Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  41  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13516671--13516845
81
2.2
80
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4
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26
22
25
2.00
13516671--13516845
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4.4
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3
273
25
26
22
25
2.00
13524706--13524888
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4.6
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264
26
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2.00
13526673--13526707
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1.9
18
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20
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2.3
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26
29
1.97
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81
2.2
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80
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28
1.97
13548723--13548982
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2.0
129
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26
17
27
28
1.97
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2.3
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0
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4.1
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0
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40
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26
25
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47
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26
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28
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16
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2
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26
27
1.99
13573249--13573469
79
2.8
79
93
2
363
23
22
26
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13581317--13581498
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4.6
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2
260
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25
27
2.00
13594700--13594796
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2.3
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5
117
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0
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2.8
28
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2.0
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21
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1.96
13609399--13609554
54
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221
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1.97
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26
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1.96
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0
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18
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0
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10
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10
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0
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2.9
21
76
2
66
16
23
23
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.95
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1.00
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0
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2.5
25
81
13
73
80
4
13
1
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13711453--13711725
143
1.9
143
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334
30
19
23
27
1.98
13711739--13712115
143
2.6
143
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32
16
20
30
1.95
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4
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1.12
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2
1
64
1.18
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12
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20
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0
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0
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6
11
0
81
0.87
13724181--13724222
16
2.6
16
82
14
59
0
16
0
83
0.65
13725071--13725124
12
4.3
12
81
13
65
75
0
1
22
0.89
13725076--13725128
9
6.3
9
81
14
53
75
0
1
22
0.90
13728826--13728865
20
2.0
20
90
0
62
70
2
5
22
1.19
13731979--13732012
9
3.8
9
100
0
68
23
0
8
67
1.18
13733655--13733709
18
3.1
18
81
0
65
43
5
14
36
1.69
13736797--13736873
39
2.0
39
84
0
100
15
24
23
36
1.94
13746393--13746616
40
5.6
40
85
3
279
24
23
26
25
2.00
13746398--13746616
83
2.7
80
87
5
282
23
23
27
25
2.00
13749218--13749392
42
4.0
42
79
13
178
30
26
13
29
1.94
13749304--13749470
47
3.6
46
86
4
201
30
26
14
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13749492--13749609
31
3.8
31
87
0
155
27
26
19
27
1.99
13749592--13749713
50
2.4
51
94
2
219
26
22
14
36
1.93
13751822--13751872
20
2.4
23
87
12
74
41
0
7
50
1.31
13752251--13752290
19
2.2
17
86
8
53
27
2
5
65
1.27
13753150--13753285
51
2.7
51
77
0
155
39
6
12
41
1.69
13754969--13755255
96
3.0
96
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1
441
35
17
34
12
1.88
13756165--13756300
51
2.7
51
77
0
146
40
6
11
41
1.68
13757723--13757761
19
2.1
19
100
0
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0
10
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1.37
13757728--13757768
19
2.2
19
86
4
57
43
4
7
43
1.53
13761721--13761753
2
17.0
2
87
6
50
45
0
3
51
1.16
13762823--13763100
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5.8
48
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0
297
26
17
27
28
1.98
13763592--13763706
30
3.8
30
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2
126
26
47
4
20
1.69
13764203--13764332
23
5.5
23
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17
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35
4
3
56
1.35
13764268--13764338
25
2.8
26
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6
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36
5
2
54
1.38
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27
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12
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32
5
4
56
1.45
13764356--13764414
25
2.5
24
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10
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33
8
6
50
1.59
13764372--13764420
25
2.0
25
91
0
80
34
8
6
51
1.57
13764576--13764623
16
3.1
15
90
6
69
31
2
2
64
1.16
13764576--13764627
8
6.5
8
82
8
61
30
1
1
65
1.14
13768336--13768369
17
2.1
17
89
10
54
67
0
0
32
0.91
13770123--13770461
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2.8
121
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4
452
21
15
19
44
1.87
13773905--13773935
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13779449--13779654
25
8.3
25
69
13
90
20
24
18
36
1.95
13779558--13779664
25
4.4
25
74
7
94
22
25
20
31
1.98
13781457--13781556
51
1.9
50
82
13
123
46
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19
29
1.73
13783414--13783443
15
2.0
15
93
0
51
30
33
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20
1.94
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20
2.9
19
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0
0
49
1.00
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38
0
11
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1.39
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2.5
26
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0
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35
0
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1.57
13813691--13813743
19
2.8
19
94
2
90
26
0
15
58
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290