Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  6  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1989107--1989171
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2.2
29
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0
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0
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0
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11
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0
0
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22
15
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47
2.4
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83
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36
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2.0
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0
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0
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1.9
25
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2
2
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1.23
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23
2.5
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5
0
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0
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2
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2.7
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29
3.7
30
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17
86
45
12
10
31
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2079639--2079713
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4
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14
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36
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19
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10
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2
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1.43
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90
1.9
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89
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9
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10
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10
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0
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0
0
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2.0
23
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1.73
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352
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16
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0
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3.1
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100
0
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10
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10
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5
5
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27
2.0
25
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15
11
1.44
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53
2.0
53
86
0
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31
12
14
42
1.82
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25
2.9
22
72
12
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43
1
4
50
1.32
2142083--2142155
24
3.1
23
67
11
58
45
1
5
47
1.34
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28
1.9
29
85
7
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33
3
12
50
1.58
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29
2.0
29
100
0
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10
14
22
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18
2.0
18
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54
54
0
2
42
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5
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1
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0
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4.8
28
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18
93
24
16
13
45
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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0
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10
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2
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2
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0
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21
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8
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0
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8
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61
3
3
32
1.27
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45
2.1
45
96
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1
50
1.40
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23
2.0
23
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8
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26
0
2
71
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22
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2
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2.0
28
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0
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5
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1.64
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1.9
153
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0
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12
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0
0
24
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0
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0
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12
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58
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0
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19
2.3
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11
56
65
0
6
27
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
40
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61
0
5
33
1.18
2273444--2273523
18
4.1
20
69
19
60
61
0
5
33
1.18
2273607--2273663
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3
78
36
7
0
56
1.27
2273686--2273741
19
2.8
20
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13
71
39
7
0
53
1.28
2273784--2273834
20
2.6
20
81
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59
37
7
11
43
1.71
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20
7.4
20
73
10
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38
8
14
38
1.77
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59
2.3
60
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190
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13
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0
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0
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44
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585
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100
0
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0
0
16
0.64
2279139--2279265
46
2.8
46
93
0
209
21
21
26
30
1.98
2283512--2283564
13
4.1
13
73
9
54
41
20
1
35
1.64
2287029--2287105
40
2.0
39
85
10
104
38
5
19
36
1.74
2289613--2289675
25
2.6
24
73
14
56
19
25
19
36
1.94
2289629--2289699
25
2.8
25
80
4
63
15
26
21
36
1.93
2289910--2289983
24
3.0
24
72
14
71
22
27
14
35
1.94
2290748--2290790
24
1.9
22
86
13
61
25
0
27
46
1.53
2292941--2292998
24
2.5
23
81
16
66
62
0
5
32
1.18
2293269--2293426
49
3.2
48
94
2
264
31
6
31
30
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2293543--2293621
37
2.1
37
90
0
122
24
18
31
25
1.98
2299761--2299822
18
3.6
18
77
16
69
58
0
6
35
1.24
2299758--2299822
35
1.9
33
84
12
87
56
0
7
35
1.28
2301618--2301728
44
2.5
43
84
4
134
27
19
24
27
1.99
2301697--2301943
46
5.7
45
74
11
187
27
19
20
32
1.97
2312393--2312435
21
2.0
21
82
8
52
23
20
4
51
1.66
2341950--2342030
24
3.4
24
77
13
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49
0
1
49
1.08
2341966--2342004
11
3.4
11
80
13
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51
0
2
46
1.14
2341949--2342029
15
5.2
15
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21
60
48
0
1
50
1.08
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14
2.5
16
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55
46
0
0
53
1.00
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3
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3
100
0
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0
0
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0.92
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27
2.3
27
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11
72
38
0
30
30
1.57
2343734--2343829
39
2.5
39
80
6
108
20
23
28
27
1.99
2348714--2348786
31
2.4
32
78
15
84
56
0
0
43
0.99
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18
2.4
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15
17
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1.90
2351506--2351540
18
1.9
18
100
0
70
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11
20
34
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39
2.0
39
100
0
158
40
10
5
44
1.60
2357394--2357433
21
1.9
21
89
0
62
42
12
12
32
1.80
2364337--2364422
44
1.9
44
88
2
127
39
5
4
50
1.47
2370082--2370149
26
2.8
24
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10
84
47
0
2
50
1.16
2370360--2370402
13
3.2
14
84
15
56
30
0
4
65
1.13
2370396--2370449
21
2.5
22
82
17
69
24
3
3
68
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2370394--2370440
20
2.4
19
83
16
60
23
4
4
68
1.26
2378372--2378418
21
2.2
22
92
3
78
21
38
19
21
1.94
2390548--2390577
3
10.0
3
100
0
60
33
33
0
33
1.58
2395273--2395319
21
2.2
22
92
3
78
21
19
38
21
1.94
2399960--2400108
40
3.7
40
89
5
221
25
20
28
25
1.99
2409839--2409868
13
2.3
13
100
0
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46
13
6
33
1.69
2417720--2417749
5
6.0
5
96
0
51
0
23
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2419173--2419226
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2.5
22
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59
1
0
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2.1
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83
33
5
0
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1.19
2432399--2432441
15
2.9
15
79
3
52
58
0
0
41
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290