Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  243  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78892553--78892582
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2.2
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
19
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3
76
19
0
2
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0.86
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2.2
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4
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7
0
19
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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5.2
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59
72
0
2
25
0.98
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2.0
24
84
7
64
72
2
14
12
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79083265--79083322
5
12.2
5
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12
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0
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44
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79083265--79083323
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2.3
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2.6
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26
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2.4
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55
47
20
0
32
1.50
79118657--79118720
23
2.9
22
81
9
67
50
9
20
20
1.75
79118691--79118761
22
3.3
21
80
7
88
57
8
11
22
1.60
79118670--79118761
44
2.1
44
83
0
112
53
8
15
22
1.69
79118655--79118761
22
4.8
22
77
8
83
52
8
17
21
1.71
79133980--79134038
24
2.4
25
86
8
77
32
5
0
62
1.17
79141478--79141510
17
1.9
17
100
0
66
30
18
15
36
1.91
79144165--79144207
17
2.4
18
88
3
61
55
2
0
41
1.12
79144155--79144238
44
1.9
44
85
0
114
55
3
3
36
1.34
79148717--79148748
6
5.2
6
92
7
55
37
0
0
62
0.95
79154349--79154391
18
2.4
18
80
0
50
32
0
44
23
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79158380--79158462
21
3.9
21
77
3
67
37
25
21
15
1.93
79159947--79159993
22
2.1
23
88
4
69
4
21
4
70
1.22
79159948--79160002
29
1.9
28
82
10
67
3
18
5
72
1.18
79159957--79160006
12
4.2
12
80
15
50
6
18
4
72
1.22
79166234--79166320
21
4.0
23
80
10
92
37
25
21
14
1.92
79167769--79167813
22
2.0
23
91
4
74
4
17
4
73
1.17
79167777--79167826
12
4.2
12
80
15
50
6
18
4
72
1.22
79177240--79177284
18
2.5
18
100
0
90
22
37
24
15
1.93
79177240--79177284
9
5.0
9
77
0
54
22
37
24
15
1.93
79186324--79186418
50
1.9
50
88
0
145
29
25
21
24
1.99
79186709--79186766
30
1.9
30
86
6
82
18
37
32
10
1.85
79191586--79191649
6
10.7
6
86
6
94
17
1
1
79
0.89
79191586--79191671
24
3.7
24
81
7
88
18
3
2
75
1.05
79191597--79191671
30
2.6
29
82
6
89
18
4
1
76
1.02
79196714--79196784
20
3.5
20
98
0
133
16
38
30
14
1.89
79198705--79198869
60
2.7
60
77
4
154
38
6
13
41
1.70
79202547--79202604
30
1.9
30
86
6
82
22
32
27
17
1.96
79209160--79209197
3
13.0
3
94
5
69
34
0
0
65
0.93
79211468--79211521
28
1.9
28
92
0
90
24
12
22
40
1.89
79211725--79211756
2
16.0
2
100
0
64
0
50
0
50
1.00
79214697--79214724
11
2.5
11
100
0
56
42
0
7
50
1.30
79227610--79227644
17
2.1
17
88
0
52
40
2
8
48
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79229522--79229600
37
2.1
37
90
0
122
25
31
18
24
1.98
79229719--79230208
47
10.3
47
93
3
764
28
30
8
32
1.88
79233260--79233682
214
2.0
214
90
1
679
24
13
28
33
1.93
79238678--79238765
37
2.4
37
86
1
133
19
13
27
39
1.89
79241500--79241549
10
4.8
10
83
9
64
38
0
2
60
1.09
79243243--79243360
58
2.0
58
93
0
200
33
11
22
32
1.91
79243602--79243634
13
2.6
13
90
4
50
39
3
12
45
1.57
79249387--79249459
6
12.3
6
83
13
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15
2
0
82
0.79
79249400--79249452
26
2.1
25
86
10
72
15
3
0
81
0.83
79261676--79261740
23
2.8
22
71
17
60
75
6
15
3
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290