Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  263  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75724946--75725020
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.61
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2.3
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5
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24
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23
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
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Entropy
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0
0
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100
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2.6
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99
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0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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17
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0
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0
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0
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1.03
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3.0
12
87
4
54
31
2
0
65
1.07
75931921--75931986
27
2.4
27
89
0
105
31
19
25
22
1.98
75931871--75932143
25
10.8
25
71
13
134
32
18
27
21
1.97
75932469--75932511
21
2.0
21
86
0
59
44
23
0
32
1.54
75936384--75936551
35
4.6
35
85
7
185
33
23
10
32
1.89
75936379--75936551
75
2.4
73
83
9
210
33
23
10
32
1.89
75937938--75937966
13
2.1
14
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51
51
0
3
44
1.18
75941339--75941473
39
3.4
39
74
11
116
28
27
20
23
1.99
75941640--75941669
16
1.9
15
93
6
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40
20
0
40
1.52
75943044--75943074
5
6.0
5
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7
53
61
0
0
38
0.96
75959384--75959419
13
2.8
14
84
16
51
27
25
0
47
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75959371--75959411
18
2.2
19
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12
59
29
24
0
46
1.53
75959575--75959659
21
4.0
21
80
4
80
38
25
21
14
1.91
75959573--75959647
21
3.5
22
83
7
91
38
26
21
13
1.90
75960030--75960087
15
3.8
15
86
2
80
53
12
0
34
1.38
75960033--75960091
30
2.0
28
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11
0
30
1.35
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2
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2
100
0
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50
50
0
0
1.00
75960270--75960313
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2
90
4
72
50
0
0
50
1.00
75961098--75961122
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1.9
13
100
0
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0
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0.92
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2.0
68
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0
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6
22
28
1.78
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2.5
14
90
4
54
30
0
2
66
1.06
75978462--75978492
14
2.1
15
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29
0
0
70
0.87
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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15
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31
4
4
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1.36
75980636--75980664
14
2.0
15
93
6
51
55
0
0
44
0.99
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9.2
398
80
6
2514
38
12
13
35
1.83
75982852--75985551
407
6.6
402
82
5
3091
38
12
13
35
1.82
75984563--75984588
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
75986768--75986979
103
2.1
101
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1
298
43
10
8
37
1.70
75989375--75989428
26
2.2
25
87
12
85
3
1
29
64
1.21
75990249--75990310
30
2.1
30
87
6
90
41
30
9
17
1.82
75990292--75990563
77
3.5
76
82
7
339
33
19
17
29
1.95
75990292--75990585
79
3.7
77
82
7
367
35
18
17
28
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75990590--75991048
74
5.9
76
73
15
255
30
22
18
29
1.97
75990426--75991047
169
3.8
166
85
8
814
31
21
18
29
1.97
75990758--75991047
74
3.9
73
86
8
404
29
23
17
29
1.97
75990759--75991047
150
1.9
152
92
3
485
29
23
17
29
1.97
75991016--75991121
54
1.9
54
85
9
144
37
19
14
28
1.91
75990975--75991494
140
3.8
138
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748
37
21
16
25
1.93
75991156--75991261
54
1.9
54
83
9
135
36
19
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1.92
75991250--75991590
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470
39
20
15
24
1.91
75991470--75991642
70
2.5
70
84
5
201
34
23
14
28
1.94
75995980--75996360
68
5.5
70
76
12
331
29
21
17
32
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292