Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Gbar_A07 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  164  of  290  ( 34756 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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0
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0
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1.82
53133370--53133837
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1.82
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23
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
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20
26
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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16
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76
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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20
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20
31
1.97
53326949--53327303
45
7.9
44
69
10
209
31
18
21
28
1.97
53327098--53327343
133
1.9
131
83
8
320
30
17
22
28
1.97
53327219--53327334
44
2.6
44
86
4
135
26
18
24
30
1.98
53328268--53328319
3
17.3
3
82
7
52
28
0
5
65
1.16
53336742--53336928
40
4.7
40
93
0
320
22
28
19
29
1.98
53343435--53343558
40
3.1
40
81
4
153
43
29
12
15
1.82
53346635--53346767
57
2.3
57
94
2
232
38
10
24
27
1.88
53358736--53358784
24
2.2
23
82
10
57
44
6
4
44
1.47
53363136--53363190
19
2.9
19
94
2
94
36
16
9
38
1.80
53363142--53363198
19
3.2
19
90
7
75
38
14
10
36
1.80
53363309--53363347
21
1.9
20
84
5
51
10
2
15
71
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53363546--53363739
45
4.3
45
82
1
228
26
28
12
31
1.93
53363554--53363723
89
1.9
89
87
0
250
28
29
12
29
1.93
53363753--53364046
78
3.8
78
86
1
419
26
23
19
31
1.98
53372639--53372671
17
1.9
17
88
11
50
69
0
0
30
0.88
53372639--53372672
18
1.9
17
88
5
50
70
0
0
29
0.87
53372964--53373054
35
2.5
37
91
8
150
36
15
10
37
1.83
53372964--53373054
19
4.9
19
92
8
161
36
15
10
37
1.83
53381315--53381724
95
4.4
93
85
10
498
33
8
29
29
1.86
53381315--53381726
47
8.8
47
85
9
515
33
8
29
29
1.86
53381370--53381675
45
6.7
39
84
12
125
33
7
28
30
1.85
53381841--53381917
36
2.1
36
90
4
120
23
19
31
25
1.98
53383124--53383385
39
6.7
39
84
11
331
24
21
27
26
1.99
53383124--53383385
79
3.3
79
87
8
351
24
21
27
26
1.99
53383124--53383385
118
2.2
117
86
7
352
24
21
27
26
1.99
53386786--53387213
49
8.9
47
93
2
651
31
8
29
30
1.87
53387332--53387410
37
2.1
37
90
0
122
24
18
31
25
1.98
53388437--53388496
29
2.1
29
96
0
111
38
0
21
40
1.54
53390887--53391037
51
2.9
52
77
9
155
28
26
17
27
1.97
53397439--53397479
20
2.0
20
95
0
73
9
26
41
21
1.84
53398270--53398412
52
2.7
52
81
6
164
30
23
18
27
1.97
53401418--53401442
12
2.1
12
100
0
50
16
8
16
60
1.58
53401762--53401819
30
1.9
30
96
0
107
31
13
29
25
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53402201--53402420
47
4.7
47
81
10
231
28
18
29
23
1.98
53402155--53402420
47
5.7
46
78
13
228
28
18
28
23
1.98
53406858--53406895
19
2.0
19
100
0
76
52
15
10
21
1.72
53407060--53407119
25
2.4
25
77
2
59
55
20
1
23
1.53
53408033--53408078
19
2.4
19
85
3
56
69
4
2
23
1.17
53407954--53408190
120
1.9
124
80
8
281
47
11
5
35
1.63
53408280--53408328
25
1.9
26
91
4
82
67
4
0
28
1.09
53408876--53408925
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2.1
24
82
14
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56
2
4
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1.30
53410343--53410402
31
1.9
31
90
6
95
21
13
11
53
1.71
53410345--53410416
31
2.3
30
83
9
83
23
11
12
52
1.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290