Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  279  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89204655--89204714
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1.9
28
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1
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1.19
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0
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1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.9
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89275402--89275484
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2.1
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20
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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Entropy
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54
40
9
9
40
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89418930--89418983
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72
0
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11
1.12
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57
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26
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100
0
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17
2.5
17
81
7
52
74
2
0
23
0.93
89444420--89444457
19
2.0
20
89
5
60
50
13
0
36
1.42
89450080--89450121
11
3.8
11
78
9
50
71
2
2
23
1.10
89454882--89454935
16
3.4
16
78
0
72
38
3
25
31
1.74
89454917--89455010
44
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43
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5
26
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1.79
89457481--89457602
9
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9
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1.30
89457515--89457577
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0
3
58
1.14
89465594--89465669
37
2.1
37
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0
134
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27
5
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1.76
89467377--89467420
3
14.3
3
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4
79
34
0
0
65
0.93
89469551--89469597
21
2.2
22
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3
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21
38
19
21
1.94
89477737--89477799
4
15.8
4
93
0
99
20
1
26
50
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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0
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70
0
3
25
1.03
89479001--89479115
23
5.3
21
70
20
69
65
3
2
28
1.22
89479270--89479312
19
2.1
21
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8
63
55
0
9
34
1.32
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24
2.2
24
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0
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3
7
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1.48
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2.0
95
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0
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11
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1.83
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0
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0
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2
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1.64
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2.7
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3.0
22
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22
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89494311--89494398
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1.9
45
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4
131
11
20
26
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0
50
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2.2
29
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1
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36
1.23
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2.2
20
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0
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4
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1.35
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480
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1.56
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9
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0
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4
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0
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24
0
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24
1.48
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2.1
48
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4.0
25
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16
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25
10
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34
1.90
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26
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25
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16
89
26
11
28
34
1.90
89541276--89541443
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2.2
77
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218
26
12
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34
1.9
34
96
0
123
28
18
6
46
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89553363--89553425
30
2.1
30
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22
1.60
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1.9
26
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0
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18
12
18
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1.75
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6
6.2
6
93
0
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100
0
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11
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0
0
20
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7
4.4
7
95
0
53
16
38
12
32
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290