Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  79  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23963636--23963743
37
2.9
37
95
0
189
25
32
19
23
1.97
23963884--23963948
34
1.9
34
100
0
130
29
26
9
35
1.87
23963915--23964111
48
4.1
48
91
0
313
31
24
6
37
1.81
23973612--23973671
28
2.1
28
100
0
120
10
3
40
46
1.54
23980476--23980522
17
2.8
17
79
20
62
55
6
2
36
1.37
23981119--23981156
18
2.1
18
90
0
58
39
18
7
34
1.80
23981836--23981863
6
4.7
6
100
0
56
50
0
14
35
1.43
23991309--23991455
40
3.6
40
77
4
116
23
28
19
27
1.99
23993389--23993418
15
2.1
15
93
6
53
36
26
6
30
1.82
23995079--23995171
48
1.9
48
86
2
132
22
33
18
25
1.97
23995074--23995341
49
5.5
48
77
4
180
21
29
16
32
1.95
23997056--23997109
24
2.3
24
96
3
101
37
16
16
29
1.91
24003265--24003294
14
2.1
15
93
6
53
30
0
3
66
1.07
24007230--24007272
20
2.2
19
84
12
52
32
6
0
60
1.23
24007502--24007528
6
4.5
6
100
0
54
0
29
0
70
0.88
24014952--24014994
18
2.5
17
81
7
50
39
0
6
53
1.28
24014957--24015012
19
2.8
20
81
10
62
41
0
7
51
1.29
24014966--24015012
21
2.4
18
86
10
58
44
0
4
51
1.21
24032845--24032923
24
3.3
24
66
13
72
44
25
0
30
1.54
24032839--24032934
48
2.0
48
100
0
192
41
25
0
33
1.55
24032941--24032987
5
9.4
5
77
9
51
40
19
0
40
1.51
24033640--24033669
16
1.9
15
93
6
51
0
26
0
73
0.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24033640--24033677
20
1.9
20
84
10
51
2
26
0
71
1.00
24038375--24038431
29
2.0
27
83
6
69
26
14
0
59
1.35
24041793--24041865
31
2.4
31
95
4
130
24
13
17
43
1.86
24043200--24043377
86
2.1
86
100
0
356
32
10
20
37
1.86
24052951--24052982
5
6.4
5
100
0
64
40
0
0
59
0.97
24054254--24054310
15
3.9
15
83
2
80
33
0
14
52
1.41
24054694--24054740
21
2.1
22
92
7
78
12
25
27
34
1.92
24054705--24054754
21
2.4
21
86
0
64
16
30
26
28
1.96
24059452--24059485
17
1.9
18
94
5
61
52
0
0
47
1.00
24062204--24062236
16
2.1
16
94
0
57
42
3
0
54
1.15
24063908--24063941
17
2.0
17
100
0
68
23
5
17
52
1.66
24069719--24069749
14
2.3
14
94
5
55
0
12
6
80
0.89
24071547--24071598
18
2.8
19
78
18
65
21
32
1
44
1.63
24073581--24073648
35
1.9
36
87
3
102
17
26
0
55
1.42
24074621--24074665
24
2.0
24
86
8
67
75
11
8
4
1.17
24075343--24075406
5
12.8
5
94
0
101
60
34
0
4
1.17
24075452--24075479
13
2.2
13
100
0
56
46
17
14
21
1.84
24075800--24075864
32
2.0
32
100
0
130
21
6
24
47
1.73
24077330--24077369
15
2.7
15
92
0
62
30
15
12
42
1.83
24078343--24078434
39
2.3
40
88
1
141
36
17
21
23
1.94
24078803--24078847
14
3.2
14
83
0
63
20
0
33
46
1.51
24078951--24078982
7
4.6
7
92
0
55
25
0
12
62
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24078936--24078990
21
2.5
22
85
2
76
21
0
20
58
1.40
24085687--24085808
42
2.9
42
83
3
147
20
12
32
34
1.90
24087580--24087628
22
2.2
22
100
0
98
26
4
22
46
1.69
24087580--24087691
22
5.0
22
74
14
86
27
6
21
44
1.76
24087540--24087666
68
1.9
68
93
0
218
25
6
23
44
1.77
24087548--24087691
68
2.1
68
88
2
209
27
6
20
44
1.77
24088062--24088107
19
2.4
19
88
3
74
47
15
10
26
1.78
24088091--24088128
14
2.7
14
88
8
51
39
15
5
39
1.70
24088267--24088392
28
4.4
28
69
10
94
34
24
16
23
1.95
24088280--24088389
57
1.9
57
81
7
134
36
23
14
25
1.93
24089940--24089985
24
1.9
25
86
8
69
52
2
0
45
1.13
24092196--24092295
50
2.0
50
98
0
191
20
21
12
47
1.82
24092591--24092641
25
2.0
25
92
0
84
37
17
5
39
1.74
24097261--24097311
25
2.0
25
92
0
84
37
17
5
39
1.74
24098949--24098981
12
2.6
13
90
4
50
45
9
9
36
1.68
24101956--24101989
15
2.3
15
94
0
59
38
41
11
8
1.73
