Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  55  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17218164--17218193
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0
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0
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2.1
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13
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17230761--17230922
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17230764--17230922
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2.5
15
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0
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16
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24
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30
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2.0
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12
100
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42
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0
50
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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5
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17268100--17268133
18
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18
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2.0
152
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10
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2.0
20
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1.98
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1.95
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407
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29
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26
1.98
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25
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26
1.98
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2.2
43
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2.2
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88
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33
0
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64
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59
29
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0
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0
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40
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2.0
23
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0
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19
36
15
28
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
0
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4
0
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1.15
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2.2
21
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2
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34
0
0
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0
0
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0
0
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0
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0
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21
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36
0
0
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17336410--17336460
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0
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17336502--17336536
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1.32
17342013--17342089
39
2.0
39
89
5
120
20
25
29
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17347687--17347879
39
5.0
39
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1
343
21
24
30
23
1.99
17347687--17347879
77
2.5
78
93
1
343
21
24
30
23
1.99
17350160--17350238
33
2.4
33
86
0
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22
29
17
30
1.97
17350181--17350258
33
2.4
33
93
0
129
20
26
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35
1.94
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0
0
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2
554
35
17
19
28
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18
2.0
18
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0
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0
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15
0
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151
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33
1.59
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2.0
30
100
0
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6
74
20
0
8
71
1.12
17386933--17386976
17
2.8
15
78
21
54
63
0
2
34
1.07
17387452--17387565
18
6.3
18
86
5
160
37
16
10
35
1.83
17387453--17387557
35
3.0
35
94
1
183
37
16
11
35
1.84
17387453--17387565
17
6.3
18
87
5
158
37
16
10
35
1.84
17388392--17389008
119
5.2
119
93
0
1081
31
19
16
32
1.94
17388208--17389008
238
3.4
237
93
1
1341
31
19
16
32
1.95
17388208--17389008
357
2.3
347
92
2
1332
31
19
16
32
1.95
17389913--17389964
8
6.9
7
75
16
50
1
15
0
82
0.75
17389913--17389974
25
2.6
25
82
5
74
1
16
0
82
0.75
17389913--17389977
17
4.1
16
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11
80
1
15
0
83
0.73
17389927--17389976
10
4.5
11
75
24
52
2
16
0
82
0.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17395905--17395954
17
2.9
18
76
11
59
64
0
2
34
1.05
17396428--17396541
18
6.3
18
86
5
160
37
15
9
36
1.81
17396429--17396533
35
3.0
35
94
1
183
37
15
10
37
1.82
17396429--17396541
17
6.3
18
87
5
158
37
15
9
37
1.81
17397087--17397136
10
5.0
10
81
13
59
68
2
8
22
1.26
17398475--17398510
18
2.0
18
94
0
63
55
25
13
5
1.60
17399507--17399532
13
2.0
13
100
0
52
30
30
7
30
1.85
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23
2.0
23
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0
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10
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1.74
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15
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0
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28
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2.0
20
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67
0
5
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1.11
17400671--17400727
28
2.1
27
87
9
80
68
0
3
28
1.06
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10
4.9
10
85
9
73
69
2
8
20
1.24
17408407--17408454
20
2.4
20
82
6
62
70
0
8
20
1.12
17410163--17410242
27
3.0
27
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1
144
28
11
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1.91
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50
7.0
50
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3
409
28
25
18
27
1.98
17412694--17412977
151
1.9
150
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0
487
28
25
19
26
1.99
17416777--17416825
5
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5
91
8
82
36
0
0
63
0.95
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49
2.2
49
98
0
205
23
19
9
47
1.78
17420021--17420055
18
2.0
18
88
5
54
68
0
0
31
0.90
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22
3.7
21
76
15
68
40
17
6
35
1.75
17420345--17420430
19
4.9
19
83
16
116
34
16
10
38
1.83
17420358--17420416
31
1.9
31
93
6
102
35
16
8
38
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17420772--17420801
16
1.9
16
93
6
53
70
0
0
30
0.88
17421095--17421166
19
3.9
18
89
7
110
34
15
11
38
1.83
17421088--17421166
35
2.2
37
86
13
121
34
16
10
39
1.82
17421109--17421164
17
3.5
15
88
9
60
35
16
10
37
1.83
17421523--17421791
45
5.9
45
79
7
258
26
26
15
31
1.96
17421531--17421700
89
1.9
89
86
0
241
27
28
13
30
1.94
17421730--17421947
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2.8
78
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0
346
26
23
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2.7
220
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50
69
0
0
30
0.88
17432307--17432340
18
1.9
17
88
5
50
70
0
0
29
0.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290