Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  31  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9974551--9974701
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2.8
53
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205
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16
26
1.97
9982047--9982197
53
2.8
53
87
4
196
29
26
16
27
1.97
9983823--9983882
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2.0
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15
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38
3
1
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1.26
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2.4
22
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2.0
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0
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0
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0.90
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4.7
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20
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2.6
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2
176
20
24
20
35
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5.4
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2
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13
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2.0
50
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186
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19
15
31
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42
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0
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30
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10022519--10022585
22
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75
25
0
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18
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2.6
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1.70
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2.2
45
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1
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25
24
20
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
17
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11
0
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2.3
46
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15
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1.95
10046705--10046898
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1.9
102
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293
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20
22
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1.99
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2.5
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1.99
10046991--10047211
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4.8
44
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24
22
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1.99
10048423--10048531
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2.1
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0
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10049051--10049200
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185
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24
14
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1.9
18
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62
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5
25
1.40
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2
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2
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10
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42
0
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2
1.13
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8
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8
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83
37
0
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1
1.07
10110977--10111073
12
8.2
12
75
17
78
38
0
59
2
1.09
10111045--10111093
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12.2
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91
0
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100
0
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0
0
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2.0
23
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15
2.1
15
100
0
64
15
25
0
59
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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2
60
1.40
10122213--10122255
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3.0
14
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13
52
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6
0
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1.18
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14
77
0
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36
31
9
21
1.86
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2
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2
94
5
67
51
0
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1.00
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2.0
17
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0
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32
5
0
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1.20
10131322--10131385
26
2.6
23
77
15
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3
3
57
1.30
10131323--10131388
24
2.7
24
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4
96
33
3
3
60
1.27
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2.3
23
83
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9
1
58
1.41
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1.9
66
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10
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2.5
45
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4
136
25
19
23
31
1.98
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221
2.5
220
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1
911
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19
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26
1.98
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5.1
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17
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1.97
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19
21
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1.97
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14
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19
19
28
1.96
10138866--10139165
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2.2
135
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32
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19
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1.30
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24
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22
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10
2
57
1.44
10140918--10140992
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9
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0
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31
1.47
10143728--10143768
18
2.3
18
91
0
64
4
51
17
26
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10150250--10150296
24
2.0
23
91
4
76
10
4
36
48
1.57
10177230--10177279
21
2.2
24
86
13
70
66
0
32
2
1.03
10184465--10184522
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19.3
3
85
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82
65
1
0
32
1.03
10198706--10198735
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5.8
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51
80
0
0
20
0.72
10206453--10206600
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33
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10
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1.88
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29
2.0
29
100
0
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32
20
6
40
1.78
10206603--10206671
29
2.4
29
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0
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4
0
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0.93
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17
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59
16
4
0
79
0.90
10218378--10218425
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10
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18
4
0
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2.0
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100
0
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29
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11
35
1.90
10234162--10234293
33
4.0
33
79
5
133
33
21
9
35
1.86
10234283--10234380
29
3.4
29
88
0
133
24
25
14
35
1.93
10234864--10234907
21
2.1
21
95
4
81
34
18
4
43
1.70
10253959--10254010
5
9.6
5
80
19
52
17
3
1
76
1.02
10253961--10254019
25
2.4
25
80
5
66
18
6
1
72
1.15
10255325--10255351
14
1.9
14
100
0
54
18
7
7
66
1.40
10260973--10261021
6
8.2
6
100
0
98
83
0
0
16
0.64
10270817--10270852
6
6.0
6
90
0
54
16
2
2
77
1.00
10271188--10271217
14
2.1
14
100
0
60
36
6
6
50
1.55
10277363--10277553
49
3.8
49
75
8
170
28
23
20
27
1.99
10277371--10277559
50
3.8
51
79
3
172
29
23
19
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10278276--10278357
26
3.2
26
96
0
155
30
6
26
36
1.81
10288189--10288217
9
3.2
9
100
0
58
41
0
0
58
0.98
10290750--10290781
16
2.0
16
93
0
55
78
3
6
12
1.06
10293890--10293942
23
2.3
22
84
12
63
28
3
1
66
1.20
10293890--10293934
11
3.9
11
82
5
54
26
4
2
66
1.22
10300997--10301034
13
2.9
13
96
0
67
18
36
36
7
1.80
10333731--10333814
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
10337956--10338007
25
2.0
26
85
3
70
25
13
23
38
1.91
10339486--10339543
26
2.2
26
93
0
98
36
24
5
34
1.78
10340753--10340947
97
2.0
97
97
0
372
25
9
34
30
1.88
10342272--10342296
11
2.3
11
100
0
50
44
0
0
56
0.99
10344453--10344634
46
4.0
46
91
1
276
39
14
23
23
1.91
10349469--10349575
2
54.0
2
83
1
135
42
0
57
0
0.99
10349841--10349866
4
6.5
4
100
0
52
76
0
0
23
0.78
10351795--10351856
6
10.3
6
100
0
124
0
50
17
32
1.47
10358347--10358393
24
2.0
23
91
4
76
10
4
36
48
1.57
10374954--10375033
38
2.1
38
90
0
124
20
22
28
28
1.98
10375005--10375236
43
5.4
43
90
1
333
13
23
33
29
1.93
10378587--10378617
3
10.0
3
93
6
53
32
0
0
67
0.91
10387948--10387986
19
2.1
19
100
0
78
33
10
15
41
1.81
10393881--10393932
27
2.0
27
84
3
70
67
3
5
23
1.29
10405267--10405291
12
2.1
12
100
0
50
24
16
24
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10409331--10409413
34
2.6
31
77
20
84
65
7
4
22
1.38
10410418--10410466
24
2.0
24
92
0
80
34
20
8
36
1.82
10415820--10415858
16
2.7
15
85
14
55
5
12
5
76
1.11
10416705--10416767
3
21.0
3
100
0
126
33
0
0
66
0.92
10419285--10419344
25
2.4
25
86
5
77
50
0
13
36
1.42
10421301--10422351
206
5.1
206
91
1
1615
30
20
17
32
1.95
10430371--10430401
15
2.1
15
100
0
62
6
38
0
54
1.26
10430445--10430494
15
3.5
14
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42
8
24
26
1.82
10434105--10434167
33
1.9
33
93
0
108
19
15
49
15
1.80
10436232--10436300
20
3.3
21
76
10
61
31
5
17
44
1.72

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290