24104988--24105045
19
3.0
19
75
5
71
41
24
12
22
1.87
24104978--24105039
20
3.2
20
76
4
81
38
19
14
27
1.90
24110153--24110212
26
2.4
25
81
8
70
66
1
0
31
1.01
24110299--24110343
23
2.0
23
86
0
63
64
0
4
31
1.13
24117068--24117128
23
2.8
21
73
9
59
39
3
6
50
1.45
24127896--24127968
38
2.0
36
84
10
94
39
4
1
54
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24127896--24128020
58
2.2
59
81
5
148
40
4
4
51
1.42
24127930--24127978
20
2.4
21
83
10
66
40
4
4
51
1.40
24128492--24128538
21
2.2
21
88
0
67
29
21
17
31
1.96
24128660--24128685
11
2.4
11
100
0
52
26
0
7
65
1.20
24128975--24129017
21
2.1
20
86
4
59
32
0
4
62
1.15
24133505--24133645
61
2.2
63
81
6
169
39
4
4
52
1.41
24135568--24135652
19
4.3
20
79
5
93
43
18
7
30
1.77
24137997--24138030
17
1.9
18
94
5
61
14
47
23
14
1.82
24140398--24140439
19
2.3
18
88
8
66
42
9
0
47
1.36
24150058--24150099
2
21.0
2
85
0
57
57
0
0
42
0.99
24150058--24150095
8
4.8
8
96
0
67
57
0
0
42
0.98
24157505--24157546
17
2.5
17
88
0
57
59
9
23
7
1.53
24162314--24162358
22
2.0
22
95
0
81
46
20
4
28
1.69
24170814--24170870
20
2.9
19
82
12
71
52
3
3
40
1.35
24188973--24189132
79
2.0
80
82
8
195
45
8
3
42
1.51
24190406--24190670
103
2.6
104
90
3
417
29
29
20
19
1.97
24190998--24191062
30
2.2
29
81
8
76
30
27
6
35
1.81
24191005--24191062
30
1.9
30
85
0
80
31
24
6
37
1.82
24198012--24198061
26
1.9
26
95
0
91
30
34
24
12
1.91
24197876--24198139
103
2.6
102
90
3
404
29
29
20
19
1.97
24198467--24198530
29
2.2
29
81
10
76
31
26
6
35
1.81
24198474--24198530
29
1.9
30
85
3
80
31
22
7
38
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24201630--24201728
28
3.5
29
81
12
107
29
28
15
27
1.96
24204137--24204276
43
3.3
43
82
2
174
35
17
17
30
1.93
24209682--24209707
13
2.0
13
100
0
52
15
23
30
30
1.95
24223996--24224168
43
4.0
43
69
11
138
24
17
24
32
1.97
24227122--24227160
18
2.1
19
90
4
62
30
7
12
48
1.69
24242838--24242903
13
5.2
12
75
12
53
1
22
6
69
1.19
24242909--24242936
4
7.0
4
100
0
56
25
0
0
75
0.81
24242936--24242965
5
5.8
5
92
7
51
60
0
0
40
0.97
24253666--24253772
54
2.0
54
92
0
178
28
19
14
38
1.90
24256283--24256335
25
2.1
25
82
0
61
60
7
7
24
1.50
24259203--24259270
34
2.0
34
100
0
136
38
11
14
35
1.83
24259462--24260086
212
3.0
210
89
2
934
41
17
18
23
1.90
24263372--24263456
43
2.0
43
97
0
161
41
10
9
38
1.72
24271336--24271375
20
2.1
20
86
9
57
50
7
15
27
1.70
24275117--24275170
27
2.0
27
96
0
99
42
18
24
14
1.88
24275272--24275401
47
2.8
47
87
0
179
20
17
28
33
1.96
24281935--24281999
34
1.9
33
84
3
85
20
26
24
29
1.99
24286617--24286651
17
2.1
17
89
10
54
31
2
0
65
1.07
24286659--24286878
7
31.3
7
69
21
74
34
4
1
59
1.28
24286715--24286747
3
11.3
3
93
6
59
30
0
0
69
0.88
24286764--24286860
51
1.9
51
83
8
126
35
5
0
59
1.19
24286756--24286872
5
23.2
5
69
20
66
35
4
0
59
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24289124--24289674
47
11.6
47
92
1
832
28
29
8
33
1.87
24289371--24289444
25
3.1
25
66
18
75
28
28
8
35
1.86
24289124--24289674
239
2.3
239
93
0
953
28
29
8
33
1.87
24296047--24296154
26
4.2
26
91
2
173
36
23
7
33
1.83
24303104--24303211
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
24329832--24329878
20
2.3
20
92
0
76
25
14
12
46
1.80
24336700--24336753
27
2.0
27
82
7
65
42
5
5
46
1.50
24347965--24348004
20
2.0
20
90
5
62
35
0
2
62
1.09
24351763--24351809
25
2.0
24
87
8
69
34
4
14
46
1.64
24352734--24352774
16
2.6
16
92
0
64
70
0
29
0
0.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290