Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Gbar_A07 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  240  of  290  ( 34756 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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553
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1.83
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19
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33
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12
34
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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21
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0
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19
1
75
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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20
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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1.96
78307553--78308206
150
4.4
147
85
5
848
26
17
23
32
1.96
78307545--78308206
223
3.0
223
94
1
1130
27
17
22
32
1.96
78308316--78308492
77
2.3
76
85
4
214
23
19
23
33
1.97
78308524--78308634
54
2.1
54
91
0
177
30
12
15
41
1.84
78308223--78308837
295
2.1
295
87
4
882
26
17
19
36
1.94
78308572--78308821
75
3.3
74
81
7
281
26
19
19
35
1.95
78308831--78308864
16
2.1
16
88
0
50
17
8
2
70
1.25
78309614--78309742
30
4.3
30
95
0
222
25
49
5
19
1.69
78309614--78309788
30
5.8
29
89
2
179
25
48
5
21
1.72
78309614--78309788
90
1.9
90
80
4
201
25
48
5
21
1.72
78310274--78310401
25
5.5
23
68
19
61
34
4
3
57
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78310273--78310321
20
2.5
19
78
12
55
32
4
0
63
1.13
78310337--78310454
25
4.6
26
71
11
91
33
6
4
55
1.46
78310423--78310480
22
2.6
23
84
13
77
34
8
5
51
1.55
78310633--78310681
16
3.0
17
79
8
57
30
2
2
65
1.15
78311257--78311408
67
2.2
68
84
9
195
32
17
28
21
1.95
78315000--78315030
14
2.2
14
94
0
53
9
0
41
48
1.36
78315004--78315058
7
7.9
7
80
8
67
10
0
41
47
1.39
78315004--78315058
21
2.6
21
91
0
83
10
0
41
47
1.39
78315101--78315132
15
2.1
15
94
0
55
65
0
6
28
1.16
78316292--78316456
37
4.5
37
89
0
231
14
47
12
24
1.79
78316828--78316884
28
2.0
28
100
0
114
24
14
7
54
1.64
78318778--78318938
27
6.1
27
71
16
140
49
15
0
34
1.45
78318821--78319042
9
25.1
9
70
13
115
46
18
0
34
1.55
78318795--78319025
36
6.3
36
69
16
152
47
17
0
34
1.54
78318793--78319023
52
5.0
44
74
20
181
47
16
0
35
1.53
78318801--78318991
52
3.8
51
85
7
252
47
17
0
34
1.52
78324097--78324125
14
2.1
14
93
6
51
34
0
10
55
1.34
78324875--78325006
43
3.1
42
80
5
158
27
18
22
31
1.98
78324865--78325146
141
2.0
140
86
4
390
28
17
20
32
1.96
78325144--78325227
34
2.4
34
90
2
123
27
14
19
39
1.90
78331659--78331688
5
6.0
5
92
0
51
16
0
3
80
0.85
78333447--78333666
113
1.9
113
91
0
359
33
21
21
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78340101--78340167
27
2.5
26
76
9
64
40
44
1
13
1.53
78340215--78340239
13
1.9
13
100
0
50
48
52
0
0
1.00
78342967--78342993
4
6.8
4
100
0
54
77
0
0
22
0.76
78343595--78343637
5
8.0
5
80
14
50
20
0
2
76
0.89
78343604--78343643
18
2.2
18
91
8
64
27
0
0
72
0.85
78348968--78349015
23
2.1
23
100
0
96
45
8
16
29
1.76
78355111--78355165
20
2.8
19
74
15
58
50
7
9
32
1.61
78355121--78355191
37
1.9
37
91
0
115
52
7
5
35
1.52
78355120--78355179
18
3.3
18
71
13
50
56
6
6
30
1.51
78355281--78355319
18
2.2
18
86
13
55
43
15
0
41
1.46

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290