Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  178  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57603631--57603703
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2.0
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28
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11
1.64
57618817--57618885
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2.3
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7
88
57
17
13
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1.64
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3.2
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14
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28
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46
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2.0
33
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2
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1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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29
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0
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26
15
28
29
1.96
57654785--57654965
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2.2
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229
27
15
27
29
1.96
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27
6.6
27
83
3
205
26
15
28
29
1.96
57662974--57663129
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
57662970--57663150
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
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1.98
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2
179
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1.96
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30
2.0
30
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6
86
28
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1.85
57671122--57671166
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3.3
14
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29
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0
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43
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0
0
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0.57
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3.2
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2
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29
13
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2.7
30
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18
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100
0
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25
16
12
45
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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108
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15
45
1.84
57683973--57684005
12
2.8
12
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59
24
15
15
45
1.84
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5
11.0
5
75
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17
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77
1.00
57684053--57684109
16
3.7
14
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3
17
1
77
1.00
57685032--57685072
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3.6
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2
9
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27
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0
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72
1.18
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0
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18
2.1
19
85
4
53
7
23
2
66
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57734863--57734906
18
2.4
18
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0
61
15
29
0
54
1.42
57734857--57734924
30
2.3
30
86
0
91
13
26
0
60
1.33
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3.5
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1.92
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0
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20
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2
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28
21
13
36
1.91
57768598--57768647
18
2.8
18
87
0
64
76
6
14
4
1.13
57768594--57768647
6
9.2
6
77
2
56
75
5
14
3
1.12
57768686--57768720
18
1.9
18
88
11
54
57
0
20
22
1.41
57770788--57770845
10
5.7
10
76
11
64
29
27
13
29
1.94
57770788--57770848
20
3.0
20
83
9
79
27
26
13
32
1.93
57783908--57783936
15
1.9
15
100
0
58
75
0
13
10
1.04
57783985--57784030
18
2.5
19
80
19
62
71
2
23
2
1.08
57785414--57785442
13
2.2
13
100
0
58
62
10
0
27
1.28
57785667--57785715
10
4.8
10
80
14
55
40
22
22
14
1.90
57785667--57785715
21
2.4
21
89
3
73
40
22
22
14
1.90
57786031--57786102
30
2.4
29
84
6
90
29
26
12
31
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57787765--57787799
11
3.1
11
84
8
52
74
8
2
14
1.17
57787767--57787813
12
3.8
12
80
13
51
74
6
6
12
1.20
57787790--57787829
19
2.2
19
86
8
57
75
5
7
12
1.18
57788737--57788780
20
2.2
20
84
12
54
77
4
18
0
0.94
57788852--57788882
12
2.6
12
94
0
53
45
16
12
25
1.83
57788885--57788966
30
2.7
31
77
5
87
64
1
20
13
1.34
57793314--57793373
29
2.1
29
87
0
84
41
26
0
31
1.56
57793589--57793624
9
3.9
9
85
7
54
80
2
8
8
0.99
57793589--57793623
10
3.6
10
88
3
54
82
2
8
5
0.91
57794694--57794749
30
1.9
28
85
7
76
53
3
30
12
1.55
57798406--57798436
12
2.6
12
100
0
62
25
16
12
45
1.83
57798484--57798551
5
13.0
5
72
18
50
4
19
2
73
1.13
57798484--57798540
16
3.7
14
82
15
60
5
17
1
75
1.07
57798502--57798551
21
2.4
21
83
10
66
0
20
4
76
0.95
57805999--57806098
30
3.3
30
76
4
103
29
16
28
27
1.97
57817497--57817527
12
2.6
12
100
0
62
25
16
12
45
1.83
57817591--57817631
21
1.9
22
85
5
57
2
17
2
78
0.98
57817593--57817643
25
2.0
26
81
11
61
5
15
1
76
1.07
57818573--57818612
13
3.1
14
86
13
59
12
5
7
75
1.18
57818692--57818730
13
2.7
14
88
11
53
5
7
5
82
0.96
57820334--57820430
30
3.2
30
72
8
99
28
16
26
27
1.97
57822684--57822733
6
8.2
6
81
16
50
2
20
2
76
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57822673--57822743
37
1.9
37
86
11
101
2
18
2
76
1.04
57822669--57822729
16
3.8
16
77
14
63
3
19
1
75
1.03
57823669--57823706
12
3.2
13
85
14
55
13
5
7
73
1.22
57825403--57825505
30
3.4
29
72
7
89
30
16
26
27
1.97
57827763--57827822
5
11.4
5
75
19
52
3
18
1
76
1.00
57827763--57827822
16
3.8
16
75
14
54
3
18
1
76
1.00
57835873--57835922
22
2.3
22
82
3
66
22
24
18
36
1.95
57842083--57842149
12
5.2
12
77
12
53
79
7
2
10
1.04
57842091--57842149
12
4.5
14
87
12
74
77
8
3
10
1.08
57843130--57843187
10
5.7
10
76
11
64
29
27
13
29
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290