Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  262  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84587687--84587738
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0
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0
0
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22
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21
20
1.96
84651834--84652124
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2.4
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2.1
21
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31
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
138
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30
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2.3
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2.2
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3
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1.25
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15.4
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71
9
101
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2
2
30
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
2
30
1.19
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6.3
19
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2
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1.23
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2
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1.16
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20.0
9
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0
0
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1.99
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357
20
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1.99
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15
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3.6
48
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153
38
17
19
24
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84743313--84743420
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2.2
49
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6
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16
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1.90
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2.0
51
98
0
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19
15
30
1.93
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17
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1.82
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3.0
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0
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20
9
18
52
1.72
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0
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0
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1.46
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23
3.7
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28
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1.47
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0
18
1.48
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0
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0
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54
0
2
43
1.12
84772994--84773079
29
2.9
28
78
16
77
55
1
2
40
1.20
84777503--84777551
22
2.2
23
88
3
73
32
4
4
59
1.35
84792462--84792543
33
2.5
33
82
7
96
29
0
6
64
1.17
84795527--84795700
60
2.9
60
78
6
167
39
25
11
23
1.88
84800098--84800124
3
9.0
3
100
0
54
33
0
0
66
0.92
84801269--84801319
26
2.0
25
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3
0
35
1.15
84802786--84802831
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21
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8
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1.54
84812203--84812255
21
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21
75
0
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18
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1.97
84818783--84818836
24
2.2
24
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0
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22
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1.92
84824554--84824587
17
2.0
17
100
0
68
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11
5
23
1.55
84824687--84824721
5
7.0
5
100
0
70
60
0
0
40
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
14
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0
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36
0
0
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0.95
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19
2.1
22
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51
2
0
46
1.13
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2.3
26
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0
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27
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31
1.92
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40
2.0
40
89
0
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15
13
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36
1.87
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58
2.0
58
100
0
234
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5
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1.65
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17
2.0
17
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0
50
47
0
8
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1.34
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1
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1.95
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2.0
62
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0
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1.93
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59
0
0
40
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30
4
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1.26
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2.0
20
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0
53
47
0
0
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1.00
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2.5
20
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12
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1.89
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1.9
24
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35
33
4
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1.77
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3
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0
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24
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20
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29
5
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1.33
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27
2.2
27
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27
5
5
62
1.37
84899716--84899783
11
6.0
11
77
6
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35
1
7
55
1.37
84899720--84899825
22
5.0
22
75
18
107
33
0
5
59
1.27
84899720--84899825
13
8.6
13
69
24
70
33
0
5
59
1.27
84899720--84899930
50
4.6
48
71
18
139
34
7
4
54
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84899756--84899830
37
2.0
37
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36
0
4
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1.16
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1.9
23
85
0
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29
9
4
56
1.50
84900165--84900237
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2.3
32
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32
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1.50
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2.0
46
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0
171
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16
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4.2
25
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183
22
24
3
48
1.67
84917075--84917179
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2.1
50
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1
183
22
24
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1.67
84917922--84917993
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2.0
36
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0
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66
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2
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2
13.0
2
100
0
52
50
0
50
0
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290