Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  280  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
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1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
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20
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1.15
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6
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60
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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30
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5
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50
4
17
27
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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41
13
23
21
1.88
89753152--89753414
92
2.9
91
89
2
391
42
12
23
21
1.87
89753166--89753429
138
1.9
138
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14
23
20
1.88
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2.0
17
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0
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1.50
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27
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1.83
89774588--89774614
14
1.9
14
100
0
54
0
14
0
85
0.61
89808301--89808465
85
1.9
85
95
0
294
44
18
12
24
1.84
89823879--89823919
21
1.9
22
85
5
57
14
4
12
68
1.36
89828816--89828854
21
1.9
20
89
5
60
58
7
0
33
1.26
89836412--89836464
25
2.1
25
100
0
106
9
22
11
56
1.63
89839090--89839133
19
2.2
20
92
4
72
68
2
0
29
1.02
89841129--89841177
26
1.9
26
87
4
73
46
16
8
28
1.75
89844325--89844377
26
2.1
25
82
10
63
28
3
1
66
1.20
89844412--89844450
3
13.0
3
84
10
53
35
0
0
64
0.94
89844407--89844450
21
2.1
21
95
0
79
36
0
0
63
0.95
89844529--89844589
22
2.7
22
87
7
79
32
3
4
59
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89844556--89844594
12
3.3
12
83
16
55
33
0
7
58
1.26
89844641--89844707
26
2.7
25
88
11
102
34
4
1
59
1.26
89844774--89844854
24
3.3
24
71
20
69
28
7
2
61
1.36
89844844--89844937
3
31.0
3
75
12
50
34
4
4
57
1.38
89857002--89857415
90
4.6
90
83
6
464
29
17
17
35
1.93
89859067--89859214
64
2.2
68
78
10
160
31
16
29
22
1.96
89859016--89859262
68
3.8
64
73
10
187
29
15
29
25
1.96
89861135--89861328
44
4.4
44
94
0
334
25
21
27
26
1.99
89862940--89863051
10
10.7
11
67
25
50
33
1
1
63
1.15
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14
3.9
14
81
9
67
32
3
0
63
1.12
89863014--89863042
15
1.9
15
100
0
58
34
0
0
65
0.93
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24
2.5
24
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8
77
32
3
5
59
1.36
89863250--89863284
14
2.3
15
85
14
54
34
5
0
60
1.21
89863256--89863304
14
3.6
14
79
15
59
38
4
0
57
1.18
89863266--89863314
26
1.9
25
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4
71
38
2
2
57
1.22
89863454--89863570
3
38.7
3
78
10
105
34
3
2
59
1.27
89867050--89867194
43
3.4
43
92
2
224
13
22
34
28
1.93
89871703--89871741
16
2.4
16
100
0
78
28
7
15
48
1.72
89873914--89874000
15
5.7
15
70
17
54
71
5
21
1
1.14
89873905--89873970
19
3.7
18
74
13
64
72
10
15
1
1.18
89873929--89873989
23
2.6
23
73
17
54
70
8
19
1
1.21
89876943--89877021
30
2.7
29
80
5
79
54
5
1
39
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89877004--89877045
18
2.3
19
84
12
52
59
0
0
40
0.97
89886515--89886567
22
2.5
20
80
14
61
73
3
1
20
1.08
89888511--89888548
16
2.4
16
90
0
58
26
28
18
26
1.98
89892635--89892682
21
2.4
20
86
6
62
41
6
2
50
1.39
89895536--89895632
50
1.9
50
100
0
194
41
8
15
35
1.77
89897097--89897124
4
7.0
4
100
0
56
25
25
25
25
2.00
89909397--89909468
21
3.8
19
75
15
60
41
1
0
56
1.07
89909397--89909468
20
3.8
20
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41
1
0
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89910416--89910696
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3.0
94
83
7
365
44
5
19
29
1.74
89910417--89910677
92
2.8
93
85
5
350
43
5
20
29
1.75

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          289   290