Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  66  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20093763--20093795
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1.9
17
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0
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6
12
0
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0.85
20098027--20098422
199
2.0
202
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2
762
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26
25
1.98
20102136--20102194
25
2.3
24
83
13
66
54
0
6
38
1.27
20102433--20102486
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2.9
18
77
2
54
61
1
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25
1.40
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69
0
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27
1.03
20104858--20104886
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0
0
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0
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0
0
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2.2
21
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4
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1.45
20110150--20110384
3
79.7
3
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22
28
1.98
20112006--20112318
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12
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20
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28
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21
20
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20117153--20117212
28
2.2
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11
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26
26
11
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28
2.2
28
91
0
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28
28
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1.91
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29
1.39
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37
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1.38
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11
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2.1
28
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0
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26
2.0
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2.0
32
100
0
130
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30
1.80
20135341--20135390
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2.0
24
88
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64
6
0
30
1.18
20135361--20135419
21
2.8
21
78
12
59
69
8
0
22
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20135466--20135498
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2.1
16
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11
50
69
0
0
30
0.88
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26
2.0
27
85
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74
24
15
22
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1.92
20138215--20138276
32
1.9
32
100
0
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4
30
1.77
20139579--20139682
27
3.9
27
75
7
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37
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19
23
1.94
20141365--20141530
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2.4
71
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1
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40
6
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1.72
20144219--20144321
38
2.7
38
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145
18
20
25
35
1.95
20145333--20145375
15
2.8
16
79
13
54
27
0
25
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1.53
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17
2.5
17
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33
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40
1.74
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19
2.5
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32
22
0
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20
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9
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1.24
20152976--20153011
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18
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54
36
0
5
58
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2.0
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10
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1
16
41
1.58
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15
2.0
15
93
0
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16
0
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46
1.47
20161759--20162048
126
2.3
125
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1
429
31
18
21
28
1.97
20165082--20165519
54
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55
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22
208
47
9
2
40
1.51
20165070--20165565
116
4.3
116
95
0
848
47
9
3
39
1.51
20165960--20165997
18
2.1
18
90
0
58
42
15
23
18
1.89
20167734--20167764
15
2.1
15
93
0
53
70
0
6
22
1.09
20167791--20167840
20
2.4
22
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10
77
40
0
30
30
1.57
20167791--20167842
11
4.9
11
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9
72
42
0
28
28
1.56
20167784--20167842
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1.9
31
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40
0
30
28
1.57
20167791--20167854
31
2.1
31
85
5
85
42
0
26
31
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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1
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44
12
6
36
1.68
20178513--20178595
34
2.4
34
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0
112
42
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7
37
1.72
20179705--20179791
21
4.0
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80
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25
21
14
1.92
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2.3
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0
30
0
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0.89
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22
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72
12
91
38
19
23
18
1.93
20192752--20192881
23
5.8
22
73
14
88
39
19
22
19
1.93
20207981--20208019
11
3.5
11
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56
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25
1.52
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64
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21
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1.9
30
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1.91
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17
1
1
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21
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22
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1.06
20221880--20221932
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17
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100
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11
8
32
1.72
20240408--20240447
14
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14
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0
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1.77
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0
0
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0.91
20246945--20247017
8
9.0
8
76
13
69
27
1
0
71
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20246946--20247121
25
7.1
25
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22
77
29
3
0
66
1.12
20246945--20247116
16
10.8
16
67
14
72
29
3
0
66
1.12
20246956--20247016
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1.9
31
83
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77
24
1
0
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0.92
20247057--20247138
23
3.4
23
72
18
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28
7
0
64
1.20
20247050--20247165
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50
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6
1
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1.28
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25
3.1
25
72
20
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29
7
0
62
1.23
20249495--20249781
137
2.1
137
94
0
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23
18
25
1.97
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26
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26
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22
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34
1.80
20251532--20251639
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2.1
52
91
0
171
37
22
6
34
1.80
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2.1
30
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0
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32
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20
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1.85
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2.1
38
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0
149
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26
10
49
1.74
20262953--20263012
22
2.7
22
80
14
61
58
0
3
38
1.15
20264837--20264864
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
20268036--20268069
17
2.0
17
94
0
59
41
17
2
38
1.65
20268824--20268866
21
2.0
21
81
0
50
9
51
13
25
1.71
20271171--20271212
4
10.5
4
100
0
84
73
0
26
0
0.83
20271974--20272158
43
4.3
43
85
0
244
31
29
17
21
1.96
20272880--20272908
13
2.1
14
93
6
51
55
10
0
34
1.34
20274017--20274079
31
2.0
31
100
0
126
19
15
12
52
1.74
20276234--20276259
12
2.2
12
100
0
52
30
26
7
34
1.85
20277991--20278023
5
6.6
5
100
0
66
39
0
18
42
1.50
20278035--20278154
9
13.6
9
79
5
120
33
0
20
45
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20278235--20278273
19
2.0
20
85
9
55
33
0
7
58
1.26
20279624--20279661
19
2.0
19
100
0
76
47
15
0
36
1.46
20280313--20280422
38
2.8
39
75
6
107
29
26
21
22
1.99
20280861--20280938
38
2.1
38
92
0
129
56
7
5
30
1.49
20280869--20280932
19
3.4
19
67
16
60
56
6
4
32
1.45
20281493--20281523
12
2.6
12
94
0
53
0
25
0
74
0.82
20283395--20283478
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3.2
26
96
0
150
34
5
23
35
1.80
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2
13.5
2
100
0
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0
0
51
1.00
20287854--20287892
19
2.1
18
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4
51
58
5
0
35
1.20
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2.7
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5
153
29
24
16
28
1.97
20288549--20288810
40
6.7
40
69
11
166
29
21
18
30
1.97
20288529--20288957
147
2.8
153
87
5
581
28
21
18
31
1.97
20288853--20288978
40
3.1
40
82
5
155
24
24
20
30
1.99
20288867--20288978
40
2.8
40
87
5
163
22
26
22
28
1.99
20290662--20290704
22
2.0
21
82
13
52
55
9
6
27
1.57
20290999--20291062
22
2.7
24
74
16
62
62
3
3
31
1.26
20291060--20291198
23
6.5
21
72
24
80
56
4
4
35
1.39
20290999--20291126
21
5.9
21
69
20
59
60
3
3
32
1.31
20291106--20291147
15
2.7
15
88
7
57
59
2
2
35
1.23
20291023--20291185
59
2.7
60
83
10
194
58
3
3
34
1.33
20291309--20291356
19
2.5
20
75
3
53
54
2
4
39
1.32
20291576--20291637
26
2.3
26
76
15
63
67
1
3
27
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20296650--20296693
23
1.9
24
90
9
74
54
4
13
27
1.58
20300093--20300126
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
20308108--20308157
26
1.9
26
100
0
100
18
38
16
28
1.91
20312408--20312512
43
2.4
43
85
3
122
23
18
17
40
1.90
20312434--20312538
43
2.4
43
85
0
138
21
21
18
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1.94
20314082--20314121
10
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11
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32
0
0
67
0.91
20314077--20314118
19
2.0
22
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28
0
2
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1.01
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28
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0
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1.76
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2.4
27
94
0
110
20
25
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10
1.84
20314728--20314766
16
2.4
16
86
0
51
71
7
2
17
1.21

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290