Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  71  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21538006--21538065
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1.9
32
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12
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3
0
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1.17
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453
2.0
453
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0
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18
28
1.97
21541211--21541273
3
20.7
3
96
3
117
33
0
0
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0.92
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21545099--21545180
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2.6
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0
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24
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43
1.86
21548777--21548834
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2.4
25
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1.11
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4
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1.21
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18
87
0
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3.5
36
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1.94
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2.0
30
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9
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44
5
1
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1.34
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46
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29
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2.0
18
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11
11
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188
2.0
188
100
0
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20
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26
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20
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20
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2.0
298
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0
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0.92
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20
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62
4
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21
2.3
21
79
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26
2
10
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1.39
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3
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3
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2
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1.33
21631711--21631743
17
1.9
17
88
11
50
30
12
6
51
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.6
130
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2
714
31
19
22
25
1.98
21643195--21643816
260
2.4
260
85
2
818
31
20
22
26
1.98
21643720--21644135
88
4.7
88
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2
431
32
19
23
24
1.98
21643720--21643959
44
5.5
44
69
11
141
32
18
22
26
1.97
21643763--21644099
44
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43
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14
161
31
19
24
25
1.98
21645431--21645710
3
93.7
3
68
10
119
29
8
2
59
1.42
21647566--21647600
17
2.2
17
90
10
56
60
0
2
37
1.12
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1
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25
2.3
25
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60
1
0
37
1.07
21649551--21649606
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15
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21
50
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1
0
39
1.08
21654796--21654833
19
2.1
19
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5
51
57
7
0
34
1.28
21654859--21654916
18
2.9
20
80
10
57
60
3
3
32
1.30
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12
2.3
13
94
5
51
34
0
3
62
1.12
21658879--21658933
24
2.2
24
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56
69
3
14
12
1.33
21667243--21667282
11
3.6
11
82
0
53
20
10
10
60
1.57
21667319--21667380
30
2.1
29
82
8
72
25
1
11
61
1.39
21667938--21667970
17
1.9
17
93
0
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81
6
6
6
0.97
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2.0
31
87
9
88
36
0
43
20
1.52
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2.1
110
98
0
444
33
0
43
23
1.54
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30
2.0
31
84
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81
38
0
38
22
1.54
21680955--21680993
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2.3
17
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53
33
2
0
64
1.08
21680955--21681014
19
3.4
17
76
17
50
30
1
0
68
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21680973--21681015
19
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4
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0
0
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19
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12
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30
0
0
69
0.89
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30
2.1
30
93
0
108
26
4
9
58
1.49
21686439--21686546
44
2.4
44
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135
30
23
12
33
1.92
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19
2.1
19
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5
51
68
10
0
21
1.19
21699129--21699176
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3.1
15
93
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2
0
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1.03
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24
2.3
24
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1
0
30
1.01
21699125--21699176
8
6.5
8
84
8
70
67
1
0
30
1.02
21699165--21699206
23
1.9
21
85
9
57
64
2
2
30
1.19
21699329--21699393
25
2.8
24
83
6
80
52
6
7
33
1.55
21699416--21699545
23
5.6
24
73
14
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56
3
4
35
1.35
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2.0
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1
5
33
1.29
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1.70
21712117--21712171
27
2.0
27
96
0
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25
20
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1.75
21715909--21715938
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15
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10
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28
2.7
27
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29
8
2
59
1.40
21724092--21724192
24
4.4
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2
3
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1.28
21727953--21727994
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2.0
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47
2
0
50
1.14
21731564--21731597
18
1.9
18
88
5
52
52
5
0
41
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21732822--21732879
16
3.6
16
76
13
57
13
29
24
32
1.94
21741644--21741698
26
2.1
26
86
10
76
49
1
3
45
1.30
21741702--21741749
24
2.1
22
88
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69
22
6
4
66
1.32
21741703--21741749
23
2.1
21
84
11
58
23
6
4
65
1.33
21741801--21741837
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0
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0
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60
25
0
2
72
0.95
21749290--21749320
12
2.6
12
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45
0
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1.54
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0
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0
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19
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67
74
0
0
25
0.82
21756010--21756068
13
4.5
13
79
8
57
69
0
0
30
0.89
21757870--21757912
6
7.3
6
84
10
54
0
16
2
81
0.79
21758652--21758721
34
2.1
34
100
0
140
28
8
5
57
1.52
21758920--21758964
15
3.1
15
81
6
58
37
0
6
55
1.26
21758921--21758964
13
3.2
13
83
6
52
36
0
6
56
1.26
21759219--21759259
22
1.9
21
85
14
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36
2
4
56
1.34
21765440--21765469
15
2.0
15
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0
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10
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50
1.36
21771617--21771654
18
2.1
18
90
0
58
23
2
5
68
1.23
21771907--21771953
12
3.8
12
78
10
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25
4
0
70
1.05
21775080--21775104
12
2.1
12
100
0
50
60
0
0
40
0.97
21775086--21775128
23
1.9
22
85
4
59
48
4
4
41
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21775786--21775830
23
1.9
24
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13
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48
6
0
44
1.29
21777223--21777248
9
2.9
9
100
0
52
23
11
23
42
1.86
21777298--21777334
9
4.1
9
92
0
65
45
13
10
29
1.77
21778247--21778322
5
14.8
5
75
15
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23
27
11
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1.90
21778257--21778324
26
2.6
26
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0
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26
27
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1.89
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19
2.1
19
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0
0
57
0.98
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2
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2
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0
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0
50
0
1.00
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2.0
21
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1.74
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3
4
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0
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1.82
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0
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26
1.56
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22
2.4
22
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0
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59
7
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23
1.54
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26
2.1
26
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45
1
0
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1.11
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3
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5
0
1.19
21818121--21818183
22
2.8
23
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7
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46
0
0
53
1.00
21824925--21825016
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2.0
47
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0
130
42
18
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32
1.76
21828993--21829017
12
2.1
12
100
0
50
84
0
0
16
0.63
21828971--21829274
86
3.5
86
86
4
409
47
8
11
32
1.70
21829386--21829428
22
1.9
23
85
4
61
62
0
2
34
1.08
21829387--21829455
32
2.3
33
83
14
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56
0
4
39
1.19
21829873--21829921
20
2.5
20
82
0
53
55
6
8
30
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21830518--21830581
13
4.9
13
84
0
92
28
7
28
35
1.85
21830518--21830581
26
2.5
26
89
0
110
28
7
28
35
1.85
21831779--21831816
19
2.1
18
90
5
58
63
2
0
34
1.09
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114
3.7
114
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4
466
30
19
23
26
1.98
21832850--21833252
188
2.1
188
93
0
689
32
18
22
27
1.97
21833032--21833382
113
3.1
112
79
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415
30
19
23
26
1.98
21833404--21833453
17
3.0
17
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2
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34
0
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1.45
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7
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1
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1.58
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11
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35
10
27
27
1.89
21836866--21836957
16
6.2
16
75
20
76
44
14
1
40
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290