Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  274  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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22
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11
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1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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73
20
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1
8
29
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
2
3
68
1.18
88102910--88102990
29
2.9
28
80
10
85
25
2
3
67
1.19
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0
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50
0
16
33
1.46
88130124--88130169
4
11.8
4
95
4
85
50
0
23
26
1.50
88132422--88132459
14
2.5
16
87
8
53
55
5
0
39
1.23
88135952--88136046
49
1.9
49
91
0
154
41
14
20
24
1.89
88136193--88136431
93
2.6
91
83
6
306
40
16
9
33
1.81
88136516--88136678
39
4.2
39
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19
97
60
3
6
30
1.37
88136572--88136618
19
2.5
19
75
6
51
59
0
2
38
1.09
88136604--88136648
21
2.1
21
84
8
56
60
4
8
26
1.46
88136818--88136856
19
2.0
20
85
5
53
43
2
5
48
1.38
88137735--88137777
19
2.3
19
88
4
61
51
4
4
39
1.44
88137903--88137943
6
6.7
6
88
5
64
19
0
0
80
0.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88137894--88137941
25
2.0
25
87
4
71
27
0
0
72
0.84
88137903--88137946
19
2.3
19
92
0
70
20
0
0
79
0.73
88137903--88137946
13
3.5
13
81
6
63
20
0
0
79
0.73
88137943--88137972
14
2.1
14
93
0
51
33
13
10
43
1.77
88140150--88140196
21
2.2
21
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7
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65
2
0
31
1.04
88140904--88140937
16
2.2
15
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5
50
52
5
5
35
1.50
88141061--88141104
18
2.2
20
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11
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38
0
4
56
1.20
88141196--88141249
23
2.3
23
75
6
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37
16
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1.84
88143104--88143163
30
2.0
31
83
9
79
35
18
16
30
1.93
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19
3.6
19
81
12
81
59
1
2
36
1.21
88144480--88144537
20
2.9
20
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14
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58
1
3
36
1.25
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18
1.9
18
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0
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0
0
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0.93
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2.7
91
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8
291
34
18
11
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1.87
88145007--88145285
91
3.1
91
82
9
243
36
18
10
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0
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0
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0
0.98
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22
2.0
22
86
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61
4
9
23
1.45
88152101--88152148
3
16.0
3
95
0
87
66
0
31
2
1.03
88153116--88153163
18
2.5
20
77
16
57
54
0
2
43
1.12
88153129--88153208
19
4.2
19
65
1
52
57
3
3
35
1.34
88153376--88153441
28
2.3
29
82
12
84
36
4
3
56
1.35
88153430--88153469
19
2.0
20
95
4
73
25
5
0
70
1.08
88153380--88153469
28
3.2
28
78
7
78
32
4
2
61
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88153430--88153484
17
3.0
17
84
15
58
27
5
0
67
1.12
88154428--88154476
16
3.0
16
84
3
71
16
8
0
75
1.03
88154692--88154722
5
6.2
5
92
0
53
19
58
0
22
1.40
88155195--88155241
23
2.0
24
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4
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61
2
0
36
1.08
88161740--88161816
36
2.1
37
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2
147
32
5
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88162405--88162682
141
2.0
141
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1
414
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18
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28
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100
0
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88173589--88173628
16
2.4
16
87
4
53
57
0
0
42
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290