Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  272  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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93
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21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
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1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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4
0
45
1.22
87462743--87462813
35
2.0
35
86
5
99
43
28
5
22
1.76
87462957--87463023
16
4.2
16
70
14
57
47
2
19
29
1.64
87464013--87464071
28
2.1
28
87
9
84
35
15
8
40
1.77
87469581--87469616
7
5.1
7
93
0
54
55
5
0
38
1.23
87474001--87474030
15
2.0
15
93
0
51
63
0
0
36
0.95
87474052--87474077
6
4.3
6
100
0
52
0
0
15
84
0.62
87475961--87475989
3
9.7
3
100
0
58
0
31
0
68
0.89
87481390--87481468
25
3.0
24
78
14
77
39
10
0
50
1.36
87481396--87481476
28
3.0
28
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12
82
38
8
0
53
1.32
87482414--87482438
9
2.8
9
100
0
50
56
0
0
44
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87482683--87482731
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2.4
21
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3
55
46
0
0
53
1.00
87482682--87482751
30
2.4
30
81
11
83
50
0
0
50
1.00
87484225--87484281
21
2.7
21
70
20
55
56
5
1
36
1.32
87491503--87491574
36
2.0
36
94
0
126
19
5
44
30
1.73
87492848--87492909
28
2.2
29
91
2
99
25
12
32
29
1.93
87494816--87494847
14
2.3
14
100
0
64
40
0
25
34
1.56
87498707--87498740
13
2.6
13
90
0
59
20
11
14
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1.73
87501437--87501478
19
2.2
20
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4
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50
0
0
50
1.00
87507205--87507326
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21
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25
29
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1.91
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47
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0
378
27
30
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32
1.89
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44
2.0
44
93
0
153
24
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11
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1.71
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15
2.6
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11
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38
0
15
46
1.46
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19
6.2
19
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4
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36
15
10
37
1.82
87520512--87520540
2
14.5
2
100
0
58
0
0
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1.00
87524459--87524635
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3.5
50
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2
257
35
16
21
26
1.94
87524613--87524814
31
6.5
31
90
0
305
28
19
26
25
1.99
87524820--87524845
7
3.7
7
100
0
52
46
15
26
11
1.80
87524856--87524977
47
2.6
46
83
7
140
30
15
25
28
1.96
87526812--87526849
18
2.1
18
100
0
76
68
0
13
18
1.21
87527109--87527160
27
1.9
27
88
0
77
42
9
17
30
1.81
87529587--87529630
23
1.9
23
90
0
70
61
4
2
31
1.28
87529591--87529633
11
3.8
11
80
17
52
65
2
2
30
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87534726--87534770
16
2.8
16
93
6
74
66
2
0
31
1.04
87534726--87534770
8
5.6
8
86
7
65
66
2
0
31
1.04
87534884--87534937
23
2.5
22
75
13
60
57
5
5
31
1.45
87534900--87534985
25
3.7
24
79
10
81
55
5
6
31
1.50
87535004--87535135
25
5.6
25
74
8
98
59
2
3
34
1.28
87535001--87535051
14
3.9
13
73
17
52
64
0
3
31
1.11
87535617--87535791
30
5.8
30
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1
219
20
4
47
28
1.68
87538480--87538645
35
4.6
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199
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10
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1.89
87538480--87538650
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2.4
75
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7
230
31
10
23
33
1.89
87545975--87546106
35
3.6
37
82
10
164
32
11
23
32
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290