Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  218  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64014295--64014434
74
1.9
75
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3
219
27
23
20
28
1.99
64014499--64014664
72
2.3
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4
235
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20
15
22
1.89
64014664--64014927
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3.7
71
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4
356
37
22
14
25
1.92
64014664--64014927
71
3.7
69
84
4
339
37
22
14
25
1.92
64014962--64015185
71
3.1
70
84
6
308
38
22
14
25
1.91
64014502--64015609
257
4.3
257
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1
2047
36
22
14
25
1.93
64015220--64015442
70
3.1
70
85
5
315
38
21
14
25
1.91
64014502--64015609
515
2.1
516
96
2
2062
36
22
14
25
1.93
64020645--64020680
12
3.0
12
95
0
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41
5
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2.1
38
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5
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5.2
6
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16
13
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64033432--64033461
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2.6
12
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5
53
16
13
0
70
1.18
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1.9
26
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1.21
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0
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0
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0
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0
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53
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18
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26
36
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1.85
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2.1
21
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0
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0
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64076671--64076705
2
17.5
2
100
0
70
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64079879--64080125
131
1.9
131
81
0
296
28
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16
36
1.93
64091081--64091240
3
53.7
3
98
1
313
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0
33
0
0.92
64092126--64092401
133
2.1
133
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2
367
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21
25
25
1.99
64092764--64092789
9
2.9
9
100
0
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11
0
7
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131
4.9
131
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5
459
27
19
18
35
1.95
64097100--64097210
44
2.5
45
80
14
124
31
19
20
27
1.97
64097278--64097861
44
13.3
44
67
12
288
22
23
20
33
1.97
64097175--64097874
88
8.0
88
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1
841
22
23
20
33
1.97
64097190--64097874
175
3.9
175
88
2
910
22
23
20
33
1.97
64097175--64097868
263
2.6
262
85
1
895
22
23
20
33
1.97
64105242--64105311
35
2.0
34
97
2
131
17
48
10
24
1.77
64105718--64105785
15
4.6
14
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61
19
5
13
1.51
64105715--64105787
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2.3
32
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4
94
64
17
5
12
1.45
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11
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0
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2
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2
79
10
57
40
0
7
52
1.28
64106829--64106867
2
19.5
2
89
0
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46
2
2
48
1.29
64118962--64119548
70
8.2
70
92
5
978
32
15
20
31
1.94
64118962--64119910
216
4.3
218
85
11
1261
30
16
20
32
1.95
64118962--64119548
146
4.1
140
92
5
978
32
15
20
31
1.94
64119671--64119699
14
2.1
14
100
0
58
13
13
6
65
1.45
64119548--64119774
91
2.6
86
83
7
285
24
19
21
34
1.96
64119686--64120034
72
4.7
72
88
5
470
30
16
20
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64120349--64120447
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45
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3
103
38
17
15
29
1.90
64120759--64120829
35
2.0
35
91
0
115
18
43
11
26
1.83
64121231--64121306
32
2.4
31
81
12
91
63
17
6
13
1.50
64121233--64121306
33
2.3
33
83
6
89
63
17
5
13
1.47
64121269--64121304
14
2.5
15
90
4
56
63
11
5
19
1.46
64121560--64121609
11
4.5
11
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0
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2
70.0
2
69
16
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38
4
5
50
1.47
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22
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23
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38
0
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1.30
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5
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0
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0
0
