Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  52  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16469792--16469893
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18
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3
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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27
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24
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1.9
120
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305
25
27
22
24
2.00
16547678--16547902
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5.7
40
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296
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27
22
24
2.00
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79
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3
1
62
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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23
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1.94
16566798--16566912
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2.1
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23
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1.94
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1.93
16572572--16572682
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123
38
22
21
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1.93
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0
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1.08
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2
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0
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16634175--16634274
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2.6
39
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9
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58
1
1
40
1.12
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2.0
25
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10
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1.15
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14
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17
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11
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0
55
19
14
9
56
1.66
16656829--16656862
12
2.8
12
90
0
50
67
0
0
32
0.91
16657126--16657362
117
2.0
117
93
0
402
32
9
6
51
1.60
16660034--16660084
20
2.5
20
75
9
59
49
7
0
43
1.32
16663894--16663922
14
2.0
15
93
6
51
51
20
0
27
1.47
16665172--16665237
28
2.4
28
87
5
89
48
15
12
24
1.78
16667025--16667095
24
2.8
26
71
14
67
40
18
23
16
1.90
16668024--16668062
18
2.2
18
86
9
53
64
0
7
28
1.21
16681254--16681301
19
2.6
18
74
9
51
29
27
29
14
1.95
16681526--16681608
27
3.0
28
91
5
132
46
30
3
19
1.66
16685781--16685851
26
2.8
24
74
14
63
40
19
22
16
1.91
16699675--16699734
31
2.0
30
87
6
86
55
5
5
35
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16703451--16703481
15
2.1
14
94
5
53
54
6
3
35
1.42
16703468--16703536
21
3.4
20
71
16
70
55
7
1
36
1.37
16710476--16710525
20
2.6
19
81
9
66
54
4
6
36
1.44
16711007--16711067
19
2.9
21
73
14
54
49
0
3
47
1.18
16722882--16722943
19
3.1
21
77
13
69
51
1
0
46
1.10
16722896--16722943
21
2.5
18
87
12
69
50
0
0
50
1.00
16724338--16724396
31
1.9
31
86
6
84
44
11
11
32
1.78
16726358--16726393
16
2.3
15
90
4
54
33
13
0
52
1.41
16735773--16735827
26
2.1
26
100
0
110
32
18
18
30
1.95
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20
1.9
20
89
10
60
55
2
0
42
1.14
16743121--16743158
18
2.0
20
90
10
62
57
5
0
36
1.21
16743119--16743164
20
2.3
22
78
21
64
56
4
0
39
1.19
16743169--16743218
10
5.6
9
73
17
50
60
0
2
38
1.09
16747048--16747092
16
2.9
14
84
12
54
4
15
0
80
0.87
16750183--16750266
29
2.8
30
75
21
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36
13
5
44
1.68
16755110--16755176
7
8.7
7
77
18
55
41
1
1
55
1.18
16755124--16755182
32
1.9
30
86
6
82
40
1
3
54
1.27
16755112--16755178
16
4.1
16
72
12
57
41
1
1
55
1.18
16755196--16755267
10
6.6
10
73
17
54
70
4
20
4
1.21
16760241--16760398
43
3.7
43
91
0
246
22
15
27
33
1.95
16760235--16760419
43
4.3
43
86
2
239
25
15
25
32
1.95
16761374--16761460
44
2.0
44
84
4
113
20
25
27
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16766625--16766668
12
3.7
12
80
20
56
25
0
2
72
0.96
16766683--16766730
19
2.5
19
79
3
51
25
2
2
70
1.09
16773842--16773905
32
2.0
32
96
0
119
31
10
15
42
1.82
16777360--16777391
13
2.4
14
94
5
57
59
0
0
40
0.97
16779084--16779137
29
1.9
28
81
7
65
29
12
5
51
1.63
16789004--16789039
6
6.0
6
93
0
54
77
0
5
16
0.94
16789007--16789051
12
3.8
12
79
2
56
73
0
6
20
1.05
16788994--16789051
17
3.3
18
85
4
66
72
0
5
22
1.04
16789004--16789051
24
2.0
23
92
4
78
75
0
6
18
1.01
16791327--16791376
13
3.8
13
91
0
82
12
34
38
16
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290