Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  261  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84226199--84226369
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93
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0.80
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2.0
51
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14
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1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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60
0
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30
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2.2
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4.3
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30
3
3
62
1.29
84339929--84340019
19
4.9
18
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15
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2
2
67
1.15
84339919--84340019
9
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2.0
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2.0
20
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9
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35
25
25
12
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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2.0
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0
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14
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17
26
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1.9
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25
17
28
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1.9
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2.2
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2
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2.8
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10
156
29
27
22
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84465041--84465086
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11.5
4
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73
0
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10
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1.30
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59
1.35
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35
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1.21
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3
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19
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0
19
0
0.70
84476411--84476453
17
2.6
17
85
7
63
79
0
20
0
0.74
84478146--84478313
40
4.2
40
81
4
187
24
23
26
25
2.00
84480107--84480761
295
2.2
295
81
5
736
40
10
12
35
1.79
84483040--84483081
17
2.5
17
81
11
50
30
9
0
59
1.29
84496874--84496911
6
6.5
6
93
6
69
0
15
0
84
0.63
84496874--84496911
17
2.2
17
95
4
67
0
15
0
84
0.63
84500890--84500928
20
2.0
20
85
10
53
25
5
7
61
1.44
84500932--84500976
17
2.6
17
85
3
63
37
2
2
57
1.23
84501338--84501367
16
1.9
15
93
6
51
90
0
10
0
0.47
84504034--84504079
21
2.2
21
84
0
56
43
0
4
52
1.21
84504136--84504176
19
2.3
17
91
8
64
70
0
29
0
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84505326--84505369
18
2.4
18
85
7
54
34
9
18
38
1.82
84516604--84516658
4
13.0
4
77
11
56
45
0
1
52
1.11
84516620--84516658
9
4.4
9
96
3
71
46
0
0
53
1.00
84516620--84516669
13
3.8
13
84
10
57
44
0
0
56
0.99
84516606--84516681
18
4.3
18
82
11
68
42
0
1
56
1.07
84519431--84521412
664
3.0
664
98
0
3802
27
12
18
42
1.86
84521931--84521961
12
2.6
12
94
0
53
25
0
51
22
1.48
84525806--84525972
27
6.2
26
80
6
172
17
22
22
37
1.94
84525806--84525972
54
3.1
54
87
2
237
17
22
22
37
1.94
84525806--84525972
81
2.0
82
83
10
209
17
22
22
37
1.94
84527313--84527454
75
1.9
76
84
7
191
18
36
21
23
1.95
84533086--84533154
24
2.8
24
80
4
75
31
20
24
23
1.98
84534602--84534633
17
1.9
17
93
6
57
21
9
0
68
1.17
84536845--84536876
6
5.3
6
92
0
55
15
3
0
81
0.82
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23
2.0
23
100
0
94
46
17
8
27
1.76
84545158--84545382
40
5.7
40
85
5
287
24
21
28
25
1.99
84545158--84545415
119
2.2
119
80
6
274
25
21
27
25
1.99
84546767--84546867
44
2.3
44
80
11
111
27
16
17
37
1.92
84547665--84547693
13
2.1
14
93
6
51
55
10
0
34
1.34
84550849--84551111
40
6.6
40
92
1
370
22
21
27
28
1.99
84550849--84551144
40
7.4
40
89
4
324
23
21
27
27
1.99
84553824--84553925
51
2.0
51
90
0
159
32
19
16
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84556653--84556684
15
2.1
15
94
0
55
43
15
28
12
1.83
84558538--84558609
27
2.8
25
87
6
92
16
30
16
36
1.91
84559089--84559122
17
2.1
16
89
10
52
14
0
0
85
0.60
84567549--84567660
43
2.6
43
79
12
131
25
18
25
29
1.98
84573105--84573328
56
4.0
56
84
2
272
29
14
23
33
1.94
84573916--84573961
23
2.0
23
100
0
92
39
13
13
34
1.83
84578639--84578671
13
2.6
13
85
4
50
21
6
36
36
1.78
84583733--84583767
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2.8
13
91
4
54
25
8
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1.86
84587143--84587178
12
3.1
11
92
4
54
69
2
2
25
1.15
84587512--84587822
61
5.2
60
66
15
203
42
1
5
50
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290