Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  92880876

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   

This is table  61  of  290  ( 34756 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18748624--18748648
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100
0
50
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0
0
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0.80
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19
2.0
20
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30
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18764275--18764317
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2.3
19
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0
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39
13
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39
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18778215--18778246
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6
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3
3
75
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18784927--18784986
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2.0
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0
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18785010--18785044
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1.9
18
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31
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20
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18785766--18785859
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18785841--18785892
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5
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3
40
1.72
18785849--18785895
16
2.9
16
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0
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31
23
2
42
1.66
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10
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10
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19
69
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2
2
30
1.18
18787153--18787301
30
4.9
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70
20
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65
2
2
30
1.18
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19
4.5
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15
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18787225--18787270
21
2.1
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69
2
6
21
1.22
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20
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27
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0
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1.23
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18787578--18787646
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2.4
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1
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0
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0
0
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2.4
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3
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1.9
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95
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18793794--18793845
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3.2
16
83
5
70
38
3
26
30
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18802753--18802878
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3.0
42
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7
134
45
13
18
23
1.84
18802826--18802878
20
2.6
20
82
8
63
39
15
20
24
1.91
18802849--18802887
20
2.1
19
85
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53
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20
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1.90
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33
0
2
64
1.07
18808807--18808857
17
2.9
17
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2
57
33
1
3
60
1.26
18810440--18810477
17
2.2
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10
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1.20
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2.0
21
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1.24
18811628--18811669
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50
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0
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0
0.92
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16
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1.95
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10.4
144
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10
1623
32
20
16
30
1.95
18813721--18813859
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1.9
73
90
0
224
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17
33
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18813871--18814237
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418
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21
16
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1.96
18813712--18814540
151
5.6
147
80
11
892
32
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16
30
1.95
18814179--18814295
58
2.0
59
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5
166
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24
18
24
1.98
18814241--18814544
71
4.1
73
85
7
393
33
19
16
30
1.94
18814490--18814703
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2.4
88
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14
28
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6.2
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11
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0
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0
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18815571--18815609
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51
0
17
0
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18815574--18815611
19
2.0
20
94
5
69
0
15
0
84
0.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18822954--18822988
4
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4
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0
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42
2
25
28
1.69
18824856--18824900
17
2.6
18
89
10
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51
8
8
31
1.64
18825503--18825554
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2.3
23
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0
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11
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2.1
22
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31
17
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18831459--18831496
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2.0
19
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0
2
44
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1
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1
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0
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0
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51
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2.1
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10
1.03
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27
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1.99
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2.0
88
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29
17
25
27
1.97
18887151--18887324
31
5.8
31
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175
29
17
25
27
1.97
18887349--18887513
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46
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29
14
26
29
1.95
18887443--18887557
42
2.7
43
86
4
162
31
13
26
28
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18902304--18902395
46
2.0
46
100
0
184
21
21
26
30
1.99
18905038--18905118
29
2.7
30
76
5
74
48
11
6
34
1.64
18905787--18905879
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2.0
47
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35
1.82
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2.2
18
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51
2
0
46
1.14
18916432--18916478
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51
2
2
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1.25
18917465--18917513
14
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50
38
0
2
59
1.09
18917471--18917529
26
2.3
26
82
5
66
44
0
1
54
1.10
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11
5.2
11
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1
1
48
1.21
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22
64
19
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2
5
55
1.37
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2.2
31
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0
82
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2
1
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18931342--18931386
22
2.0
23
86
4
65
57
2
2
37
1.23
18938005--18938031
13
2.1
13
100
0
54
29
14
14
40
1.86
18939656--18939713
30
1.9
30
89
0
89
25
6
12
55
1.61
18939794--18939834
18
2.2
20
86
8
59
21
0
12
65
1.25
18943985--18944033
26
1.9
25
91
4
80
30
12
14
42
1.82
18951831--18951870
20
2.0
21
85
5
55
45
0
10
45
1.37
18956506--18956706
44
4.5
44
72
13
153
21
24
22
30
1.99
18956574--18956663
47
1.9
47
90
2
146
21
21
22
35
1.96
18956553--18956740
44
4.2
43
72
12
173
21
22
20
34
1.97
18956620--18957062
88
5.1
88
89
1
631
20
24
20
34
1.96
18956862--18956994
43
3.1
43
63
17
103
22
21
20
36
1.96
18962830--18963359
88
6.0
88
87
2
704
33
20
23
21
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18962830--18963359
178
3.0
175
86
2
702
33
20
23
21
1.97
18962830--18963359
266
2.0
264
86
2
733
33
20
23
21
1.97
18963245--18963490
134
1.8
135
86
2
361
32
19
24
22
1.97
18965039--18965121
14
5.9
15
71
10
52
32
3
2
61
1.26
18966490--18966519
14
2.1
14
93
0
51
73
0
0
26
0.84
18967575--18967624
25
2.0
24
84
3
64
56
0
0
44
0.99
18970252--18970479
114
2.0
114
99
0
447
36
17
11
34
1.87
18970909--18970966
20
2.9
21
77
15
68
17
29
32
20
1.95
18971762--18971900
52
2.6
51
85
5
170
30
23
17
28
1.97
18975535--18975577
5
8.6
5
80
10
52
0
18
4
76
0.95
18975898--18975940
21
2.0
22
90
4
70
48
18
9
23
1.76
18976476--18976531
29
1.9
29
92
0
94
21
35
25
17
1.95
18976477--18976539
29
2.2
29
88
0
90
25
36
22
15
1.94
18977721--18977810
28
3.2
27
80
4
99
32
23
24
20
1.98
18977916--18977980
28
2.3
28
94
0
112
30
7
27
33
1.85
18978227--18978258
8
4.0
8
91
0
55
3
25
25
46
1.67
18985611--18985700
28
3.2
27
80
4
99
32
23
24
20
1.98
18985810--18985870
28
2.2
28
93
0
104
31
8
26
34
1.86
18990615--18990663
18
2.7
18
78
9
55
65
2
28
4
1.22
18993365--18993391
6
4.5
6
100
0
54
85
0
0
14
0.61
18994254--18994398
48
3.0
48
90
4
229
40
19
4
35
1.73
18995406--18995434
8
3.8
8
95
4
51
41
48
0
10
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19003168--19003201
14
2.3
14
90
10
50
41
0
2
55
1.15
19004603--19004739
28
4.9
28
82
0
121
34
20
21
24
1.97
19004643--19004741
28
3.5
28
86
2
128
34
23
21
21
1.97
19004596--19004740
56
2.6
56
82
3
166
33
21
20
24
1.97
19004748--19004838
28
3.2
28
87
0
119
32
20
19
26
1.97
19004675--19004812
73
1.9
73
84
3
188
34
22
21
21
1.97
19004647--19004838
101
1.9
101
81
6
237
33
21
21
23
1.97
19004928--19004996
28
2.5
28
85
4
77
31
20
13
34
1.91
19005212--19005304
46
2.0
46
95
0
168
36
8
15
39
1.78
19006406--19006436
16
1.9
16
93
0
53
48
6
16
29
1.70

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290