Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  38  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12171793--12171828
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0
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21
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5
21
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
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819
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28
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2.3
21
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10
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2.3
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2.3
15
95
0
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2
11
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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20
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18
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1.94
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1.9
155
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17
18
33
1.94
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3.4
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35
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25
1.97
12312679--12312794
44
2.6
44
80
9
128
31
17
24
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12315491--12315519
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5
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17
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0
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13
134
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2
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1.38
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17
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32
6
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58
1.36
12316672--12316747
22
3.5
21
72
16
66
31
6
1
60
1.30
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0
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22
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20
15
1.54
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23
7
39
1.81
12723489--12723544
12
4.4
12
76
14
51
32
1
8
57
1.40
12723727--12723764
16
2.4
16
86
8
51
28
7
0
63
1.23
12723866--12723897
16
2.0
16
93
0
55
21
21
6
50
1.71
12723897--12724014
3
38.7
3
71
13
71
34
8
0
55
1.36
12724023--12724060
12
3.1
13
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11
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31
5
0
63
1.17
12727934--12727979
22
2.1
22
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4
58
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6
10
60
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12738845--12740144
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205
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1
2073
31
18
21
29
1.96
12740262--12740511
44
5.7
44
77
9
199
30
17
25
26
1.97
12740304--12740527
44
5.1
44
78
8
208
30
16
26
25
1.97
12740962--12741029
25
2.7
25
86
4
93
27
4
17
50
1.65
12741615--12741641
3
9.0
3
100
0
54
33
0
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12741738--12741780
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2.8
15
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59
30
6
0
62
1.21
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16
2.0
16
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0
55
21
21
6
50
1.71
12741914--12742027
3
37.7
3
70
15
56
34
7
1
56
1.39
12742036--12742073
12
3.1
13
81
11
53
31
5
0
63
1.17
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10
3.0
10
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0
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0
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0
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0.99
12745961--12746006
22
2.1
22
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4
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21
6
10
60
1.52
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15
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15
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9
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51
22
0
25
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5.3
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7
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33
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19
1.96
12776147--12776353
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2.5
81
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4
254
31
28
19
19
1.96
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2.0
57
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0
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16
20
1.94
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2.5
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20
1.96
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1.9
98
98
0
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34
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17
20
1.95
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5.2
41
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0
403
33
28
18
20
1.96
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5.2
57
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20
1.97
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180
1.9
180
93
1
599
32
27
18
20
1.96
12776147--12776624
221
2.2
222
93
1
800
32
28
19
20
1.96
12776739--12776919
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2.9
63
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8
253
42
17
8
31
1.79
12779055--12779132
40
2.0
40
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0
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20
14
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1.92
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31
2.0
31
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0
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26
27
19
26
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208
1.9
208
81
1
486
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24
15
29
1.95
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35
11.6
35
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411
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24
15
30
1.95
12783988--12784392
69
5.8
69
84
2
411
30
24
15
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12789786--12789857
31
2.3
32
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4
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41
8
8
41
1.65
12800471--12800524
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3.3
18
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7
48
22
1.75
12800466--12800564
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3.3
30
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0
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17
5
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27
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12800465--12800554
18
5.7
17
64
29
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18
5
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25
1.69
12801343--12801376
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28
1.96
12813154--12813197
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100
0
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16
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1.94
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73
7.3
73
87
3
735
31
23
16
28
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290