Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  258  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83428437--83428745
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0
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83443584--83443646
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5.9
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77
0
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36
1.83
83511503--83511574
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26
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3.8
78
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20
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24
1.98
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2.3
159
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530
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24
1.98
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6.1
45
80
6
313
29
16
28
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
28
25
1.96
83522205--83522461
134
1.9
135
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344
28
16
29
25
1.97
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36
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0
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1
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290
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3.5
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23
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0
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1.63
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0
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0
0
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21
1.78
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2.1
21
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0
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20
6
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69
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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42
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100
0
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1.94
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0
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20
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1.99
83602717--83602908
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1.9
99
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2
276
28
25
19
26
1.99
83602717--83602917
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1
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0
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1.83
83604942--83604983
16
2.4
18
80
11
52
66
2
2
28
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83608478--83608508
15
2.0
16
93
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51
3
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0
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19
0
30
1.48
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12
26
1.92
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3.5
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0
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12
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19
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4
2
21
1.12
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100
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2
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18
1.9
18
88
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52
44
2
2
50
1.32
83616795--83616847
14
3.8
14
89
0
79
56
32
0
11
1.35
83616795--83616854
14
4.3
14
86
0
66
58
30
0
11
1.34
83616786--83616854
28
2.4
28
78
2
84
62
27
0
10
1.27
83617461--83617498
14
2.7
15
84
12
53
42
44
0
13
1.43
83617556--83617777
41
5.5
41
89
2
297
27
25
20
26
1.99
83617556--83617777
81
2.8
80
85
2
302
27
25
20
26
1.99
83617771--83617879
41
2.7
41
83
0
119
22
22
22
33
1.98
83618487--83618540
22
2.4
23
78
9
67
51
1
5
40
1.36
83622728--83622802
39
1.9
39
94
0
132
28
21
20
30
1.98
83624864--83624985
47
2.6
47
84
8
144
28
29
21
20
1.98
83628470--83628518
19
2.5
20
84
12
66
61
8
0
30
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83631510--83631556
19
2.5
19
82
3
51
46
6
2
44
1.40
83632799--83632837
16
2.5
15
87
4
51
38
17
7
35
1.79
83632961--83633008
16
2.9
16
84
3
60
50
20
2
27
1.60
83634947--83634987
17
2.5
17
96
4
75
43
4
7
43
1.53
83635413--83635459
24
2.0
24
95
0
85
36
10
14
38
1.81
83635554--83635721
66
2.5
66
80
9
184
39
16
16
27
1.90
83637235--83637283
24
2.0
24
100
0
98
22
32
12
32
1.91
83638531--83638622
40
2.4
39
74
9
89
32
33
14
19
1.92
83646051--83646092
18
2.3
18
88
8
59
21
47
21
9
1.79
83647491--83647560
32
2.2
31
78
12
79
38
18
10
32
1.84
83648808--83648861
28
1.9
28
100
0
108
48
16
0
35
1.47
83652994--83653043
26
2.0
24
88
7
73
64
6
0
30
1.18
83653119--83653151
15
2.1
16
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11
50
69
0
0
30
0.88
83657759--83657831
36
2.0
36
100
0
146
28
13
32
24
1.94
83662819--83662855
20
2.0
20
84
10
51
5
18
8
67
1.36
83663007--83663031
10
2.5
10
100
0
50
44
0
0
56
0.99
83663537--83663586
23
2.2
23
88
0
73
62
2
4
32
1.25
83663609--83663648
19
2.1
19
86
9
55
50
0
5
45
1.23
83673259--83673300
18
2.3
18
91
0
66
45
0
28
26
1.54
83673259--83673320
9
6.9
9
74
7
54
45
0
29
25
1.54
83673272--83673332
27
2.4
27
81
8
74
39
0
34
26
1.57
83676405--83676435
9
3.3
9
95
4
53
58
0
0
41
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83679662--83679701
16
2.5
16
95
0
71
35
10
5
50
1.58
83680057--83680081
13
1.9
13
100
0
50
56
0
0
44
0.99
83681886--83681931
3
14.7
3
82
8
56
2
26
2
69
1.11
83681871--83681933
18
3.6
18
80
8
67
3
22
1
73
1.07
83681869--83681931
9
6.8
9
81
15
58
3
22
1
73
1.07
83695720--83695772
22
2.4
22
75
6
54
47
1
7
43
1.42
83707038--83707388
46
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46
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1
427
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13
24
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1.88
83707037--83707398
138
2.6
138
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494
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1.89
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50
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0
182
33
5
25
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1.79
83714286--83714339
14
3.6
14
82
7
54
48
9
0
42
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290