Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  3  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
701369--701555
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14
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1.9
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14
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51
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0
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720988--721032
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23
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44
2
0
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2.5
23
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3
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2.0
22
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740731--741032
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2.3
126
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379
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14
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133
2.7
131
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0
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0
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2.9
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18
100
0
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37
10
16
35
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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1
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0
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0
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10
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10
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17
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22
23
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775405--775575
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22
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1.95
775540--775653
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2.5
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131
42
15
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20
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1.8
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93
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17
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42
0
2
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20
3.2
20
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22
67
50
6
10
33
1.62
801348--801419
35
2.1
35
100
0
144
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8
30
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36
0
0
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16
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4.3
45
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0
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15
18
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20
2.7
18
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8
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74
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7
13
1.18
822305--822357
20
2.7
20
87
0
79
26
28
16
28
1.97
822690--822883
45
4.3
45
91
0
289
41
15
18
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1.89
831863--831894
3
10.7
3
93
0
55
65
0
3
31
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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132
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2.0
218
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20
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1.98
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22
21
30
1.98
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2.0
131
95
2
478
30
21
13
34
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1023529--1023569
21
2.0
21
90
0
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21
29
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1.98
1027156--1027180
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0
0
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57
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2.3
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10
28
1.55
1027532--1027602
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1.9
37
82
2
90
57
1
8
32
1.37
1027712--1027749
17
2.2
17
90
0
58
63
2
2
31
1.22
1031977--1032015
15
2.7
14
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4
60
64
0
0
35
0.94
1031977--1032023
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14
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17
51
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0
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19
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2.5
21
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14
65
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1
1
49
1.23
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30
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1
0
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2.5
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51
0
0
13
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1
252
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19
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20
81
9
61
50
0
0
49
1.00
1075412--1075438
14
1.9
14
100
0
54
44
25
29
0
1.54
1075426--1075539
51
2.2
51
92
0
183
34
14
21
29
1.93
1078994--1079090
48
2.0
48
97
0
185
25
14
11
48
1.77
1082373--1082429
26
2.2
26
90
6
89
24
28
7
40
1.81
1082382--1082433
26
2.0
26
100
0
104
23
30
7
38
1.83
1085435--1085489
21
2.7
19
76
13
56
20
5
7
67
1.35
1085759--1085818
20
3.0
20
80
7
68
48
0
3
48
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1089603--1089643
21
2.0
21
100
0
82
43
4
9
41
1.59
1089842--1089979
69
2.0
69
97
0
258
29
10
12
47
1.75
1094071--1094099
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
1096956--1096994
19
2.1
19
90
0
60
53
10
2
33
1.48
1097840--1097889
15
3.3
15
88
0
82
36
0
12
52
1.39
1100822--1100862
21
2.0
21
85
0
55
21
29
19
29
1.98
1105662--1105711
18
2.8
18
90
0
82
0
50
2
48
1.12
1106825--1106890
34
1.9
34
90
3
105
43
15
9
31
1.77
1106860--1106899
14
2.9
14
84
0
53
42
17
7
32
1.77
1116177--1116232
21
2.7
21
85
0
76
32
12
17
37
1.88
1117605--1117639
17
2.2
17
90
10
56
57
5
0
37
1.23
1117593--1117633
21
1.9
22
85
5
57
56
4
0
39
1.21
1132324--1132369
21
2.2
21
88
0
65
23
8
34
32
1.86
1133637--1133689
21
2.5
21
87
0
79
28
7
33
30
1.85
1139503--1139543
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
1139605--1139629
9
2.8
9
100
0
50
32
0
44
24
1.54
1142073--1142113
19
2.1
20
86
4
57
56
2
2
39
1.26
1145730--1145763
17
2.0
17
100
0
68
17
23
17
41
1.90
1150458--1150484
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
1151337--1151421
22
3.9
21
73
13
64
44
1
1
52
1.16
1164834--1164930
49
2.0
49
85
0
131
19
14
21
44
1.86
1164939--1165246
51
6.0
51
82
1
339
24
15
16
43
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1164951--1165246
153
1.9
153
84
1
387
24
15
16
43
1.86
1165284--1165606
40
8.2
40
69
8
178
32
22
20
25
1.98
1165501--1165871
156
2.4
155
85
3
487
32
21
19
26
1.97
1166172--1166728
276
2.0
276
92
0
925
32
15
18
33
1.92
1169505--1169539
14
2.6
14
90
4
54
37
2
14
45
1.59
1170260--1170498
43
5.6
43
81
4
248
24
20
23
31
1.98
1170236--1170498
86
3.1
85
82
2
310
25
18
23
32
1.97
1170264--1170496
129
1.8
129
82
3
299
25
18
23
32
1.97
1171202--1171342
67
2.1
68
84
4
178
21
12
17
48
1.79
1171202--1171374
67
2.6
67
80
4
152
21
14
17
46
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290