Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  158  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50936973--50937153
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1.9
21
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1.67
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2.0
30
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1.64
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3
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27
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1.97
51024695--51024850
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27
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27
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1.97
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92
27
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1.97
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2.2
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27
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1.97
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2.3
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37
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18
30
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
38
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25
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1.98
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1.9
16
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1.96
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1.97
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1.96
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30
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1.98
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1.94
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298
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2.6
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29
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3.2
141
92
4
741
29
29
8
32
1.87
51113466--51113917
194
2.4
190
92
4
702
29
29
8
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1.87
51116853--51116917
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1.9
34
100
0
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1.9
27
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36
26
0
36
1.57
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2.0
17
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11
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2.4
11
100
0
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2.6
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1.97
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49
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7
133
28
15
29
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
21
27
26
1.99
51137599--51137821
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253
24
21
27
26
1.99
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177
26
18
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1.98
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2.6
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79
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20
27
25
1.99
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2.0
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29
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3.9
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1.98
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19
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15
3.1
15
73
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55
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16
2
51
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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28
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1.92
51230504--51230547
18
2.4
18
85
7
54
63
0
11
25
1.27
51231772--51232069
133
2.2
133
92
1
499
28
21
19
30
1.98
51231905--51232515
177
3.4
177
89
3
922
28
21
18
30
1.97
51232394--51232735
45
7.7
45
66
14
129
30
20
19
29
1.97
51232367--51232783
133
3.1
133
88
1
602
30
19
19
29
1.97
51244062--51244361
125
2.4
126
84
2
388
38
19
15
28
1.91
51244062--51244365
127
2.4
125
83
2
394
37
19
14
28
1.91
51248780--51248874
22
4.2
22
71
12
75
36
18
22
22
1.95
51248882--51248907
11
2.4
11
100
0
52
46
34
7
11
1.69
51249437--51249582
43
3.4
43
82
10
142
30
25
18
25
1.98
51252592--51252988
48
8.2
48
96
1
695
35
6
26
31
1.81
51257429--51257584
42
3.6
43
76
10
158
23
19
25
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51257426--51257584
86
1.9
85
85
6
223
23
19
25
31
1.98
51257426--51257543
44
2.8
42
81
8
132
22
21
25
31
1.98
51257426--51257592
85
2.0
86
83
8
216
23
18
25
32
1.97
51264816--51264857
21
2.0
21
85
4
57
16
26
0
57
1.40
51266802--51266881
38
2.1
38
85
0
106
28
15
21
35
1.93
51268222--51268301
38
2.1
38
85
0
106
28
15
21
35
1.93
51269640--51269719
38
2.1
38
85
0
106
28
15
21
35
1.93
51271060--51271139
38
2.1
38
85
0
106
28
15
21
35
1.93
51272480--51272559
38
2.1
38
85
0
106
30
13
21
35
1.92
51273899--51273978
38
2.1
38
85
0
106
28
15
21
35
1.93
51275317--51275396
38
2.1
38
85
0
106
28
15
21
35
1.93
51277060--51277110
17
3.1
16
78
16
50
33
3
13
49
1.61
51277082--51277132
24
2.1
24
96
0
93
23
7
15
52
1.68
51282796--51282852
27
2.1
28
83
9
73
36
1
19
42
1.62
51282819--51282858
21
2.0
20
85
5
53
37
0
20
42
1.52
51288073--51288179
41
2.7
40
78
5
110
29
25
21
23
1.99
51290387--51290694
126
2.5
126
87
4
410
26
16
20
36
1.93
51290415--51290735
126
2.5
126
83
5
391
27
17
18
36
1.93
51299519--51299597
25
3.3
25
62
16
67
32
7
29
30
1.85
51299511--51300171
49
13.9
47
93
3
915
32
9
29
28
1.88
51299962--51300053
47
2.2
39
83
16
105
30
10
31
27
1.91
51300290--51300368
37
2.1
37
85
0
104
24
18
30
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51302010--51302065
27
2.1
27
86
0
76
30
16
21
32
1.95
51302047--51302362
27
11.7
27
77
10
193
40
16
9
33
1.81
51302047--51302362
81
3.9
81
78
8
286
40
16
9
33
1.81
51302782--51302846
22
3.0
22
73
8
60
24
23
18
33
1.96
51302945--51303016
32
2.2
32
80
4
74
29
19
22
29
1.98
51306397--51306497
39
2.6
39
84
3
114
25
20
25
27
1.99
51307232--51307291
30
2.0
30
100
0
120
36
16
6
40
1.75
51307469--51307603
18
7.3
18
70
9
74
37
14
11
36
1.82
51307460--51307588
36
3.5
36
68
8
96
37
15
11
35
1.84
51307773--51307881
45
2.4
45
89
0
164
44
19
18
18
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290