18
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10
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0
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31
1.46
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2.4
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0
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1.47
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20
2.0
20
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212
65
1
2
31
1.14
64131167--64131240
4
19.0
4
83
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53
13
4
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75
1.14
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19
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18
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0
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5
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1.19
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18
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0
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11
17
31
1.85
64135112--64135155
18
2.5
17
85
7
52
38
15
13
31
1.87
64136626--64136668
21
2.0
21
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0
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23
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1.75
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145
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707
32
16
20
30
1.95
64140052--64140688
44
13.6
45
65
18
180
32
16
20
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64141907--64141931
5
5.0
5
100
0
50
20
0
0
80
0.72
64142201--64142263
4
16.0
4
78
3
56
20
4
3
71
1.18
64145097--64145147
25
2.1
25
82
10
61
54
0
5
39
1.24
64148282--64148332
25
2.0
26
84
3
68
23
3
3
68
1.23
64158905--64158957
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18
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0
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30
28
16
24
1.97
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5.8
43
67
18
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33
16
26
23
1.96
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175
3.5
175
80
6
709
30
18
24
26
1.98
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179
3.6
175
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7
696
30
18
23
26
1.98
64170633--64170682
25
2.0
25
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7
66
22
4
4
70
1.21
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21
2.6
21
94
0
92
34
3
34
27
1.74
64180572--64180656
43
1.9
45
81
9
104
32
14
29
23
1.94
64180465--64181088
176
3.5
174
79
7
702
30
18
24
26
1.98
64182517--64182567
26
2.0
27
84
7
70
21
3
3
70
1.20
64194747--64194968
48
4.6
48
77
5
216
28
20
29
22
1.98
64200887--64200936
22
2.3
21
83
16
66
56
4
6
34
1.43
64201513--64201539
14
1.9
14
100
0
54
37
7
11
44
1.68
64202927--64202984
12
5.1
12
82
17
61
32
0
5
62
1.18
64205768--64205801
16
2.1
16
88
0
50
41
0
2
55
1.15
64207221--64207269
23
2.1
23
81
7
55
38
6
0
55
1.25
64208519--64208548
11
2.7
11
100
0
60
63
16
20
0
1.31
64209578--64209622
18
2.7
16
83
16
56
33
2
0
64
1.06
64216178--64216217
20
2.0
20
95
0
71
42
15
12
30
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64216710--64217191
131
3.7
131
89
0
712
29
21
22
26
1.99
64217181--64217364
88
2.1
88
88
0
269
34
20
22
22
1.96
64217196--64217392
88
2.2
87
81
3
223
35
21
19
23
1.96
64217469--64218069
44
13.5
44
69
9
209
31
18
22
28
1.97
64217641--64217842
89
2.3
90
84
2
255
33
17
22
26
1.96
64217692--64217835
45
3.2
45
68
8
114
35
17
20
27
1.94
64217730--64218065
133
2.5
133
80
3
352
29
17
24
28
1.97
64220165--64220193
14
2.0
15
93
6
51
24
0
0
75
0.80
64221581--64221732
53
2.8
53
92
1
259
36
15
11
36
1.84
64223548--64223575
14
2.0
14
100
0
56
50
14
7
28
1.69
64224904--64225059
43
3.7
42
79
7
154
33
24
16
25
1.95
64224973--64225059
42
2.0
43
86
2
122
36
25
13
24
1.92
64229907--64229931
10
2.5
10
100
0
50
48
8
16
28
1.74
64232114--64232193
41
2.0
41
94
0
142
16
15
30
38
1.89
64238555--64238585
11
2.8
11
100
0
62
29
0
6
64
1.18
64242224--64242274
20
2.5
20
78
6
59
47
9
9
33
1.70
64247409--64247456
22
2.2
22
82
14
55
68
2
8
20
1.26
64250766--64250877
54
2.1
54
81
3
127
16
21
22
40
1.91
64258593--64258699
27
3.9
26
80
13
110
15
23
22
38
1.93
64258593--64258700
54
2.0
54
85
7
148
15
23
22
38
1.92
64264780--64264968
55
3.5
53
81
5
209
23
23
18
34
1.96
64273577--64273670
27
3.4
27
64
8
73
25
17
9
47
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64273573--64273683
55
2.0
55
98
0
213
28
15
9
46
1.76
64278933--64279196
40
6.7
40
88
5
344
26
26
21
24
1.99
64278933--64279196
118
2.2
122
86
6
371
26
26
21
24
1.99
64287100--64287353
40
6.7
39
82
11
289
25
26
22
25
2.00
64287093--64287301
74
2.8
76
82
10
252
25
27
21
25
1.99
64289692--64289725
17
1.9
17
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5
50
14
44
29
11
1.81
64300357--64300383
13
2.1
13
100
0
54
14
25
37
22
1.93
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2.0
61
88
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183
27
30
17
25
1.97
64320850--64320881
14
2.4
13
90
10
55
18
6
12
62
1.50
64326569--64326606
19
2.0
20
84
5
51
23
0
2
73
0.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292