Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  1  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4442--4482
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22
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6230--6283
19
2.7
19
91
8
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40
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27
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1.81
6690--6747
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1.9
30
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20
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2.2
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0
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2.0
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0
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2.3
24
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0
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100
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2.0
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100
0
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2.0
23
95
0
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10.5
4
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0
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27257--27321
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2.0
32
100
0
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3
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2.0
33
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0
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2.0
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2.9
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21
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4
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20
0
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1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.2
32
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5
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1.77
56634--56689
16
3.4
16
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11
60
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3
21
32
1.70
57204--57238
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1.9
18
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0
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34
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6.1
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2.0
120
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10
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2.3
30
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0
26
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0
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2.3
16
100
0
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24
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146
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26
10
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3.3
126
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1
563
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17
28
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2.1
30
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0
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42
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7.5
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7
17
12
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1.53
79707--79842
33
4.3
33
80
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185
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13
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64
9
16
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1
131
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11
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2.0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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T
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0
0
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18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
84606--84640
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
84726--84760
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
84996--85031
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2.2
16
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0
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0
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2
3
40
1.33
102221--102298
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30
84
11
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52
2
3
41
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133
2.0
133
98
0
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14
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0
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2.0
22
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0
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15
2
33
1.57
127588--127640
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2.4
22
87
0
79
47
16
1
33
1.58
132705--132840
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3.5
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8
157
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12
22
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167956--167992
18
2.1
18
90
10
58
51
2
16
29
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
175404--175510
53
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55
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7
157
30
27
14
27
1.95
175459--175546
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2.0
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0
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28
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1.99
176964--177052
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0
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17
21
35
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1.95
179659--179697
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17
86
13
53
33
0
20
46
1.51
179922--180019
23
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23
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20
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26
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1.98
179924--180012
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2.0
45
95
0
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19
22
26
31
1.97
187228--187324
22
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23
92
2
162
20
21
26
30
1.98
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2.0
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0
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0
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13
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22
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95
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9
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1.71
263302--263359
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10.8
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0
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12
4.5
12
81
16
69
42
0
1
55
1.10
264676--264714
18
2.1
19
85
4
53
38
0
10
51
1.36
264954--265088
39
3.4
39
75
6
103
23
19
28
28
1.98
277014--277081
33
2.1
33
86
8
95
52
11
4
30
1.57
278676--278731
18
3.1
18
92
0
94
26
23
17
32
1.97
287509--287545
18
2.1
18
94
0
65
10
24
35
29
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
288048--288079
15
2.3
15
89
10
50
6
12
6
75
1.19
303156--303189
3
11.3
3
100
0
68
67
0
0
32
0.91
319283--319460
27
6.6
27
81
3
187
26
14
28
29
1.95
319283--319460
54
3.3
54
84
3
223
26
14
28
29
1.95
328671--328848
27
6.6
27
81
3
187
26
14
28
29
1.95
328671--328848
54
3.3
54
84
3
223
26
14
28
29
1.95
333245--333285
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
335383--335908
46
12.0
46
86
9
751
22
24
15
37
1.93
335427--335908
84
5.5
86
87
10
646
23
24
15
36
1.93
335383--335908
130
4.0
130
93
2
847
22
24
15
37
1.93
338822--338881
30
2.0
30
87
6
86
36
8
26
28
1.85
339303--339479
47
3.8
47
79
12
211
22
20
28
29
1.98
345575--345720
73
2.0
73
100
0
292
30
15
10
43
1.80
356305--356342
19
2.0
19
85
10
51
39
0
10
50
1.37
357715--357743
15
1.9
15
100
0
58
27
17
34
20
1.95
360144--360391
50
4.8
50
85
5
302
20
29
23
26
1.99
360143--360391
100
2.4
104
87
7
348
20
29
23
26
1.99
360486--360517
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
360729--360785
30
1.9
29
85
3
78
31
24
1
42
1.65
375333--375420
45
2.0
45
93
0
149
25
20
28
26
1.99
375369--375475
53
2.0
55
87
7
157
27
14
27
30
1.95
382829--382916
45
2.0
45
93
0
149
25
20
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
382865--382971
53
2.0
55
87
7
157
27
14
27
30
1.95
385552--385596
19
2.4
18
86
13
65
0
33
0
66
0.92
385807--385846
20
2.0
20
100
0
80
45
5
0
50
1.23
389550--389574
11
2.3
11
100
0
50
16
16
0
68
1.22
402233--402300
30
2.3
30
97
0
127
33
5
0
60
1.21
403359--403411
27
2.0
27
82
14
65
47
11
1
39
1.50
403390--403471
41
2.0
41
100
0
164
46
12
4
36
1.63
407090--407149
31
1.9
31
82
0
75
43
21
13
21
1.87
422455--422497
19
2.1
21
87
8
63
53
0
0
46
1.00
424183--424231
21
2.3
21
78
0
53
24
4
53
18
1.62

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290