Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  88  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26824229--26824277
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2.6
18
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4.7
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1
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1.49
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3.0
37
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0
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1.63
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50
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26872377--26872599
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2.5
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232
33
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26883042--26883080
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2.1
19
85
4
53
30
23
0
46
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
25
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22
27
25
2.00
26893081--26893406
79
4.1
80
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466
24
22
27
25
2.00
26893077--26893406
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2.8
119
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531
25
22
26
25
2.00
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291
2.0
291
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870
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2.0
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11
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2.1
18
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1.31
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2
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26915300--26915374
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6.8
11
71
24
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2
1
40
1.22
26915281--26915374
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131
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1.28
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80
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11
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18
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5
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26
1.58
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66
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10
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1.32
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67
65
0
10
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3.1
9
100
0
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0
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2
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23
14
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1
2
20
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4
18.8
4
76
22
52
76
1
2
20
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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20
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28
18
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1.98
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1.9
96
94
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28
18
26
1.98
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24
2.2
24
100
0
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2.0
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38
1.79
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259
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28
20
27
1.99
26974684--26974997
94
3.3
95
82
7
367
23
28
20
27
1.99
26974690--26974997
141
2.2
138
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363
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28
20
27
1.99
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5.2
9
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10
51
63
0
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1.23
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62
0
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1.46
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2.0
68
100
0
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39
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1.41
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18
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2.3
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0
0
40
0.97
26994661--26994686
9
2.9
9
100
0
52
53
0
34
11
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27007098--27007132
18
1.9
18
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0
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5
11
22
60
1.52
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13.7
3
95
5
75
0
33
0
66
0.92
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27
2.0
28
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69
33
14
3
48
1.61
27010887--27010968
38
2.1
39
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121
54
3
25
15
1.57
27015127--27015191
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17
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4
72
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10.2
6
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11
56
11
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3
79
1.03
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1.9
90
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2
223
23
20
17
39
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2.1
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16
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53
0
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1.45
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50
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3
211
25
18
28
28
1.98
27035526--27035604
39
2.0
39
95
0
140
30
2
6
60
1.35
27035598--27035638
19
2.2
19
83
12
50
31
0
17
51
1.46
27035951--27035991
21
2.0
21
85
0
55
58
2
2
36
1.24
27036046--27036074
13
2.1
14
93
6
51
51
0
0
48
1.00
27038771--27038861
23
3.8
23
73
12
69
61
1
1
36
1.10
27044419--27044473
27
2.1
26
86
6
76
45
20
12
21
1.84
27046700--27046741
21
2.0
21
100
0
84
23
14
19
42
1.87
27050257--27050296
19
1.9
19
85
14
53
32
0
5
62
1.17
27050257--27050300
20
2.1
22
83
8
56
31
0
4
63
1.14
27050531--27050567
17
2.2
17
90
9
58
67
2
0
29
1.04
27050540--27050579
11
3.6
11
79
0
53
67
2
0
30
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27054771--27055022
132
1.9
132
90
1
407
43
15
5
34
1.71
27082728--27082785
23
2.5
23
94
2
98
0
60
0
39
0.97
27082731--27082792
6
10.5
6
91
3
90
0
66
0
33
0.92
27086071--27086110
17
2.3
18
83
12
57
67
0
0
32
0.91
27087973--27088007
17
2.0
18
88
5
54
60
2
0
37
1.12
27090656--27090694
17
2.3
17
86
8
53
43
0
0
56
0.99
27092684--27092710
13
2.1
13
100
0
54
29
7
14
48
1.71
27098866--27098969
34
3.1
34
94
2
174
29
21
23
25
1.99
27110045--27110315
40
6.8
40
90
0
371
19
29
18
32
1.96
27110118--27110305
20
9.4
20
65
6
103
18
30
20
30
1.96
27110045--27110315
80
3.4
80
90
1
409
19
29
18
32
1.96
27119238--27119383
27
5.4
27
89
0
202
28
10
17
43
1.83
27129280--27129518
50
4.8
50
83
3
286
28
17
30
23
1.97
27138936--27138979
21
2.0
22
91
4
72
43
22
4
29
1.73
27139499--27139554
24
2.3
24
96
0
103
28
25
3
42
1.71
27143210--27143245
19
1.9
18
88
5
54
38
25
5
30
1.78
27147049--27147092
22
2.0
22
100
0
88
45
0
13
40
1.44
27151822--27151887
26
2.6
25
74
13
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74
3
21
1
1.04
27153981--27154045
31
2.1
31
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0
76
55
0
0
44
0.99
27155625--27155839
21
9.6
23
68
23
104
35
3
0
60
1.13
27155618--27155863
57
4.4
53
70
19
162
35
3
0
60
1.19
27155621--27155688
29
2.4
27
73
26
52
38
0
0
61
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27155613--27155862
97
2.7
89
76
17
240
34
3
0
61
1.18
27155618--27155884
14
17.9
15
68
19
118
34
3
0
60
1.20
27156119--27156186
36
1.9
35
82
8
84
35
4
0
60
1.17
27156112--27156186
32
2.3
32
84
8
98
34
4
0
61
1.15
27156112--27156181
17
4.4
16
75
20
67
34
4
0
61
1.16
27160153--27160195
11
3.8
11
77
17
52
62
4
0
32
1.15
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17
2.0
17
88
0
50
70
0
0
29
0.87
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3.0
27
92
0
137
15
30
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1.91
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2.1
31
96
0
119
21
7
25
45
1.78
27175866--27175893
7
4.0
7
100
0
56
28
0
14
57
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290