Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  4  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1180971--1181101
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0
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2.0
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0
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2.5
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2
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0
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0
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1.40
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3.0
72
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0
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30
23
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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60
0
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180
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178
80
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20
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1332405--1332443
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2
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13
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14
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14
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0
2
52
1.14
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3.5
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111
33
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1.9
24
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15
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55
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3
0
32
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0
30
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1.25
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39
3.1
38
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20
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32
1.98
1398305--1398673
44
8.5
44
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13
182
26
21
20
31
1.98
1398432--1398673
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5.6
45
70
19
149
27
20
20
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20.3
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0
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2.2
22
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2
2
38
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21
2.0
21
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0
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9
14
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0
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0
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27
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17
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1.51
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21
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29
0
0
70
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0
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23
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0
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2
62
1.20
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2
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2.0
71
88
0
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29
17
21
31
1.96
1474633--1474836
55
3.8
52
89
5
295
30
14
17
36
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1474625--1474836
54
4.0
54
88
5
315
30
15
17
36
1.90
1475581--1475641
32
1.9
32
82
0
77
47
42
3
6
1.45
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2.2
21
84
11
58
31
6
0
62
1.21
1476731--1476764
3
11.0
3
87
6
50
32
2
2
61
1.26
1476963--1477001
15
2.5
15
87
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51
33
2
2
61
1.23
1481064--1481095
16
2.0
16
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0
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40
15
0
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1.47
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16
2.3
17
90
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60
26
0
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17
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2.2
24
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1
32
1.43
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0
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1.43
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21
68
21
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48
0
0
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1.00
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30.7
3
70
8
53
19
41
4
34
1.71
1493856--1493947
12
7.7
12
76
9
62
19
41
4
34
1.71
1500988--1501089
28
3.4
28
75
15
114
40
11
7
40
1.71
1500972--1501097
62
2.0
62
100
0
252
42
11
9
37
1.73
1500969--1501067
28
3.2
31
72
16
114
45
11
9
34
1.71
1506812--1506846
18
1.9
18
88
0
52
62
0
0
37
0.95
1508066--1508131
10
6.3
10
71
15
53
34
3
3
59
1.28
1509082--1509114
15
2.1
16
88
5
50
87
0
9
3
0.63
1511050--1511163
54
2.1
53
95
1
201
40
6
10
42
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1511370--1511459
47
1.9
47
86
0
126
36
21
10
32
1.86
1518626--1518691
31
2.1
31
88
0
96
40
16
10
31
1.83
1521374--1521425
22
2.3
23
74
6
54
9
7
25
57
1.57
1521947--1521995
25
2.0
25
100
0
98
44
10
8
36
1.68
1523645--1523700
29
1.9
30
82
7
71
50
0
5
44
1.25
1523727--1524137
207
2.0
204
98
1
795
54
14
8
21
1.67
1524228--1524270
16
2.8
16
82
3
52
79
4
2
13
1.00
1524532--1524567
10
3.7
10
85
7
56
19
0
0
80
0.71
1525755--1525852
42
2.4
42
94
1
171
34
11
15
38
1.83
1537235--1537330
21
4.5
21
84
2
111
14
21
26
37
1.92
1537232--1537330
42
2.3
42
85
3
135
15
21
25
38
1.92
1542673--1542776
51
2.0
51
96
0
190
37
8
25
27
1.86
1546232--1546273
21
2.0
21
95
0
75
52
16
19
11
1.74
1555592--1555622
15
2.1
15
93
0
53
67
0
32
0
0.91
1564445--1564800
46
7.8
46
83
5
375
41
14
23
20
1.89
1564445--1564800
92
3.9
92
86
3
416
41
14
23
20
1.89
1566183--1566234
15
3.2
15
73
19
50
38
0
1
59
1.08
1566280--1566333
16
3.4
17
70
12
51
59
0
0
40
0.98
1566279--1566359
28
2.8
28
78
14
76
54
1
0
44
1.08
1583759--1583788
8
3.9
8
95
4
53
23
0
0
76
0.78
1593400--1593424
13
1.9
13
100
0
50
16
8
28
48
1.74
1594123--1594173
3
17.0
3
100
0
102
33
0
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1594347--1594371
4
6.2
4
100
0
50
48
0
0
52
1.00
1594973--1594997
13
1.9
13
100
0
50
8
0
24
68
1.16
1596525--1596721
41
4.8
41
92
5
317
28
20
22
27
1.99
1596940--1597003
32
2.0
31
90
3
101
28
9
23
39
1.86
1602645--1602669
13
1.9
13
100
0
50
8
0
24
68
1.16
1604187--1604338
81
1.9
81
89
5
236
30
20
21
28
1.98
1604187--1604341
41
3.8
41
89
8
235
29
20
21
28
1.98
1604560--1604623
32
2.0
31
90
3
101
28
9
23
39
1.86
1611006--1611098
44
2.1
45
84
4
118
52
4
4
38
1.41
1611941--1612061
59
2.1
59
79
6
138
42
4
11
40
1.63

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290