Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  292  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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84818641--84818734
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1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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1.11
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13
2.6
13
90
0
50
14
0
32
52
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84982208--84982331
50
2.5
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2
187
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16
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1.95
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0
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29
11
1.90
85001070--85001713
322
2.0
322
98
0
1236
40
19
15
24
1.90
85014293--85014335
21
2.0
21
95
0
77
23
20
16
39
1.92
85015043--85015224
90
2.0
90
97
0
346
20
13
18
47
1.82
85021467--85022187
360
2.0
356
88
3
1063
36
13
17
32
1.89
85025530--85025680
78
1.9
78
87
2
223
27
22
23
26
2.00
85033686--85033824
69
2.0
69
92
0
233
28
31
12
27
1.92
85034929--85035052
33
3.8
33
93
0
212
16
8
43
30
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292

The End!