
51
43
6
10
40
1.64
79318260--79318312
18
2.8
19
86
8
65
58
3
3
33
1.34
79318534--79318574
20
2.0
22
90
9
68
36
0
0
63
0.95
79318525--79318574
23
2.2
22
83
16
59
36
0
0
64
0.94
79319465--79319523
28
2.0
28
90
6
91
35
8
3
52
1.49
79320635--79320667
12
2.8
12
86
4
50
33
0
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79320792--79320854
30
2.1
30
96
0
117
57
12
3
26
1.51
79320884--79320925
22
1.9
22
85
0
57
54
9
14
21
1.68
79323967--79324025
30
2.0
30
100
0
118
32
20
13
33
1.91
79324579--79324618
21
1.9
21
85
10
55
45
2
7
45
1.45
79336421--79336448
3
9.3
3
100
0
56
67
0
0
32
0.91
79339750--79339784
19
1.9
17
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11
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25
2
5
65
1.28
79339750--79339790
18
2.2
19
83
12
50
26
2
7
63
1.33
79344364--79344404
9
4.8
9
91
8
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9
7
0
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0.83
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18
7.0
18
70
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55
15
8
2
73
1.17
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18
2.7
17
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9
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29
4
0
66
1.10
79344510--79344563
22
2.5
21
82
8
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38
0
1
59
1.08
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22
3.2
20
75
22
59
42
0
2
54
1.15
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23
3.9
23
75
14
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42
0
2
55
1.12
79344596--79344666
37
1.9
36
85
2
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45
1
4
49
1.30
79345334--79345422
10
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9
72
11
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52
2
1
43
1.20
79345334--79345422
19
4.7
18
73
12
63
52
2
1
43
1.20
79345324--79345436
29
3.9
28
76
5
109
53
1
1
42
1.21
79345392--79345481
35
2.7
34
78
14
98
53
1
1
44
1.15
79348114--79348194
40
2.0
40
95
4
146
25
19
34
19
1.96
79348437--79348464
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
79349595--79349723
44
2.8
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4
152
34
13
24
27
1.93
79356945--79357073
44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79358904--79358980
30
2.6
30
91
0
118
27
23
22
27
1.99
79364557--79364622
26
2.4
27
78
14
73
42
1
4
51
1.31
79365005--79365145
24
6.0
22
67
17
63
56
2
0
39
1.19
79365034--79365144
37
3.1
36
76
12
115
58
1
0
38
1.15
79365005--79365093
24
3.7
23
73
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53
4
0
41
1.21
79365105--79365185
22
3.6
22
77
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56
1
0
41
1.07
79365105--79365200
22
4.3
21
71
20
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1
0
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0
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1.99
79370209--79370363
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43
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0
265
11
24
32
30
1.91
79370723--79370812
42
2.1
45
83
8
123
28
21
25
24
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292