Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  20  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6746946--6747461
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2.0
255
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0
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0
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1.86
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6757290--6757343
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0
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22
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1.89
6758497--6758594
49
2.0
49
97
0
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25
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30
1.96
6761159--6761216
21
2.7
22
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5
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72
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20
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0
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2.0
30
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0
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1
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25
1.9
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4
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29
4
4
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1.34
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2.7
15
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11
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48
0
2
48
1.15
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2.2
24
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16
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42
2
2
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6766676--6766764
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2.3
38
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4
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114
2.0
114
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0
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5
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0
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2.2
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10
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1.20
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19
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2
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32
1.24
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27
2.4
27
80
12
71
64
1
4
29
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6797342--6797366
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3
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0
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0
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23
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8
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0
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21
2.2
20
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65
28
0
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65
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15
2.9
15
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38
0
2
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1.10
6803053--6803103
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2.1
25
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10
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3
5
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0
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6803910--6803957
18
2.6
18
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60
37
0
2
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1.09
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1.9
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100
0
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33
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2.0
27
100
0
108
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2.5
26
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3
40
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6822989--6823054
26
2.4
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1
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1.20
6830669--6830709
19
2.2
18
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55
26
0
19
53
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2.1
23
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14
1.94
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11
2.5
11
100
0
56
71
0
0
28
0.86
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3.7
21
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10
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60
6
0
32
1.22
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2.0
17
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59
36
15
0
48
1.45
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5.8
46
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1
297
19
23
14
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1.89
6837291--6837545
91
2.8
92
83
1
323
19
23
15
41
1.90
6837286--6837548
137
1.9
137
84
3
350
19
23
15
41
1.90
6839376--6839436
20
2.9
21
88
11
74
36
16
4
42
1.70
6839392--6839436
20
2.3
20
96
3
83
37
17
4
40
1.70
6839502--6839526
12
2.1
12
100
0
50
48
8
0
44
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13.5
2
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0
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0
0
51
1.00
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2.4
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53
84
0
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10
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148
2.0
148
100
0
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46
19
8
26
1.77
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155
2.8
151
80
9
429
35
14
19
30
1.92
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27
1.9
26
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11
68
47
1
7
43
1.43
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44
1.9
42
87
4
121
46
2
7
43
1.44
6852816--6852849
17
2.0
17
94
0
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8
5
44
1.60
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41
2.1
41
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0
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19
36
1.81
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221
2.0
221
98
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44
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43
1.53
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2.2
31
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8
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1
0
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1.10
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2.1
18
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13
10
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22
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16
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2
13
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1.59
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40
2.3
40
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0
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2
12
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1.53
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30
2.0
31
90
3
95
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0
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29
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1.97
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1.9
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0
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104
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3
417
29
29
20
19
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6885166--6885230
30
2.2
29
81
8
76
30
27
6
35
1.81
6885173--6885230
30
1.9
30
85
0
80
31
24
6
37
1.82
6889680--6889751
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2.3
32
79
11
87
52
8
11
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1.65
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2
100
0
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51
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0
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1.00
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2
1
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1.11
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17
74
14
66
65
2
1
31
1.13
6892995--6893090
28
3.5
27
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16
90
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2
1
31
1.11
6893041--6893102
29
2.1
30
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8
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62
1
3
32
1.20
6893393--6893461
29
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1
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0
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2.1
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1
0
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2.2
37
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0
106
37
0
5
57
1.21
6895294--6895351
18
3.0
20
72
23
61
34
0
5
60
1.19
6895466--6895504
20
2.0
20
84
0
51
33
5
0
61
1.18
6895701--6895780
29
2.6
31
80
5
92
35
15
13
36
1.86
6896262--6896296
12
2.9
12
86
0
52
51
20
5
22
1.68
6904439--6904520
38
2.1
40
95
4
150
25
14
2
57
1.50
6904598--6904643
22
2.1
22
100
0
92
17
8
13
60
1.56
6910189--6910226
18
2.1
19
90
5
60
21
31
2
44
1.66
6912883--6913212
131
2.5
130
85
6
447
52
15
15
16
1.76
6916822--6916850
15
1.9
15
100
0
58
34
0
6
58
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6918363--6918402
19
2.0
20
86
13
57
37
0
0
62
0.95
6918361--6918408
25
2.0
24
95
4
87
37
0
0
62
0.95
6926333--6926368
10
3.5
11
82
17
51
25
0
5
69
1.10
6926333--6926374
20
2.1
20
86
8
59
28
0
4
66
1.12
6934120--6934175
27
2.1
27
83
6
69
42
1
5
50
1.35
6940712--6940756
20
2.2
20
84
7
56
40
6
15
37
1.74
6949284--6949391
26
4.2
25
82
7
126
35
6
20
37
1.78
6949284--6949391
52
2.1
52
87
3
155
35
6
20
37
1.78
6950571--6950601
8
3.9
8
100
0
62
38
25
25
9
1.86
6951020--6951133
27
4.2
27
85
6
151
18
23
23
34
1.96
6951020--6951133
54
2.1
54
93
3
194
18
23
23
34
1.96
6951467--6951514
24
1.9
26
83
8
64
64
0
18
16
1.29
6952211--6952257
18
2.5
19
82
6
60
31
12
8
46
1.72
6955647--6955683
19
1.9
19
89
10
58
37
0
0
62
0.96
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22
2.0
22
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0
70
22
18
4
54
1.61
6965415--6965442
6
4.7
6
100
0
56
35
32
17
14
1.90
6972488--6972537
24
2.1
24
88
0
73
26
44
6
24
1.76
6972692--6972751
18
3.3
18
78
0
66
45
20
6
28
1.76
6972693--6972751
9
6.6
9
84
0
55
44
20
6
28
1.77
6973260--6973312
24
2.1
26
86
6
74
58
9
18
13
1.61
6974456--6974485
15
2.0
15
93
0
51
6
23
20
50
1.71
6976180--6976258
37
2.1
37
90
0
122
25
31
18
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6976375--6976532
49
3.2
48
95
2
273
30
31
7
31
1.85
6976802--6976859
24
2.4
25
80
13
68
32
5
0
62
1.18
6979585--6979621
19
1.9
19
94
0
65
32
18
18
29
1.96
6981637--6981671
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
6981530--6981813
120
2.4
120
90
2
446
44
1
4
48
1.34
6981757--6981791
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
6981757--6981811
15
3.4
16
80
16
53
47
0
1
50
1.11
6982027--6982078
16
3.2
16
97
0
95
42
32
0
25
1.55
6984555--6984602
26
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24
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8
69
64
6
0
29
1.18
6984543--6984631
21
4.1
21
73
17
65
70
6
0
22
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290