Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  266  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76599916--76599948
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0
0
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0
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20
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0
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0
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0
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0
0
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0
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2.2
22
82
7
64
59
0
8
32
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
29
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0
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76651117--76651151
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2.2
16
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0
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2
0
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1.14
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56
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0
0
40
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2.2
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10
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2.0
21
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21
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0
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88
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0.62
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221
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14
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0
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17
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19
33
1.95
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2.1
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258
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4.2
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825
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19
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1.95
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30
13
5
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1.65
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1.8
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2.1
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76681315--76681350
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17
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0.59
76681317--76681350
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2.9
11
91
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2
8
0
0.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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58
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4
65
1.31
76684218--76684306
33
2.7
33
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119
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6
4
62
1.39
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23
1.9
23
90
0
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34
1.70
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2.2
25
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94
38
0
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1.41
76687880--76687936
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2.2
25
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0
0
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35
1.55
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1.22
76702994--76703072
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2
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1.33
76719635--76719667
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0
0
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0.92
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4.3
49
75
18
151
33
5
4
57
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76719663--76719772
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4.6
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56
1.44
76719855--76719929
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3.0
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5
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61
1.36
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1.9
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41
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56
1.10
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2.5
27
80
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82
37
4
3
54
1.36
76720139--76720254
12
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12
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58
1.32
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24
2.6
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35
3
6
54
1.41
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3.2
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30
3
1
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1.20
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4
1
64
1.22
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0
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1.80
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20
0
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16
2.1
16
89
5
52
48
14
0
37
1.44
76736680--76736743
33
1.9
33
93
0
110
28
40
9
21
1.84
76740912--76740954
18
2.4
18
81
11
52
65
4
0
30
1.13
76743581--76743605
13
1.9
13
100
0
50
60
0
0
40
0.97
76747022--76747060
20
2.0
20
85
10
53
46
2
2
48
1.29
76748515--76748563
20
2.6
18
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15
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0
4
44
1.20
76751447--76751528
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7
1
26
1.27
76753924--76753950
2
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2
100
0
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0
0
48
1.00
76756985--76757028
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20
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0
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11
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1.52
76756991--76757034
20
2.2
20
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0
52
27
9
9
54
1.62
76758621--76758652
5
6.6
5
92
7
57
81
0
0
18
0.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76758622--76758652
9
3.3
9
95
4
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0
0
19
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30
2.0
31
84
9
83
58
9
1
30
1.40
76769431--76769475
21
2.1
21
100
0
90
28
4
20
46
1.69
76770461--76770801
170
2.0
171
85
2
461
30
16
19
33
1.94
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3
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3
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0
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0
0
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0.91
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4
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1
1.08
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22
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4
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2
1.10
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37
2.2
37
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1
1.08
76771760--76771840
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1
1.08
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1.90
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11
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1.90
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2.0
35
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2
106
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30
1.92
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2.4
75
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212
32
11
23
33
1.90
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35
4.6
35
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33
1.90
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2.3
28
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50
1
0
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1.10
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89
32
0
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1.18
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19
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39
0
0
60
0.97
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23
2.2
23
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13
59
60
2
4
34
1.27
76819375--76819413
2
19.5
2
89
0
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46
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2
48
1.29
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124
2.5
126
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5
374
25
17
18
38
1.93
76820290--76820596
127
2.5
124
83
5
352
25
17
18
38
1.93
76822621--76822649
13
2.1
14
93
6
51
27
0
3
68
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76827356--76827392
18
2.1
18
89
0
56
13
13
18
54
1.71
76829931--76829961
2
15.5
2
93
0
53
48
0
0
51
1.00
76829968--76830022
25
2.3
23
78
12
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3
16
36
1.65
76830198--76830244
25
2.0
23
84
16
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48
6
6
38
1.54
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20
2.0
20
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4
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62
5
0
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1.17
76830424--76830486
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3.3
18
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1
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33
1.21
76830633--76830707
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2.5
30
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23
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0
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1.14
76832662--76833360
89
8.4
84
74
13
449
34
19
15
30
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292