Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  16  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5587589--5587628
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0
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1.15
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0
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2.0
17
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0
50
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0
5
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2.3
28
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22
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5607694--5607966
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2.0
138
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22
22
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4.9
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4
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2.9
299
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2
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16
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1.9
26
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8
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1
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5630063--5630131
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111
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120
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0
0
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2.0
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0
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2.6
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11
53
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0
2
35
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5656778--5656811
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2.0
17
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0
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11
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23
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6
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5659276--5659332
3
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3
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0
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5
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1
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50
4
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1.49
5686978--5687070
30
3.2
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19
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16
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0
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2.2
23
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2
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100
0
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0
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11
2.8
11
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0
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1.95
5717793--5718132
174
1.9
175
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13
18
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374
1.9
372
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4
1013
32
13
19
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1.91
5717967--5718415
200
2.3
200
94
0
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12
19
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131
1.9
131
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1
348
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7
7
42
1.60
5725855--5725912
17
3.5
17
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18
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22
13
10
53
1.70
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15
3.3
15
69
10
50
23
11
15
50
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5725843--5725910
32
2.1
32
97
0
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23
13
11
51
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5727559--5727618
29
2.1
29
96
0
111
28
10
10
51
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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180
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18
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1.95
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2.1
25
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0
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0
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0
1
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3.1
19
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15
100
0
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0
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0
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0
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30
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0
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0
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2
1
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1.20
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19
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17
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17
68
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1
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1.23
5787227--5787277
23
2.2
23
100
0
102
33
15
7
43
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5787921--5788035
42
2.7
42
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4
151
26
26
16
30
1.97
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4.8
31
94
0
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26
28
19
25
1.99
5788224--5788352
50
2.5
51
89
2
206
25
20
17
36
1.94
5793823--5794012
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25
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14
117
31
3
3
61
1.31
5793823--5794009
26
7.5
23
72
14
90
31
3
3
60
1.32
5793866--5793991
26
5.0
25
75
13
107
31
4
2
61
1.30
5796304--5796341
18
2.2
18
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53
63
7
2
26
1.35
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3
10.0
3
93
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53
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3
32
0
1.09
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0
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0
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0
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50
0
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0
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12
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0
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0
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1.24
5809474--5809592
38
3.1
38
97
0
220
34
24
10
31
1.88
5810857--5810899
21
2.0
21
95
0
77
53
6
4
34
1.49
5815610--5815634
11
2.3
11
100
0
50
68
8
16
8
1.38
5822627--5822786
52
3.1
52
82
4
205
29
26
18
25
1.98
5824754--5824840
36
2.5
35
77
7
95
22
5
11
59
1.53
5826073--5826124
27
2.0
25
85
7
68
51
7
1
38
1.42
5826072--5826141
25
2.8
24
78
18
70
52
5
1
40
1.34
5831224--5831278
16
3.4
16
90
5
85
36
5
29
29
1.80
5831260--5831347
46
2.0
46
88
8
137
32
5
25
36
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5831486--5831530
15
2.9
15
90
3
63
51
0
0
48
1.00
5833243--5833307
33
1.9
34
84
9
89
46
3
3
47
1.33
5833358--5833385
9
3.1
9
100
0
56
57
0
0
42
0.99
5833368--5833416
23
2.0
24
84
15
64
48
4
0
46
1.20
5833534--5833589
23
2.4
23
88
5
78
50
3
3
42
1.37
5838564--5838710
42
3.3
42
84
8
179
27
27
14
29
1.96
5838591--5838800
47
4.5
48
81
8
179
29
27
14
28
1.95
5838822--5839001
31
5.8
31
93
0
297
26
27
19
26
1.99
5838977--5839105
50
2.5
51
90
5
199
24
22
17
35
1.95
5845117--5845161
15
2.8
16
76
10
56
31
2
0
66
1.04
5845094--5845152
27
2.2
27
81
3
66
30
3
0
66
1.08
5851601--5851638
8
4.8
8
83
9
51
57
0
2
39
1.12
5851600--5851646
24
2.0
24
83
8
60
59
0
4
36
1.17
5851657--5851707
16
3.2
16
75
8
59
68
1
29
0
1.00
5859108--5859145
8
4.8
8
83
9
51
57
0
2
39
1.12
5859107--5859153
24
2.0
24
83
8
60
59
0
4
36
1.17
5860807--5860864
30
2.0
29
83
10
73
50
3
17
29
1.62
5863291--5863706
46
9.0
46
90
3
579
41
13
23
21
1.89
5863298--5863701
92
4.4
92
93
1
650
41
14
23
21
1.89
5864877--5864928
13
3.7
13
74
18
50
15
48
30
5
1.68
5869096--5869144
24
2.0
24
92
0
80
36
10
8
44
1.68
5872244--5872273
11
2.6
11
94
5
51
53
0
0
46
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5875668--5875701
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
5880298--5880331
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
5886347--5886540
99
2.0
99
84
0
253
35
10
13
39
1.80
5886571--5886716
74
2.0
74
97
0
274
32
14
19
33
1.92
5886821--5886871
25
2.0
25
85
7
68
56
7
3
31
1.46
5887261--5887329
30
2.3
30
83
11
81
43
4
2
49
1.37
5887351--5887416
30
2.2
29
78
7
69
46
16
4
31
1.67
5912106--5912370
130
2.0
130
90
1
415
24
27
20
27
1.99
5912434--5913191
132
5.7
132
93
0
1282
30
25
15
28
1.96
5922872--5923373
91
5.5
91
88
2
670
34
19
17
27
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290