Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  280  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80690837--80690929
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1.11
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2.2
20
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1.10
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20
2.9
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36
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60
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80696636--80696678
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0
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2.2
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0
100
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1.9
18
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5
63
72
0
0
27
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80755112--80755224
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2
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1.17
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0
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12
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1
4
30
1.22
80798622--80798708
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3.4
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20
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2.2
23
85
11
64
55
29
2
12
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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14
23
22
1.90
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14
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54
1.9
54
82
7
122
37
3
3
55
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80848786--80848854
21
3.4
21
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1
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15
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1.9
14
100
0
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15
35
1.94
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9
4.4
9
80
12
53
28
0
2
68
1.03
80872011--80872048
20
1.9
20
88
0
58
13
23
26
36
1.91
80872938--80872996
21
2.8
22
85
7
70
23
0
6
69
1.12
80872967--80873026
26
2.4
24
83
8
75
28
0
3
68
1.05
80881304--80881355
9
5.7
9
76
13
52
36
1
0
61
1.07
80881429--80881462
16
2.1
16
88
0
50
70
0
8
20
1.13
80887880--80887921
21
2.0
21
85
0
57
42
33
2
21
1.66
80888343--80888378
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
80889165--80889245
29
2.8
29
83
5
101
46
2
3
46
1.33
80912324--80912367
21
2.1
21
83
8
54
38
6
4
50
1.50
80915879--80915935
30
1.9
30
85
7
80
38
8
24
28
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80920556--80920675
35
3.4
35
88
0
177
30
11
26
30
1.92
80920556--80920718
70
2.3
70
80
2
175
30
11
25
33
1.91
80922747--80922900
47
3.3
47
81
8
170
25
14
27
32
1.95
80925580--80925648
35
2.0
35
91
0
111
28
26
17
27
1.97
80927646--80927689
21
2.1
21
87
8
63
34
9
4
52
1.54
80929580--80929656
4
18.8
4
76
5
64
66
3
24
5
1.30
80930419--80930529
47
2.4
47
84
6
154
25
16
23
35
1.95
80931947--80931996
25
2.0
25
92
7
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38
20
28
14
1.91
80940947--80940991
22
2.0
21
83
12
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60
4
0
35
1.17
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15
4.4
16
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19
54
66
1
0
31
1.01
80947579--80947632
27
2.0
27
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3
92
44
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0
40
1.46
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31
2.6
31
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0
101
41
7
3
47
1.49
80947846--80947880
19
1.9
18
88
11
54
28
2
2
65
1.21
80950408--80950444
18
2.1
18
89
0
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37
48
5
8
1.56
80950470--80950515
6
7.5
6
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13
58
78
4
0
17
0.91
80950481--80950517
19
1.9
19
88
0
56
75
8
0
16
1.02
80950544--80950598
27
2.0
27
82
0
65
27
7
12
52
1.65
80954152--80954191
19
2.0
19
85
9
53
60
2
0
37
1.11
80961230--80961273
9
4.9
9
81
10
54
45
0
2
52
1.13
80961243--80961285
19
2.3
19
92
4
70
39
0
4
55
1.20
80965778--80965925
60
2.4
62
80
4
165
41
13
19
25
1.88
80972006--80972059
20
2.7
19
74
5
54
59
1
5
33
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80974723--80974755
2
16.5
2
100
0
66
51
0
48
0
1.00
80975865--80975894
13
2.4
13
94
5
53
40
0
0
60
0.97
80986779--80986840
31
2.0
32
84
9
83
48
1
8
41
1.42
81000663--81000709
24
2.1
23
85
14
64
65
0
0
34
0.93
81005139--81005171
17
1.9
17
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0
57
33
21
9
36
1.85
81005510--81005548
17
2.4
17
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12
55
61
0
5
33
1.18
81006500--81006629
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2.7
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12
129
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1.54
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3.7
7
100
0
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0
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0
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1.80
81011461--81011497
20
1.9
18
89
10
56
45
0
18
35
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292