Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  273  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87547697--87547775
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0
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1.28
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133
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0
3
35
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
18
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2
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38
1.34
87601766--87601890
45
2.7
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0
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20
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2.2
20
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2
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23
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11
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2.0
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2.2
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2.0
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3
156
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3
4
49
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.27
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2.5
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90
0
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62
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1.52
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0
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10
5
10
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1.21
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0
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12
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2
40
1.32
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1.36
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16
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190
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1.19
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2.2
25
81
3
69
63
8
1
26
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87777275--87777308
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0
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0
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6.2
6
87
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56
0
16
0
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2.3
13
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0
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0
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2.0
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5
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12
20
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1.90
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27
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2.0
37
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15
98
73
0
26
0
0.83
87805690--87805786
30
3.2
29
69
21
74
35
0
11
53
1.37
87805677--87805795
60
2.0
60
88
0
175
35
0
10
52
1.42
87808300--87808386
33
2.6
33
85
0
111
16
44
11
27
1.81
87808584--87808726
76
1.9
77
88
1
216
29
6
6
57
1.50
87811977--87812035
28
2.1
28
87
9
86
69
0
0
30
0.89
87818135--87818167
16
2.1
16
100
0
66
24
18
21
36
1.95
87819818--87819896
6
13.5
6
86
5
54
59
1
5
34
1.27
87819920--87820075
65
2.4
65
90
5
235
63
1
8
26
1.32
87819835--87820322
3
162.0
3
69
9
242
61
1
8
27
1.35
87823740--87823778
20
1.9
21
84
5
53
30
15
2
51
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87823851--87824119
42
6.3
41
80
6
207
38
19
18
23
1.93
87823851--87824132
84
3.3
86
76
7
261
38
19
18
23
1.93
87826053--87826077
11
2.3
11
100
0
50
40
0
0
60
0.97
87826102--87826141
20
2.0
21
95
5
73
40
10
5
45
1.60
87831203--87831245
19
2.2
19
83
4
50
44
11
9
34
1.73
87837255--87837287
16
2.1
16
100
0
66
24
18
21
36
1.95
87838945--87839023
6
13.5
6
86
5
54
59
1
5
34
1.27
87838962--87839445
3
161.0
3
69
9
229
61
1
8
28
1.36
87843109--87843259
42
3.6
42
78
7
162
44
19
13
23
1.85
87843088--87843265
84
2.1
84
85
2
232
43
19
15
21
1.87
87845184--87845208
11
2.3
11
100
0
50
40
0
0
60
0.97
87845233--87845272
20
2.0
21
95
5
73
40
10
5
45
1.60
87856924--87856973
25
2.0
25
96
0
91
36
10
8
46
1.67
87862812--87863204
196
2.0
196
100
0
786
36
18
10
34
1.85
87865651--87865701
22
2.3
22
75
0
57
43
1
1
52
1.23
87868414--87868445
15
2.1
15
94
0
55
65
18
0
15
1.27
87873013--87873039
12
2.2
12
100
0
54
22
0
0
77
0.76
87873006--87873039
12
3.0
11
87
8
50
26
2
0
70
1.01
87872972--87873282
150
2.1
150
90
4
484
26
5
7
60
1.47
87876510--87876579
18
3.8
19
85
11
101
38
8
14
38
1.77
87876560--87876602
23
1.9
23
90
4
70
39
4
13
41
1.66
87888015--87888061
24
2.0
25
87
8
71
68
2
6
23
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87889380--87889419
17
2.4
17
91
0
62
47
2
2
47
1.29
87889387--87889446
30
2.0
31
83
9
79
48
3
0
48
1.18
87899708--87899754
15
3.2
15
69
6
51
57
8
4
29
1.48
87899823--87899862
7
5.7
7
100
0
80
57
0
12
30
1.36
87899830--87899875
21
2.2
21
84
0
56
60
0
8
30
1.26
87907478--87907523
22
2.1
21
84
11
58
56
10
2
30
1.46
87907848--87907906
27
2.2
27
90
0
91
16
6
18
57
1.61
87908679--87908717
16
2.4
16
91
0
60
33
0
2
64
1.08
87909931--87909964
17
1.9
17
88
5
50
52
14
2
29
1.56
87929665--87929727
29
2.2
29
88
2
92
38
19
4
38
1.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290