Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  231  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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1
54
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.72
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20
2.1
21
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4
61
27
0
4
67
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75431228--75431412
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2.1
87
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34
11
9
44
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1.9
55
90
0
169
37
9
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46
1.62
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2.9
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11
11
45
1.76
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2.1
28
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12
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36
1
1
60
1.17
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1.76
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80
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101
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1.76
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40
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13
34
1.76
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121
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0
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80
77
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287
42
8
13
35
1.75
75440021--75440103
17
4.6
17
75
10
58
71
0
24
4
1.06
75440034--75440103
18
3.8
18
75
3
68
72
0
21
5
1.05
75443944--75443995
26
2.0
27
81
11
63
21
7
13
57
1.61
75447305--75447390
24
3.5
24
76
3
82
26
16
27
29
1.97
75458700--75458736
19
1.9
19
88
0
56
43
0
5
51
1.24
75458700--75458758
30
2.0
30
89
0
91
44
0
3
52
1.17
75458718--75458780
25
2.5
25
80
14
76
42
1
4
50
1.32
75458767--75458882
62
1.9
60
84
6
155
39
4
5
50
1.44
75463099--75463147
24
2.0
24
85
14
66
36
16
6
40
1.73
75467012--75467076
29
2.2
30
83
8
80
47
1
23
27
1.60
75472429--75472464
15
2.4
15
100
0
72
36
33
8
22
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75473501--75473646
31
4.8
31
78
9
129
43
19
11
25
1.84
75476741--75476781
20
2.0
20
85
0
55
48
17
2
31
1.60
75477253--75477391
46
3.0
45
65
15
104
18
9
20
51
1.74
75477253--75477449
92
2.1
92
89
0
304
19
10
20
49
1.78
75478589--75478809
46
4.8
46
74
14
154
22
28
19
28
1.98
75478639--75478809
94
1.8
92
83
7
229
22
28
19
29
1.98
75479451--75479509
23
2.7
22
80
15
68
40
1
6
50
1.39
75479458--75479500
22
1.9
23
90
4
70
39
2
6
51
1.42
75482790--75482819
5
6.0
5
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0
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3
0
16
0.85
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6.0
5
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0
51
80
3
0
16
0.85
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864
2.0
864
99
0
3435
38
15
15
30
1.88
75485874--75485918
10
4.3
10
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17
56
71
0
0
28
0.87
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13
3.5
13
79
20
58
68
0
0
31
0.90
75485872--75485928
23
2.4
23
88
2
87
68
3
0
28
1.06
75488755--75488794
15
2.7
15
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7
64
0
17
0
82
0.67
75488752--75488794
13
3.2
13
87
12
61
0
16
0
83
0.64
75493152--75493198
18
2.6
18
82
0
58
14
21
36
27
1.93
75495794--75495823
5
6.0
5
92
0
51
80
3
0
16
0.85
75496337--75496398
25
2.4
26
84
12
76
17
24
20
37
1.94
75496477--75496536
24
2.5
24
86
2
84
15
16
21
46
1.83
75505754--75505821
30
2.3
30
100
0
136
20
38
25
16
1.92
75506435--75506487
23
2.3
23
96
0
97
35
24
3
35
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75511862--75511909
21
2.3
22
79
17
57
45
4
4
45
1.41
75512541--75512583
11
4.0
11
84
6
61
20
46
4
27
1.71
75512541--75512582
21
2.0
22
90
4
68
21
47
2
28
1.63
75513115--75513189
18
4.2
18
88
6
107
33
22
12
32
1.91
75513121--75513191
36
2.0
36
94
0
124
35
22
11
30
1.89
75520883--75521028
40
3.7
40
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7
172
25
27
22
24
2.00
75524047--75524071
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2.1
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0
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0
24
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0
0
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0
0
41
0.98
75524319--75524348
14
2.2
14
94
5
53
60
0
0
40
0.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290